生物物理学/吸收

观察光吸收时，定义为<出射强度></入射强度>。

吸光度也可以用比尔-朗伯定律的公式表示
$A=\epsilon cl$

基本分光光度计设计。图中显示了棱镜，但更常见的是使用衍射光栅。

这个公式展开是吸光度 = 消光系数 × 浓度 × 光线穿过样品的路径长度。消光系数通常通过将模拟所有蛋白质的三个氨基酸的消光系数加起来来计算（色氨酸、酪氨酸和胞嘧啶）。由于公式中单位的抵消，吸光度本质上是一个无量纲的值：{{吸光度 = (<1></摩尔 × 厘米>) × 摩尔 × 厘米}}。我们可以使用专门设计用于测量吸收的光度计或分光光度计来测量吸收。

我们可以计算未折叠蛋白质的比例，这基本上是计算未折叠蛋白质的概率。在这种情况下，未折叠（变性）蛋白质的比例可以写成如下
$f_{d}={\frac {A_{max}-A}{A_{max}-A_{min}}}$
这相当于由于展开而引起的吸收变化除以所有蛋白质变性时观察到的总变化。

肌红蛋白暴露于不同量的变性剂（例如尿素或盐酸胍）时的吸收曲线。由于血红素暴露于溶剂，吸收减少。

肌红蛋白的吸收曲线，带有肌红蛋白变性或仍处于其天然状态的比例指示器。

类似地，保持折叠或处于其天然状态的蛋白质比例为
$f_{n}={\frac {A}{A_{max}-A_{min}}}$,
这是特定浓度下的吸收 A 相对于观察到的总吸收变化。请注意，f_d 和 f_n 的总和为 1。变性蛋白质与天然蛋白质比例的比率是平衡常数。平衡常数 (K_eq) 可以写成
$K_{eq}={\frac {f_{d}}{f_{n}}}$

回想一下，熵写成：$S=k_{B}*ln(\Omega )$

因此，变性蛋白质和天然蛋白质之间概率的差异写成：$S=k_{B}*ln({\frac {\Omega _{d}}{\Omega _{total}}})-k_{B}*ln({\frac {\Omega _{n}}{\Omega _{total}}})$

如果我们将玻尔兹曼常数移到括号之外，并认识到总变化的重数将抵消，我们将得到以下公式：$S=k_{B}[ln(\Omega _{d})-ln(\Omega _{n})$ 鉴于自然对数的代数性质，该公式可以重新排列为如下所示：$S=k_{B}*ln({\frac {\Omega _{d}}{\Omega _{n}}})$

回想一下，焓写成：$\Delta S*T$ 所以$\Delta H=k_{B}*T*ln({\frac {\Omega _{d}}{\Omega _{n}}})$

然而，这表明即使变性蛋白更多，变性蛋白也是不利的。为了纠正这一点，我们只需添加一个负号，以便最终公式显示为：$\Delta H=k_{B}*T*ln({\frac {f_{d}}{f_{n}}})$