普通遗传学/转录
转录是将DNA中的遗传信息转化为RNA的过程。转录机制可以用6个步骤（原核生物中是5个步骤）简单地描述。
- 要转录的DNA片段被参与转录的蛋白质识别。
- DNA碱基对之间的氢键断裂，DNA双螺旋“解开”。
- 互补的RNA碱基与现在暴露的DNA碱基结合。
- RNA聚合酶将RNA碱基连接在一起，形成一条mRNA链。
- 原始DNA链和新RNA链之间形成的氢键断裂。
- 在真核生物中，新的RNA链被进一步加工并移动到细胞质中。
要转录的DNA片段称为转录单位，至少包含一个基因。如果这个基因编码蛋白质，那么RNA转录产物称为信使RNA或mRNA。该基因还可以编码核糖体RNA (rRNA)、转移RNA (tRNA) 或核酶。
启动子位于基因的上游。启动子的末端是转录起始位点，即要转录的DNA序列开始的地方。终止序列停止转录。在原核生物启动子中，只有两个区域往往是保守的，一个称为Pribnow盒的位点，位于基因上游10 bp处，以及一个位于基因上游35 bp处的位点。-35位点（共有序列：TTGAC）是RNA聚合酶结合的地方，它首先在Pribnow盒（共有序列：TATAAT）处熔化链。
没有特定的保守或共有序列来表征原核生物终止序列。然而，它们通常是回文：从中心对称点，序列与其自身互补。序列的转录形成了一个折叠成“发夹”二级结构的RNA转录物。发夹“阻塞”了聚合酶。
Rho依赖性终止需要一种称为Rho的酶，它紧随转录。当RNA聚合酶由于发夹结构而暂停时，Rho利用其解旋酶样功能从DNA上移除RNA转录物。在没有Rho的情况下，终止序列之后通常是一系列A核苷酸。由于A和U之间的分子间力相对较弱，因此从DNA链上移除转录物所需的能量更少。
原核生物RNA聚合酶覆盖约60 bp。它具有解旋酶样活性，这意味着它能够解开DNA链。核糖核苷酸进入RNA聚合酶，并与编码DNA链的核苷酸形成氢键。聚合酶催化最后一个3'羟基之间的氢键形成
大肠杆菌RNA聚合酶由具有四个亚基的核心组成：β、β'和两个α亚基。加入一个负责结合位点识别的σ蛋白，形成了一个功能性的全酶。
由于原核生物缺乏细胞核和RNA加工，原核生物能够进行“耦合”转录，即在DNA聚合酶完成从DNA模板合成mRNA之前，核糖体就从mRNA开始合成蛋白质。
RNA Pol I位于核仁，转录某些rRNA。
RNA Pol II位于细胞核，转录mRNA和大多数SnRNA。
RNA Pol III位于细胞核，转录tRNA、某些rRNA和一些SnRNA。
典型的真核生物Pol II启动子具有位于基因上游75 bp处的CAAT盒（序列：GGNCAATCT）和位于上游25 bp处的TATA或Hogness盒（序列：TATAAA）。然而，RNA Pol II不能直接与启动子结合。需要一个完整的转录因子复合物来与Pol II结合，然后聚合酶才能与DNA结合。这种转录因子复合物被称为预起始复合物。每种细胞类型都有其自身的特征性转录因子，导致同一基因组的不同表达。
真核生物还具有组织特异性的增强子（上调基因表达）和沉默子（下调基因表达）。同源二聚体激活蛋白对增强子序列具有高亲和力。激活蛋白募集一个蛋白质复合物，该复合物发挥两个功能：（1）RNA Pol II与增强子位点结合，以及（2）DNA折叠，使RNA聚合酶“着陆”在增强子上调表达的基因上。然后，聚合酶转录该基因。增强子可以距离其上调表达的基因数千个碱基对。
在聚腺苷酸化切割位点，切割和聚腺苷酸化（CPA）复合物被募集并与RNA Pol II结合。这允许切割并减缓RNA Pol II。切割后转录的RNA侵入DNA双链体并形成一个“R环”，这进一步阻碍了RNA Pol II的速度。Xrn2核酸外切酶附着在5'端并降解转录物。SETX解旋酶充当“鱼雷”，以捕获暂停的RNA Pol II，所有组分释放。