普通遗传学/分子进化
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当重组是位点特异性的时，它只能发生在同源性的特定区域。
最初被称为“杂种重组”，非同源重组即使在同源性很少甚至没有的情况下也能发生。 转座子能够进行非同源重组。
在同源染色体排列后，每条 DNA 的一条单链断裂并侵入另一条 DNA。连接酶等酶将交叉的链连接起来，两个双螺旋交换。
霍利迪中间体将以两种方式之一解决：产生修补双链体或产生拼接双链体。
在同源染色体排列后，一条 DNA 的一条单链被切开并复制。复制的 DNA 取代了原始链，该链现在从双螺旋体中垂下，被称为须。须侵入同源双螺旋体并取代该 DNA，该 DNA 被切除。须被连接到新的双螺旋体。分支迁移随之而来，从那里，该模型与霍利迪模型相同。
该模型得到了 Rec A 和 Rec BCD 发现的支持。Rec BCD 是一种具有 DNA 解旋酶活性的大肠杆菌蛋白，能够进行单链切开。这将使它能够形成梅塞尔森-拉丁模型的特征“须”。Rec A 能够包被暴露的 ssDNA 并将其整合到 dsDNA 中，这将在梅塞尔森-拉丁模型中须侵入同源物期间发生。当编码 Rec A 和 Rec BCD 的基因被敲除时，大肠杆菌不会发生重组。
PRDM9 是一种锌指蛋白。甲基化组蛋白 3 的赖氨酸 4。在这个过程中，它招募酶来产生双链 DNA 断裂。由于 PRDM9 是多态的，它可以在不同的位点促进 DNA 切割。锌指是常见的蛋白质结构基序，其特征是通过锌离子稳定其折叠。大多数 DNA 结合蛋白具有锌指基序。
Ruv (repair UV radiation) AB 促进分支迁移。Ruv C 结合霍利迪连接并切割交叉链。