MINC/软件开发/EZMINC/Mincified 工具
外观
非线性微分同胚配准工具,主页:http://picsl.upenn.edu/ANTS/ 基于版本 1.9 的 MINCIFIED 版本可以读取 .mnc 文件,如果输出扩展名为 .xfm,它将生成 MINC 样式的 xfm 文件以进行正向和反向转换。请注意,非线性部分存储在具有后缀 _grid_0.mnc 的单独文件中(从 xfm 文件中引用)
用于解剖图像手动分割的可视化工具,主页:http://www.itksnap.org 基于版本 2.0.0 的 MINCIFIED 版本
- 源代码:http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-minc-src2.tar.gz
- 32 位 Debian 包(自包含,不需要 minc/netcdf/hdf):http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Linux-i686-fixed-minc.deb
- 64 位 Debian 包(自包含,不需要 minc/netcdf/hdf):http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Linux-x86_64-fixed-minc.deb
- 32 位 Mac OS X 包(自包含,不需要 minc/netcdf/hdf):http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Darwin-i386-fixed-minc.dmg
警告:如果使用源代码,请升级到最新版本的二进制包或编译 EZminc 版本 r73 或更高版本。在先前版本中修复了一个错误,该错误导致标签为 minc 文件偶尔因切片间归一化而损坏。
基于版本 2.2.0 的 MINCIFIED 版本
- 源代码:http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.2.0-with-minc.tar.bz2
- 64 位 Ubuntu 11.04 包(自包含,不需要 minc/netcdf/hdf):http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.2.0-20110504-Linux-x86_64.deb
注意:由于神经学和放射学符号之间的差异,mincified 版本将无法正确显示 nii 文件(左右交换)。
非线性配准工具,主页:http://elastix.isi.uu.nl/
- 示例 Mincified 源代码:http://www.cim.mcgill.ca/~dante/code/elastix-4.3_minc.tar.gz
注意:ElastiX v4.3 必须使用 ITK 3.14 编译。此外,ITK 3.14 本身必须使用 CMake 变量 ITK USE REVIEW 设置为 ON 以及 ITK USE REVIEW STATISTICS 也设置为 ON 来编译。请参阅手册以获取详细的构建说明。