跳转到内容

MINC/Scripts

来自维基教科书,自由的教科书

这些脚本都可以从packages下载。

volrot 将绕体积中心旋转 MINC 体积。此脚本通常用于解决 MINC 体积的定向问题。例如,要绕 x 轴旋转 90 度,可以使用以下命令:

  volrot -x_rotation 90 input.mnc output.mnc

nlpfit 执行一个体积到另一个体积的分层非线性拟合。这是通过使用逐渐精细的非线性网格函数将一个图像拟合到另一个图像来完成的。mni_autoreg 包中的 minctracc 用于执行拟合。默认拟合配置文件包括 16mm、8mm 和 4mm 拟合。作为拟合的一部分,体积也会使用逐渐缩小的 FWHM 核进行模糊,这是为了降低特定级别拟合陷入局部极小值的可能性。

可以通过创建拟合配置文件并使用 -config_file 选项更改默认拟合配置文件。以下是一个示例(默认拟合配置文件):

@conf = (
    {'step'         => 16,
     'blur_fwhm'    => 8,
     'iterations'   => 3,
     },
   
    {'step'         => 8,
     'blur_fwhm'    => 4,
     'iterations'   => 2,
     },
   
    {'step'         => 4,
     'blur_fwhm'    => 4,
     'iterations'   => 2,
     },
   );
华夏公益教科书