免疫学/免疫系统的器官
免疫系统的器官分布在全身。它们被称为淋巴器官，因为它们是淋巴细胞的家园，淋巴细胞是一种小的白细胞，是免疫系统中的关键角色。
免疫系统器官分为两组。
- 初级（中枢）--未成熟淋巴细胞发育的器官
- 胸腺
- 骨髓
- 次级（外周）--抗原定位的组织，以便能够有效地暴露于成熟淋巴细胞
- 淋巴结
- 阑尾
- 派氏斑（胃肠道）
- 扁桃体
- 腺样体
- 脾脏
- MALT（Mucosal-Associated Lymphoid Tissue）
- GALT（肠道-Associated Lymphoid Tissue）
- BALT（支气管/气管-Associated Lymphoid Tissue）
- NALT（鼻-Associated Lymphoid Tissue）
- VALT（外阴-Associated Lymphoid Tissue）
注意：一些来源将阑尾、小肠派氏斑、扁桃体和腺样体归入 GALT。
胸腺（来自 θυμος，thumos，希腊语中的疣状突起）是 T 细胞成熟的部位。T 细胞在这里变得具有免疫活性；也就是说，它们发展出能够对外国入侵者发动有效免疫反应的能力，而不会攻击宿主自身的组织。胸腺位于心脏上方，位于纵隔。胸腺在儿童时期最大，随着年龄的增长开始显著缩小。胸腺本身包含两个叶，每个叶包含许多小叶，通过称为小梁的结缔组织隔膜彼此分离。每个小叶被分成一个内部髓质（几乎没有未成熟的胸腺细胞）和一个外部皮质（有大量未成熟的胸腺细胞）。在胸腺中，许多不同的 T 细胞（通过体细胞基因突变产生，如下所述）暴露于 MHC/Ag 和 MHC/自身抗原。如果它们没有对 MHC/Ag 反应，它们就会因为无效而被破坏（正选择）。另一方面，如果它们确实对 MHC/自身抗原反应，为了阻止它们变成对抗自身组织的叛逆性自身免疫反应，它们就会被破坏（负选择）。只有 20 个未成熟胸腺细胞中只有 1 个才能成功通过此筛选过程并成为功能性 T 细胞。树突状细胞、巨噬细胞和上皮细胞散布在髓质和皮质中；特殊的胸腺上皮护士细胞包围着皮质中胸腺细胞的簇。
重症肌无力是一种自身免疫性疾病，身体会产生抗体，对抗突触后神经肌肉接头处的乙酰胆碱受体。在高达 25% 的 MG 病例中，存在胸腺肿瘤（胸腺瘤）；这种肿瘤发展的确切原因尚不清楚。此外，切除胸腺瘤会阻止疾病的进展；这值得进一步研究，因为抗体是由血浆 B 细胞而不是 T 细胞释放的，但 T 辅助细胞可能介导自身免疫。
二氏综合征是一种先天性胸腺缺乏，会导致感染增加和免疫系统下降（尤其是胸腺缺乏会导致细胞介导反应迟缓）。
骨髓（medulla ossea）是小鼠和人类 B 细胞成熟的部位。B 细胞经历正选择和负选择，类似于胸腺中 T 细胞的成熟过程。骨髓也是造血的部位，即从祖细胞发展出无数的血细胞。鸟类中 B 细胞成熟的部位是法氏囊，B 细胞因此而得名。骨髓中白细胞、红细胞和血小板发育的组织（即造血部位）被称为髓样组织。
白血病是骨髓癌，会导致白细胞（WBC）异常生成。
- 急性白血病是美国儿童最大的杀手；它是由骨髓中未成熟白细胞过度增殖引起的，阻碍了功能性 WBC、RBC 和血小板的生成。
- 慢性白血病是骨髓中相对成熟（但异常）的白细胞过度增殖。
- 淋巴细胞白血病是淋巴样细胞（T 细胞、B 细胞、自然杀伤细胞、树突状细胞）的过度增殖。
- 髓样白血病是髓样细胞的过度增殖（所有非淋巴样血细胞类型都是从髓样祖细胞干细胞产生的）。
细胞外液从毛细血管床流入组织；从这些组织进入淋巴毛细血管，淋巴毛细血管随着骨骼肌的运动而“泵送”到淋巴结。淋巴结的副皮质区含有 T 细胞，中心区含有生发中心，其中含有 B 细胞。APC 和抗原从组织进入淋巴管，最终到达淋巴结，在那里它们可以暴露于 T 细胞和 B 细胞群体。这使得反应更快，因为 T 细胞和 B 细胞的许多特异性组合能够驻留在全身的几个地方（淋巴结），而不是依赖抗原和淋巴细胞在组织本身的随机相遇。
脾脏在发育的第二和第三孕期充当造血部位，在此之前，长骨尚未完全发育。在成年人中，脾脏充当死亡红细胞分解的部位（寿命为 120 天）。因此，脾脏肿大（脾肿大）可能会发生在镰状细胞性贫血或某些感染中。白髓靠近动脉进入脾脏的部位，是淋巴细胞驻留和降解的地方。中央红髓是 RBC 分解的部位。白髓区域有一个中心部分，其中 T 细胞驻留在PALS 或动脉周围淋巴鞘，并且 B 细胞环（或冠）包围着 PALS。
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