MINC/软件开发/EZMINC/MincifiedTools
外观
非线性微分同胚配准工具,主页: http://picsl.upenn.edu/ANTS/ 基于版本1.9的MINCIFIED版本可以读取.mnc文件,如果输出扩展名是.xfm,它将为正向和反向变换生成MINC样式的xfm文件。注意非线性部分存储在一个单独的文件中,后缀为_grid_0.mnc(从xfm文件引用)
用于手动分割解剖图像的视觉工具,主页: http://www.itksnap.org 基于版本2.0.0的MINCIFIED版本
- 源代码: http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-minc-src2.tar.gz
- 32位Debian软件包(自包含,不需要minc/netcdf/hdf): http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Linux-i686-fixed-minc.deb
- 64位Debian软件包(自包含,不需要minc/netcdf/hdf): http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Linux-x86_64-fixed-minc.deb
- 32位Mac OS X软件包(自包含,不需要minc/netcdf/hdf): http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Darwin-i386-fixed-minc.dmg
警告:如果您使用源代码,请升级到最新版本的二进制软件包或编译EZminc版本r73或更高版本。之前版本中存在一个错误,导致由于层间规范化而偶尔会损坏带有标签的minc文件。
基于版本2.2.0的MINCIFIED版本
- 源代码: http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.2.0-with-minc.tar.bz2
- 64位Ubuntu 11.04软件包(自包含,不需要minc/netcdf/hdf): http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.2.0-20110504-Linux-x86_64.deb
注意:由于神经学和放射学符号之间的差异,mincified版本将无法正确显示nii文件(左右交换)。
非线性配准工具,主页: http://elastix.isi.uu.nl/
- 示例Mincified源代码: http://www.cim.mcgill.ca/~dante/code/elastix-4.3_minc.tar.gz
注意:ElastiX v4.3必须使用ITK 3.14编译。此外,ITK 3.14本身必须使用CMake变量ITK USE REVIEW设置为ON,ITK USE REVIEW STATISTICS也设置为ON。请参阅 手册,以获取详细的构建说明。