构建 Beowulf 集群/计算并行化/GNU R

在本节中，我们将看到使用 snow 包在 R 计算平台（类似于 Matlab 的统计计算）中进行并行化的示例，该包可以使用 MPI 或 PVM 分发作业。在本小节中，我们将只看到 R+PVM 的用法。

请注意，为了在 R 中安装包，需要 R 的开发包。无论如何，我刚刚安装了 R 存储库中可用的所有 R 包（类似于这样：http://cran.es.r-project.org/bin/linux/redhat/fedora9/x86_64，不言而喻，这可能因您的发行版、机器架构和国家代码而异）。

您需要在主节点和从节点上安装 R 库 snow 和 rpvm。如果您没有，R 会让您创建 PVM 集群对象，但随后在您尝试执行作业时会冻结。

在 R 中

> library('snow')
> library('rpvm')
> cl<-makePVMcluster(count=2,names=c('node0','node1'))
> clusterCall(cl, function() Sys.info()[c("nodename","machine")])
[[1]]
nodename machine 
"node1" "x86_64" 

[[2]]
nodename machine 
"node0" "x86_64"