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生物实验室技术/细胞分离

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细胞分离

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细胞分离是一种标准程序,用于根据细胞在离心机中不同的分离方式来分离亚细胞器。细胞器在离心机中根据密度、形状和大小分离。细胞核通常是第一个在离心机中沉淀的细胞器。

细胞分离中最重要的设备是离心机。离心机是一种高速旋转的设备,对旋转的物体施加向心力。离心机中的所有粒子都会感受到相同的力,但密度较大的粒子会在液体中移动得更快,并以比密度较低的粒子更小的力沉淀下来。

离心加速度(或向心加速度)通常用重力加速度的倍数表示。例如,如果离心机施加的力与重力施加的力相同,则表示为 1 G。如果它施加的力是重力的 10 倍,则表示为 10 G。相对离心加速度(通常称为相对离心力)可以使用公式 RCF= (r X RPM2 X (2π)2 * (100/36))/(10002 X g) 计算,其中

  • r = 样品距离心机中心的半径,以厘米为单位
  • RPM = 每分钟转数
  • g = 重力常数 (9.8 m/s2)

此公式通常简化为 RCF = 11.19 X r X (RPM/1000)2

如果您的离心机无法获得指定的 RCF,则可以通过更长时间离心来弥补。例如,如果一个程序要求以 10,000G 的 RCF 离心 60 秒,但您的离心机只能获得 9,000 G,则可以通过离心 67 秒来弥补。确定所需补偿时间的公式为:tr = (ts X RCFs)/RCFmax,其中

  • tr = 您离心机所需的时间
  • ts = 说明书中规定的时间
  • RCFs = 说明书中规定的 RCF
  • RCFmax = 您的离心机可以获得的最大 RCF

差速沉降

细胞器的分离是可能的,因为粒子往往以不同的速率沉降。有几个因素决定沉降速率。
  • 密度:在所有其他条件相同的情况下,粒子密度越大,沉降速度越快。然而,如果粒子的密度与样品中液体的密度相同,则它根本不会沉降。但是,如果粒子比液体介质密度低(例如,油脂和脂类放置在水中时),它会移动到介质的顶部。
  • 尺寸:在所有其他条件相同的情况下,粒子越大,沉降速度越快。如果两块尺寸不同但密度相同的岩石从船上掉下来,较大的岩石往往会更快沉没。这是因为有更多的质量(假设密度相同)可以受到重力的作用。较大的质量更容易克服水的摩擦并更快下沉。这并不意味着重力对不同的质量作用不同。这只是另一种描述它所经过的介质作用的方式。一根羽毛会比一袋羽毛掉得慢。然而,在真空中,它们会以相同的速度下落。
  • 粘度:液体介质的粘度(或厚度)会减缓沉降速度。如果两个粒子的尺寸和密度比较接近,并且只有很小的差异,则可以通过增加液体介质的粘度来将它们分离。

此过程允许分离细胞核、线粒体和细胞膜。

试剂
分离缓冲液
  • 250 mM 蔗糖(约 4.28g 在 50 mL 中)
  • 20 mM HEPES(pH 7.4)
  • 10 mM KCl(0.0373 g 在 50 mL 中)
  • 1.5 mM MgCl2
  • 1 mM EDTA
  • 1mM DTT
  • 蛋白酶抑制剂(1X 浓度)
  • 注意:仅在使用时添加 DTT 和蛋白酶抑制剂!
实验室设备
  • (1) 10 厘米培养皿
  • (3) 1.5 毫升 Eppendorf 管(管子的确切数量取决于所需的馏分)
  • (1) 25 Ga 针头
  • (1) 1 毫升注射器
  • (1) 冰块容器(孵育)
  • (1) 一套微量移液器
  • (1) 超声波清洗器
  • (1) 离心机,能够
   --- 720 G (for nuclear fraction) 
   --- 10,000 G (for mitochondrial fraction)
   --- 100,000 G (for cell membrane fraction)

操作方法

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  1. https://tfhub.dev/google/experts/bert/wiki_books/2
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