化学信息来源/SIRCh/网络化学数据库分类

SIRCh：精选化学互联网资源

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通用（所有类型的化合物）

PubChem 关于 PubChem

• PubChemSR（搜索和检索）工具（由 Junguk Hur 开发：从工具部分下载 zip 文件；仅限 Windows）。(关于 PubChemSR)
• 维基百科关于 PubChem 的条目

ChemDB，加州大学欧文分校 ChemDB (关于 ChemDB)

ZINC（用于虚拟筛选的商业化可用化合物）(关于 ZINC)

化学结构查找服务 (CSLS)：一个数据库定位服务 (关于 CSLS)

• CSLS 镜像站点

ChemIDplus（美国国家医学图书馆）(关于 ChemIDplus)

ChemFinder（剑桥软件；需要插件进行子结构搜索）(关于 ChemFinder)

Chemspace (关于 Chemspace)

ChemSpider（ChemZoo）(关于 ChemSpider)

eMolecules（以前称为 Chmoogle）(关于 eMolecules)

Fisher Scientific (关于 Fisher)

ChemExper 化学词典 (关于 ChemExper)

Query Chem (关于 Query Chem)

生成的小分子化学宇宙数据库 (关于生成数据库)

专利分析免费数据库 (关于专利分析免费数据库)

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二维结构可搜索数据库

化学结构查找服务 (CSLS)：一个数据库定位服务 (关于 CSLS)

• CSLS 镜像站点

ChemIDplus（美国国家医学图书馆）(关于 ChemIDplus)

ChemFinder（剑桥软件；需要插件进行子结构搜索）(关于 ChemFinder)

有机合成（需要插件进行子结构搜索）(关于有机合成)

eMolecules（以前称为 Chmoogle）(关于 eMolecules)

WebReactions (关于 WebReactions)

Fisher Scientific (关于 Fisher)

分子性质和类药性计算（Molinspiration）(关于计算)

SRC 指针文件子结构搜索（Syracuse Research Corporation）(关于 SRC 指针文件)

ChemExper 化学词典 (关于 ChemExper)

Query Chem (关于 Query Chem)

PubChem（在此页面上使用 Sketch 选项）(关于 PubChem)

KEGG 配体数据库 (关于 KEGG)

BindingDB；绑定数据库（马里兰大学生物技术研究所）(关于 BindingDB)

Sigma-Aldrich 化学数据库 (关于 Sigma-Aldrich)

ChemMine（加州大学河滨分校植物细胞生物学中心）(关于 ChemMine)

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反应数据库

有机合成（需要插件进行子结构搜索）(关于有机合成)

WebReactions (关于 WebReactions)

合成方案（波士顿大学化学方法和库开发中心）(关于合成方案)

ChemSynthesis 化学数据库

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特定类别的化合物

聚糖数据库 (关于聚糖数据库)

有机合成（需要插件进行子结构搜索）(关于有机合成)

LipidBank (关于 LipidBank)

LIPIDAT（脂类中间相和晶体多晶型转变的热力学和相关信息）(关于 LIPIDAT)

HIC-Up，异源化合物信息中心，乌普萨拉 (关于 HIC-Up)

BRENDA，综合酶信息系统 (关于 BRENDA)

CAZy，碳水化合物活性酶 (关于 CAZy)

Metlin 代谢物数据库 (关于 Metlin)

金属蛋白数据库和浏览器 (关于金属蛋白数据库)

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药物相关数据库

PubDock; 对接 PubChem 用于发现（印第安纳大学） (关于 PubDock)

ChemBank (关于 ChemBank)

美国国家癌症研究所发育治疗项目 (关于美国国家癌症研究所发育治疗项目)

• 研究性药物 - 化学信息
• DTP 数据搜索
• COMPARE 数据库和癌症研究分析工具

协作药物发现 数据库 (关于 CDD 数据库)

分子性质和类药性计算（Molinspiration）(关于计算)

Pharmabase：细胞生理学和药理学数据库 (关于 Pharmabase)

美国和欧洲市场上的生物制药产品 (关于生物制药产品)

ChemMine（加州大学河滨分校植物细胞生物学中心）(关于 ChemMine)

国家药物代码目录（美国）（美国食品药品监督管理局药物评价与研究中心） (关于国家药物代码目录)

DrugBank（阿尔伯塔大学） (关于 DrugBank)

MEDPHYT（药用植物数据库） (关于 MEDPHYT)

细胞色素 P450 药物相互作用表（印第安纳大学 - 普渡大学 - 印第安纳波利斯分校） (关于细胞色素 P450 药物相互作用表)

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疾病相关数据库

HIV/OI/TB 治疗数据库（美国国家过敏和传染病研究所艾滋病部门） (关于治疗数据库)

治疗靶点数据库 (关于治疗靶点数据库)

美国国家癌症研究所发育治疗项目 (关于美国国家癌症研究所发育治疗项目)

NIH DTP 癌症细胞系活性预测（印第安纳大学） (关于 NIH DTP 癌症细胞系数据库)

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物理性质、光谱等

NIST 化学手册（美国国家标准与技术研究院） (关于 NIST 化学手册)

电子结构计算原子参考数据（美国国家标准与技术研究院） (关于原子参考数据)

NDRL/NIST 溶液动力学数据库（美国国家标准与技术研究院） (关于 NDRL/NIST 溶液动力学数据库)

IUPAC-NIST 溶解度数据库（由国际纯粹与应用化学联合会汇编和评估的数据） (关于 IUPAC-NIST 溶解度数据库)

物理性质数据库（PHYSPROP）（锡拉丘兹研究公司） (关于 PHYSPROP)

BindingDB；结合数据库（马里兰大学生物技术研究所） (关于结合数据库)

SOLV-DB（来自国家制造科学中心的溶剂数据） (关于 SOLV-DB)

Infotherm 热物理性质数据库（FIZ Chemie Berlin） (关于 Infortherm 热物理性质数据库)

联合专家物种系统，JESS（用于复杂水环境中化学物种热力学和动力学建模的工具） (关于 JESS)

PDSP K_i 数据库 (关于 PDSP K 数据库)

Bordwell pKa 表（DMSO 中的活性）（威斯康星大学） (关于 Bordwell pKa 表)

化学动力学数据库（美国国家标准与技术研究院的气相反应数据） (关于化学动力学数据库)

Chem_xSeer（宾夕法尼亚州立大学）（化学动力学） (关于 Chem_xSeer)

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材料安全数据表（MSDS）

MatWeb，可搜索的材料数据表数据库 (关于 MatWeb)

CCOHS 网页信息服务 (关于 CCOHS)

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光谱和分离数据库

有机化合物光谱数据库，SDBS（日本国立先进工业科学技术研究所 (AIST)） (关于 SDBS)

NMRShift DB (关于 NMRShift DB)

glycoSCIENCES.DE (关于 glycoSCIENCES.DE)

SUGABASE，碳水化合物核磁共振数据库 (关于 SUGABASE)

生物磁共振数据库，BioMagResBank，BMRB (关于 BioMagResBank)

SPECARB，碳水化合物的拉曼光谱 (关于 SPECARB)

EUROSPEC，国际光谱数据库 (关于 EUROSPEC)

Chirbase，手性色谱分子数据库 (关于 Chirbase)

I-ChemiSt - 质谱和核磁共振数据库 (关于 I-ChemiSt)

木葡聚糖的质子核磁共振谱 (关于木葡聚糖的质子核磁共振谱)

部分甲基化的醛糖醇乙酸酯的 GC-EIMS 谱图 (关于 GC-EIMS)

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晶体学数据库

美国矿物学家晶体结构数据库 (关于美国矿物学家 CS 数据库)

生物大分子结晶数据库 (关于生物大分子结晶数据库)

印第安纳大学分子结构中心 (关于 IU MSC)

晶体学开放数据库，COD (关于 COD)

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毒性和环境数据库

美国国家毒理学计划（美国卫生与公众服务部）(关于 NTP)

Envirofacts 主化学整合器 (EMCI)（美国环保署）(关于 Envirofacts)

TOXNET，毒理学数据网络（美国国家医学图书馆）(关于 TOXNET)

CAMEO 化学品（美国国家海洋和大气管理局）(关于 CAMEO)

EXTOXNET，扩展毒理学网络 (关于 EXTOXNET)

ECOTOX（美国环境保护署）(关于 ECOTOX)

杜克博士的植物化学和民族植物学数据库 (关于杜克博士的数据库)

环境归宿数据库（锡拉丘兹研究公司）(关于环境归宿数据库)

CCOHS 网页信息服务 (关于 CCOHS)

SOLV-DB（来自国家制造科学中心的溶剂数据） (关于 SOLV-DB)

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生物分子数据库

Entrez，生命科学搜索引擎（美国国家生物技术信息中心）(关于 Entrez)

BRENDA，综合酶信息系统 (关于 BRENDA)

CAZy，碳水化合物活性酶 (关于 CAZy)

NetPhosK 1.0 服务器 (关于 NetPhosK)

KEGG 配体数据库 (关于 KEGG 配体数据库)

BioMeta 数据库（CMBI）(关于 BioMeta 数据库)

ChEBI，生物学中化学实体（EMBL-EBI，欧洲生物信息学研究所）(关于 ChEBI)

CEBS，化学物质对生物系统的影响（NIEHS，美国国家环境健康科学研究所）(关于 CEBS)

聚糖数据库 (关于聚糖数据库)

PDB，蛋白质数据库 (关于 PDB)

OWL，复合蛋白质序列数据库（涵盖 SWISS-PROT、PIR、GenBank 和 NRL-3D）(关于 OWL)

UniProt (关于 UniProt)

SCOP，蛋白质结构分类 (关于 SCOP)

CATH，蛋白质结构分类 (关于 CATH)

iHOP，蛋白质上的超链接信息 (关于 iHOP)

核酸数据库（罗格斯大学：关于核酸的三维结构信息的存储库）(关于核酸数据库)

DisProt - 蛋白质无序数据库 (关于 DisProt)

人类蛋白质参考数据库 (关于人类蛋白质参考数据库)

Flexweb；生物分子和网络柔性的分析 (关于 Flexweb)

国家化学实验室蛋白质数据库（印度浦那）(关于蛋白质数据库)

人类代谢组数据库 (关于人类代谢组数据库)

Metlin 代谢物数据库 (关于 Metlin)

IntAct（蛋白质相互作用数据库） (关于 IntAct)

DIP 相互作用蛋白质数据库 (关于 DIP)

BOND 生物分子对象网络数据库 (关于 BOND)

SitesBase (关于 SitesBase)

BioGRID (关于 BioGRID)

NAViGaTOR (关于 NAViGaTOR)

MINT 分子相互作用数据库 (关于 MINT)

Binding MOAD (密歇根大学) (关于 Binding MOAD)

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代谢途径

BiGG (虚拟人类代谢网络) (关于 BiGG)

MetaCyc 代谢途径百科全书 (关于 MetaCyc 百科全书)

KEGG 途径 (关于 KEGG 途径)

C@ROL 下的生化途径数据库 (BioPath) (埃尔兰根大学) (关于生化途径数据库)

LIPID MAPS (脂质代谢物和途径策略) (关于 LIPID MAPS)

途径相互作用数据库 (关于途径相互作用数据库)

Reactome, 一个经过整理的生物途径知识库 (关于 Reactome)

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支持 Web 服务的生物科学数据库

myGRID (关于 myGRID)

bioMOBY (关于 bioMOBY)

TeraGrid 生物门户网站 (关于 TeraGrid 生物门户网站)

生命科学网关 (关于生命科学网关)

开放科学网格上的 GADU VO (关于 GADU VO)

KEGG API (关于 KEGG API)

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期刊

PubMed Central (PMC) (关于 PubMed)

PubMed Central (英国) (关于 PubMed Central (英国))

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精选商业数据库

化学文摘社 (关于 CAS 数据库)

AurSTORE 数据库 (Aureus Sciences) (关于 AurSTORE)

BioPrint (Cerep) (关于 BioPrint)

DrugMatrix (Iconix Pharmaceuticals) (关于 DrugMatrix)

ChemBioBase 套件 (Jubilant Biosystems) (关于 ChemBioBase)

激酶知识库 (KKB) (Eidogen-Sertanty) (关于 KKB)

Biopath.Explore (关于 Biopath.Explore)

KiNET 蛋白质组学数据库 (关于 KiNET 蛋白质组学数据库)

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其他数据库

医学主题词，MeSH (美国国家医学图书馆) (关于 MeSH)

化学缩略词数据库 (由印第安纳大学化学图书馆维护) (关于化学缩略词数据库)

量子化学常用术语和缩略语词汇表 (Karl K. Irikura) (关于词汇表)

QCLDB II – 量子化学文献数据库 (关于 QCLDB II)

CCCBDB 计算化学比较和基准数据库 (美国国家标准与技术研究院) (关于 CCCBDB)

MedChem/Biobyte QSAR 数据库 (波莫纳学院) (关于 QSAR 数据库)

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查找其他化学数据库

Sung Kwang 的化学信息学主页

生物物理化学数据库 (威斯康星大学) (关于生物物理化学数据库)

NIST 数据网关 (关于 NIST 数据网关)

NIST 科学和技术数据库 (美国国家标准与技术研究院) (关于 NIST 科学与技术数据库)

NIST 物理实验室物理参考数据 (美国国家标准与技术研究院) (关于 NIST 物理实验室物理参考数据)

数据和性质计算网站 (伊利诺伊大学芝加哥分校热力学研究实验室) (关于性质计算网站)

NIOSH 数据库和信息资源 (美国国家职业安全与健康研究所) (关于 NIOSH 数据库)

有关其他化学数据库（包括商业来源），请参见“化学信息/数据库”部分

• 化学家链接 (利物浦大学)
• 的“化合物，分子”部分Chemdex (谢菲尔德大学)，以及
• 的“化学信息学链接和数据集”部分Cheminformatics.org.

有关生物信息学数据库，请参见

• OBRC；在线生物信息学资源集] 或

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