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石油设施产生一些致命的废水问题。露天矿也导致水酸化（查找一些 SA 示例）。露天采矿会导致从表土营养物质倾倒导致溪流富营养化。

石油污染

原油泄漏是最严重的污染源，石油的可燃性、对动植物的毒性以及石油的审美效应使其成为严重的污染物。在海洋环境中，污染的主要来源有两个。一个是炼油、运输、油轮清洗和其他意外泄漏造成的慢性影响。第二个来源是大量石油在事故中丢失的急性事件。石油可以通过涂层和窒息直接杀死生物，并且可以通过接触或摄入杀死生物。水溶性有毒化合物可能对鱼类和无脊椎动物致命，还会导致鱼类敏感的卵和幼虫形态的破坏。破坏鸟类身体绝缘。石油可能对食物链有影响，如果一个主要猎物或捕食者物种受到影响。受慢性漏油影响的水域可能具有较低的物种生物多样性和氧气浓度波动。石油可能抑制浮游植物的光合作用。极地地区最容易受到漏油的威胁，因为低温会减缓石油的分解，而极地水生生物往往具有很长的生命周期。珊瑚礁也处于漏油的严重威胁之下，因为它们恢复缓慢，受影响的珊瑚礁可能会被侵蚀。许多清理技术旨在清理潮间带以造福旅游业，但损害了生态系统的其他部分。乳化剂和粉笔使石油污染成为底栖生物和公海的危险，而海滩刮除会造成巨大的生物破坏。

多氯联苯。这是一组存在于油漆、油墨和无碳复写纸中的有机物质。这些物质持久且溶于脂肪。它已在食物链的高营养级中被发现，并影响海鸟的代谢和防水性。日本受到多氯联苯严重影响的人群患有皮肤疾病。

富营养化

大量氮和磷进入地表淡水是富营养化的主要原因。在不受影响的生态系统中，磷是稀缺的，是生态系统中物种种群增长的限制因素。大量磷输入水生生态系统可能会导致水生大型植物大量繁殖，之后氮可能成为限制因素。水中的养分耗尽后，这些大型植物开始死亡和腐烂，导致水生生态系统内出现厌氧条件。此过程导致受影响的生态系统动物群发生变化，通常导致生物多样性降低。