MINC/VisualTools/register
MNI-register - 交互式体积显示和点标记程序
register [-version]] [-help] [-rgb]] [-cmap]] [-single] [-double] [-global variable value]] [volume1''filename] [volume2''filename] [tags.tag]
Register 是一个交互式图形应用程序。它可以显示一个或两个体积（通常是 MR 或 PET），以及两个体积的合并图像。某些但并非所有版本允许在单缓冲和双缓冲模式之间以及 RGB 模式和颜色映射模式之间切换，因此选项 -rgb、-cmap、-single、-double 用于设置程序的初始状态。每个体积有三个视口，显示横断、矢状和冠状切片。用户可以在体积中移动，并在体积内创建标签点。如果为两个体积选择了足够的标签点，那么将计算一个用于配准两个体积的变换。此变换用于显示合并图像，并允许用户启动一个过程，该过程将一个体积重新采样到与另一个体积相同的空间。向量体积通常会在输入时转换为 RGB 体积。我不知道这在寄存器的显示方面意味着什么。或者，可以通过将全局变量 Convertvectorsto_rgb 设置为 FALSE 来将向量转换为标量，其值是向量分量的平均值。
用户界面是一个基于鼠标的界面，由按钮、滑块和文本输入组成。可以使用鼠标左键按下按钮。可以通过用鼠标左键点击文本输入并输入文本来更改文本输入。输入回车键表示文本输入完成。输入 Esc 键在不修改文本的情况下结束文本编辑。可以使用 Delete 键、光标左键和光标右键。Ctrl-a 和 Ctrl-e 分别将光标移动到文本的开头和结尾。Ctrl-u 删除文本输入中的所有文本。
退出：在确认后退出程序。
重新采样和加载：根据标签点定义的变换，对第二个体积进行重新采样，使其与第一个体积位于相同的空间中。重新采样文件名：文本输入，用于设置要为重新采样创建的文件的名称。
同步 / 非同步：切换开关，用于控制所有体积中光标位置是否始终保持相同。
平滑 / 插值：尚未实施。最终将控制显示的插值方法。颜色映射 / RGB：在颜色映射模式（更新速度更快）和 RGB 模式（更真实的颜色）之间切换。
双缓冲 / 单缓冲：在双缓冲和单缓冲之间切换。
加载标签：将一组标签点加载到程序中。
标签文件名：文本输入，用于设置加载和保存标签时要使用的文件名的名称。自动提供默认扩展名 \".tag\"。
保存标签：将所有活动标签点保存到文件。如果加载了一个体积，则会保存一组单个标签。如果加载了两个体积，则会保存一组标签对。
保存变换：如果存在，则保存由标签点定义的变换。
变换文件名：文本输入，用于设置保存变换时要使用的文件名的名称。自动提供默认扩展名 \".xfm\"。
记录标签：用体积内的当前位置覆盖当前标签点位置。如果当前标签点是标签的末尾，则会创建一个新的标签点。
删除标签：删除当前标签点。
删除所有标签：弹出一个确认框，允许您删除所有标签。
变换类型：弹出一个对话框，选择 6 参数、7 参数、12 参数或薄板样条非线性拟合。
标签可见 / 不可见：切换切片上标签点位置的显示。
光标可见 / 不可见：切换切片上光标十字准线的显示。
插值：平滑 / 平滑：在平滑着色和平滑着色之间切换切片的显示。平滑着色需要更长的时间来更新（几秒钟），但会生成更高质量的图像，尤其是在放大图像时会更明显。
RMS：显示标签点的平均 RMS 误差（如果存在变换）。
体素和世界坐标位置读数：显示体积光标在体素和世界坐标中的位置。可以通过点击数字并输入所需位置来以数字方式更改位置。
加载体积：加载指定的体积。
体积文件名：指定体积文件名。
重置视图：重置切片的比例和平移，使其适合视口。
过滤器：弹出一个对话框窗口，选择体积的 3 个视图中的每一个的过滤器类型。过滤应用于切片，但不应用于切片内。过滤器类型有：最近邻、线性插值、盒式滤波器、三角形滤波器和高斯滤波器。
低于颜色：设置显示小于范围的值的体素的颜色。
高于颜色：设置显示大于范围的值的体素的颜色。
颜色条滑块：设置颜色范围。可以使用鼠标左键拖动上限或下限。可以使用鼠标中键同时移动两者。
颜色编码类型：将颜色编码方法设置为灰度、热金属、光谱、红色、绿色或蓝色。
体素和世界坐标位置读数：显示体积光标在体素和世界坐标中的位置。可以通过点击数字并输入所需位置来以数字方式更改位置。
重置视图：重置切片的比例和平移，使其适合视口。
合并方法按钮：将合并方法设置为混合、加权、第一个在第二个上面或第二个在第一个上面。混合允许两个体积之间进行混合。加权允许两个体积的任意权重。第一个在第二个上面将第一个体积放在第二个体积的顶部，如果第一个体积超出范围，则会显示第二个体积。第二个在第一个上面则相反。
不透明度滑块：设置两个体积的权重。仅在合并方法为混合或加权时使用。
位置：显示并允许设置标签位置。
名称：设置标签的名称。
启用 / 忽略：设置标签的活动状态，即它是否对变换有贡献。
距离：显示第一个体积中的标签点到变换后位置的距离。
在切片视口中，以下操作有效
鼠标左键：设置体积光标位置。
鼠标中键：根据鼠标的 y 位置垂直移动切片。
鼠标右键：在当前体积光标位置添加一个新的标签点。
Shift/Ctrl/Alt 鼠标左键：平移切片显示。
Shift/Ctrl/Alt 鼠标中键：根据鼠标的 y 位置缩放切片显示。
Register 能够通过将体积的一部分缓存到内存中来处理大于虚拟内存的体积。目前决定何时缓存体积的默认值为 80 兆字节。有关更多信息，请参见 MNI-register 的源库文档。
请注意，体积缓存可能会对性能产生重大影响。在某些情况下，您可能会通过禁用缓存获得更好的结果，尤其是在使用 NFS 挂载的文件系统上的体积时。
要禁用缓存，请将 VOLUME_CACHE_THRESHOLD 环境变量设置为 -1。例如，在 bash 中，export VOLUME_CACHE_THRESHOLD=-1。
/usr/local/lib/register.globals
/usr/local/lib/register_UI.globals
DavidMacDonald