生物信息学/生物多样性
外观
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本部分侧重于广阔的概念,而对有用的技术细节则相对较少。我应该把这部分移到最后(在我决定如何处理当前第四部分的主题之后),尽管这会破坏叙述。
我对整个种群的计算机模型了解不多(相对而言),但这无疑属于计算生物学,绝对应该包含在这里。
第一章将解释序列的差异,这些差异使生物体能够在不同的环境或不同的化学底物上繁衍生息。
第二章将讨论观察到的生物体复杂性与其基因组复杂性之间的关系。
第三章讨论了全基因组分析如何得出结论,即所有已知生命形式都起源于一个共同的祖先。这里将对我们如何得出这一结论,以及我们对这种祖先生物的了解进行一些讨论。如果篇幅允许,我可能会添加一章关于地球上生命的起源。
第四章不言自明。
第五章将讨论全基因组分析如何让我们得出结论,叶绿体和线粒体源于真细菌内共生体。
第六章主要致力于与发育相关的基因的计算研究,特别是与在酵母等单细胞生物中发现的同源基因的比较。
第七章讨论了测量有效种群大小的方法,以及有效种群大小在生物体基因组的真实多样性方面意味着什么。如果种群遗传学教科书最终完成,我希望将大部分内容从那里迁移过来。
第八章将第七章的讨论扩展到一个特殊的案例,即种群在有限的基因接触下分裂成多个群体。