代谢组学/代谢组学导论/历史
代谢组学的起源可以追溯到公元前2000-1500年，当时中国传统医生开始使用蚂蚁来评估患者的尿液，以确定尿液中是否含有糖尿病患者的高血糖。在那个时期，有些人会品尝尿液以检查是否含有同样的物质。尿液也是古埃及确定糖尿病的一个因素，他们通过频繁排尿来判断。这种最早使用体液来确定生物状况的行为可以被认为是代谢组学最早的应用之一。
代谢组学发展的早期阶段可以追溯到公元前300年，当时古希腊人首次认识到，检查体液（当时称为体液）对于预测疾病至关重要。在代谢组学的发展道路上，下一个里程碑是在公元131年，当时盖伦创造了一种病理学体系，将希波克拉底的体液理论与毕达哥拉斯理论相结合。盖伦提出的这种理论在17世纪之前一直没有受到质疑，并被认为是标准理论。
17世纪初，桑托里奥·桑托里奥被认为是代谢研究的奠基人。他在1614年出版了他在《De Statica Medicina》中关于“不显性出汗”的研究成果，他发现总排泄量（尿液、粪便、汗液）小于摄入的液体量。他的工作首次获得了物理数据，并基于精确研究和仪器提供了代谢疾病的定量基础。代谢组学发展过程中的下一个步骤是在1674年，当时来自英国的医生托马斯·威利斯进行了首次尿液分析，他发现患有糖尿病和尿崩症的人可以通过尿液的甜度来区分。他的研究被马修·多布森在1776年进一步推进，他评估了糖尿病患者的尿液，并发现糖尿病患者的尿液中含有糖分。
到1905年，剑桥大学的J.J.汤姆森开发了第一台质谱仪。同年，人们对尿液中其他物质进行了更多研究，奥托·克努特·奥洛夫·弗林报告了分析尿液中尿素、氨、肌酸、尿酸的方法。他的所有发现都在《Physical Review》一期中发表。通往现代代谢组学的下一阶段出现在1946年，当时斯坦福大学的菲利克斯·布洛赫和哈佛大学的埃德温·珀塞尔在《Physical Review》同一期中同时发表了第一篇关于核磁共振的论文。通过色谱法分离代谢物也使得代谢组学研究成为可能。随着色谱分离技术的发现和在1960年代的实现，研究单个代谢物成为可能，该领域的技術方面也得以實現。
在必要的仪器到位之后，经过一段时间的沉寂，1971年，Mamer和Horning进行了首次基于质谱的代谢组学实验。在他们开始研究后不久，现代代谢组学开始形成，当时亚瑟·B·罗宾逊和莱纳斯·鲍林研究了生物变异性是否可以通过营养需求范围来解释。通过研究早期尿液色谱分离，他发现尿液中的化学成分包含大量有用的信息。代谢组学的第一篇论文（尽管当时没有被称为代谢组学）是由罗宾逊和鲍林在1971年发表的。该论文名为“气相-液相分配色谱法对尿液蒸汽和呼气的定量分析”，发表在《美国国家科学院院刊》上。罗宾逊继续发表了另外19篇论文，他和他的同事根据他们的发现确定了疾病、状况和生理年龄。这项研究是另一项开创性的发现，它为1990年的一项新发现铺平了道路，当时引入了亲水相互作用色谱法用于分离肽、核酸和其他极性化合物，随后在代谢研究中得到了应用。
虽然在当时已经具备了代谢组学未来发展的基础，但它还没有被命名为代谢组学。直到 1998 年，S.G. Oliver 和他的同事在《生物技术趋势》（Trends in Biotechnology）期刊上发表的文献中首次使用了“代谢组”这个词。该文献的引用信息为：Oliver, S. G., Winson, M. K., Kell, D. B. & Baganz, F. (1998). "酵母基因组的系统性功能分析. 生物技术趋势. 16, 373-378”。
未来，代谢组学很可能主要基于寻找生物标志物，来判断个体生物系统中是否存在疾病。由于已经存在生物学指标来识别疾病，例如尿液中葡萄糖的存在意味着糖尿病，高胆固醇更容易患心脏病，因此代谢组学可以充分利用生物化学途径知识。目前，代谢组学正专注于分析 20-100 种不同的代谢物，虽然这只是很小的一部分，但它在发现生物标志物方面取得了进展。目前，人们推测代谢组学是寻找诊断疾病的通用生物标志物的关键。这已经在实验中得到证实，例如，通过代谢组学而非基因组学或蛋白质组学，可以发现可逆性心肌缺血的生物标志物。这是因为当心脏血流受限时，柠檬酸循环成分会增加 60% 到 70%。这些代谢组学变化可以在血液血浆中找到，这成为发现患有这种疾病的患者的新的生物标志物。由于一些疾病已经可以通过这些代谢组学生物标志物诊断，因此它们很容易成为未来医疗检测疾病的关键。
在临床检测，如血液和尿液分析中，只有不到 1% 的代谢物被测量，这使得医护人员无法全面了解患者的健康状况。由加拿大阿尔伯塔大学戴维·维沙特博士领导的人类代谢组计划完成了人类代谢组研究的第一份草案，其中包含 2500 种代谢物，1200 种药物和 3500 种食物成分。该项目于 2004 年启动，获得 750 万美元的资金，并有 53 名科学家参与。第一份草案于 2007 年 1 月 23 日完成。研究结果已归档在一个名为人类代谢组数据库 (HMDB) 的可自由访问的网络资源中。除了对内源性代谢物进行研究之外，该小组还识别并编目了近 1200 种药物（现已归档在 DrugBank 中），并正在努力完成一个关于食品添加剂的类似数据库。该小组正在使用核磁共振波谱学、质谱法、多维色谱法和机器学习等先进方法来促进这项工作。
目前代谢组学研究中存在两个常见要素:
(1) 对代谢物进行分析时，不会偏向于任何特定的代谢物群组。
(2) 研究代谢物之间的关系，目前主要通过多变量方法进行。
http://en.wikipedia.org/wiki/Metabolite
- 该资源旨在提供代谢组学的概述。它深入探讨了代谢组学的各个方面，包括代谢组、代谢物、代谢组学、历史、分析方法和应用。虽然它没有详细介绍，但它是一个很好的网站，可以帮助你了解代谢组学的基本知识，从而在阅读更深入的代谢组学文章时更容易理解内容。
- 蛋白质组学分析
- 对蛋白质进行大规模研究，特别是其结构和功能。（http://en.wikipedia.org/wiki/Proteomics）
- 转录组学
- 研究细胞群体中产生的所有信使 RNA (mRNA) 分子集合。（http://en.wikipedia.org/wiki/Transcriptomics）
- 代谢组
- 生物体中所有小分子代谢物的完整集合。（http://en.wikipedia.org/wiki/Metabolite）
- 代谢物
- 代谢过程中所有中间产物和最终产物。（http://en.wikipedia.org/wiki/Metabolite）
- 代谢组学
- 对活生物体对病理生理刺激或基因修饰的动态多参数代谢反应进行定量测定。（http://en.wikipedia.org/wiki/Metabolite）
- 这与我们在生物化学代谢课程中的学习有许多联系。在课堂上学习代谢时，我们学习了不同的代谢过程，并考察了所有代谢中间产物（代谢物）。代谢组学研究代谢物可以经历的不同代谢途径，这正是我们在课堂上学习的内容。一个过程的代谢中间产物可以很容易地进入另一个过程，因为它们相互关联。例如，6-磷酸葡萄糖是糖酵解、糖异生以及许多其他途径的中间产物。代谢中所有不同途径之间的这种联系被称为代谢组学。
- 进行代谢组学研究的过程已经存在了几百年，但直到最近才成为一个独立的科学领域。通过色谱法分离代谢物使得代谢组学的研究成为可能。随着色谱分离技术在 20 世纪 60 年代的发现和发展，研究单个代谢物成为可能，该领域的技術方面也得以实现。现代代谢组学始于 20 世纪 70 年代，当时亚瑟·罗宾逊研究了生物变异性可以用营养需求范围来解释。通过研究早期尿液色谱分离结果，他发现尿液中的化学成分包含着有用的信息。第一篇关于代谢组学的论文（当时没有被称为代谢组学）由罗宾逊和鲍林于 1971 年发表。该论文名为“气相液相分配色谱法定量分析尿液蒸汽和呼吸”，发表在《美国国家科学院院刊》上。罗宾逊继续发表了 19 篇论文，他和同事们根据他们发现的数据识别出了疾病、病症和生理年龄。罗宾逊的研究花了 20 年才真正流行起来，到了 20 世纪 90 年代，这个想法开始蓬勃发展，代谢组学这个术语也应运而生（第一篇使用“代谢组”这个词的论文发表在 1998 年，引用信息为：Oliver, S. G., Winson, M. K., Kell, D. B. & Baganz, F. (1998). "酵母基因组的系统性功能分析. 生物技术趋势. 16, 373-378”。尽管这个术语在 20 世纪 90 年代开始被使用，但代谢组学研究直到 2004 年才真正得到推广。2007 年 1 月 23 日，由加拿大阿尔伯塔大学的戴维·维沙特博士领导的人类代谢组计划完成了人类代谢组研究的第一份草案，其中包含 2500 种代谢物，1200 种药物和 3500 种食物成分。
目前代谢组学研究中存在两个常见要素:
(1) 对代谢物进行分析时，不会偏向于任何特定的代谢物群组。
(2) 研究代谢物之间的关系，目前主要通过多变量方法进行。
http://masspec.scripps.edu/metabo_science/timeline.php
- 该网站本身的目的是探讨代谢组学的质谱分析。它包含了不同部分，链接到代谢组学事件的资源、代谢组学阅读材料、代谢物数据库和数据分析工具。该网站的主要重点是展示质谱法如何用于分析代谢组学，以及如何利用质谱法识别代谢物。
- 质谱法
- 一种分析方法，用于测量带电粒子的质荷比。（http://en.wikipedia.org/wiki/Mass_Spectrometry）
- 虽然此网站在实际操作和详细介绍代谢组学方面提供的信息很少，但它提供了一个非常清晰的代谢组学历史时间线，从它开始到现在的发展历程。贯穿始终的主要联系是，它描绘了我们研究的某些事物是如何出现的，以及它们如何发展，以便观察随着人类代谢理解的加深，将会继续建立哪些联系。
- 代谢组学的最早步骤可以追溯到公元前 300 年，当时古希腊人首次认识到检查体液（当时称为体液）对于预测疾病至关重要。从这里，代谢组学的下一个步骤是公元 131 年，当时盖伦创建了一个病理学体系，将希波克拉底的体液理论与毕达哥拉斯理论相结合。盖伦提出的这一理论在 17 世纪之前一直没有受到质疑，并一直是标准理论。17 世纪初，桑托里奥·桑托里奥成为了代谢研究的奠基人。1614 年，他在《静力医学》中发表了他关于“无形出汗”的研究，并确定总排泄物（尿液、粪便、汗液）少于摄入的液体量。他的工作是第一个获得物理数据并根据精确研究和仪器提供定量病理学基础的工作。代谢组学发展中的下一步出现在 1674 年，当时英国医生托马斯·威利斯进行了首次尿液分析，发现糖尿病和尿崩症患者仅凭尿液的甜味就能区分开来。他的研究在 1776 年由马修·多布森进一步推进，他评估了糖尿病患者的尿液，发现糖尿病患者的尿液中存在糖。到 1905 年，剑桥大学的 J.J. 汤姆森研制了第一台质谱仪。同年，还有更多关于尿液中其他物质的研究，奥托·克努特·奥洛夫·福林报告了尿液中尿素、氨、肌酸、尿酸分析方法。他的研究成果全部发表在《物理评论》的一期杂志上。现代代谢组学之路的下一步出现在 1946 年，当时斯坦福大学的费利克斯·布洛赫和哈佛大学的埃德温·珀塞尔在同一期《物理评论》上同时发表了第一篇关于核磁共振的研究。随着必要的仪器的出现，经历了一段时间的空白，直到 1971 年，梅默和霍宁进行了首次基于质谱的代谢组学实验。他们开始研究后不久，亚瑟·B·罗宾逊和莱纳斯·鲍林使用了色谱分离技术来分析血液和尿液代谢物，他们的开创性研究成果发表在《美国国家科学院院刊》上。这项研究是另一个突破性的发现，它为 1990 年的新发现铺平了道路，当时亲水相互作用色谱被引入用于分离肽、核酸和其他极性化合物，随后也应用于代谢研究。此时，代谢组学的基础已经非常牢固，但它还没有被称为代谢组学。1998 年，S.G. 奥利弗及其同事在《生物技术趋势》上发表的文献中首次使用了代谢组学一词。接下来的步骤出现在 2006 年，当时一种称为“狙击手”代谢组学的新方法被引入，该方法使用色谱法和质谱法来分析代谢物。
http://www.drugdiscoverynews.com/index.php?newsarticle=1156
- 该网站重点介绍代谢组学及其如何为新机遇铺平道路。它谈论了代谢组学面临的挑战，即开发可用于提取、识别和量化生物样本中所有样本的技术。本文的主要重点是展示一项将有助于代谢组学研究的新发展，即生物标志物。它侧重于正在进行的代谢组学生物标志物研究，以便更好地了解人体。
- 生物标志物
- 用作生物状态指标的物质。（http://en.wikipedia.org/wiki/Biomarker）
- 该网站与课程相关，因为它讨论了如何利用代谢物识别疾病。我们在课堂上学习的一个例子是，在糖尿病中，尿液中会出现葡萄糖，因为没有胰岛素来刺激糖酵解和脂肪酸合成，因此过量的葡萄糖在血液中积累并通过尿液排出体外。他们还谈论了基因可能显示谁更容易患病，而代谢组学则显示了个体存在的状况，这一点更为重要。
- 在 2000 年，该文章简要地提到了代谢组学一词出现在期刊文章中的历史，并提到了在生物系统中小分子领域存在先前的研究，但现在才将其归类为一个特定的研究分支。然而，这篇文章更多地关注代谢组学的未来，而不是过去。它谈论了代谢组学在寻找生物标志物方面的重要性，以便确定生物系统中何时存在疾病。由于已经使用了生物标志物来确定疾病，例如尿液中的葡萄糖意味着糖尿病，或高胆固醇更容易患心脏病，因此很明显代谢组学可以利用生化途径知识。目前，代谢组学专注于专门研究 20-100 种不同的代谢物，尽管这只是很小的一部分，但它在发现生物标志物方面取得了进展。目前推测，代谢组学是找到用于诊断疾病的通用生物标志物的关键。
http://www.servier.com/pro/cardiologie/pdfs/kub73ang.asp
- 这是另一个页面，它讨论了用于检测疾病的生物标志物。该网站提供了一个具体的例子，即通过代谢组学检测可逆性心肌缺血。这篇文章谈论了基因组学或蛋白质组学没有可逆性心肌缺血的迹象，但这种疾病会发生代谢变化。
- 心肌缺血
- 一种以冠状动脉疾病导致心脏血流减少为特征的疾病。（http://en.wikipedia.org/wiki/Ischaemic_heart_disease）
- 该网站讨论了柠檬酸循环终产物的血浆水平发生显著变化。精氨酸、琥珀酸和瓜氨酸的水平也发生了变化，这是由于心脏在供血不足的情况下，从有氧代谢能量生成方式转变为无氧代谢能量生成方式引起的。
- 这篇文章提到，与基因组学或蛋白质组学相比，代谢组学可以更好地检测可逆性心肌缺血。这是因为当心脏血流受限时，柠檬酸循环成分会升高 60% 到 70%。这些代谢变化可以在血浆中找到，这是一个发现患有这种疾病的人的良好生物标志物。由于一些疾病已经可以通过这些代谢组学生物标志物来诊断，因此它们很容易成为未来医疗检测疾病的关键。
http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/fulltext/112234343/PDFSTART
- 这篇文章探讨了代谢组学历史，以及它如何可以追溯到古代中国和埃及。
- 所有内容都包含在之前的文章中。
- 这篇文章再次谈到古代使用尿液诊断疾病的历史，并且再次提到糖尿病患者尿液中存在葡萄糖，因为胰岛素无法释放，没有触发糖酵解将过量的葡萄糖转化为脂肪酸，因此高血糖导致尿液中排泄葡萄糖。
- 代谢组学的起源可以追溯到公元前 2000-1500 年，当时传统中医开始使用蚂蚁来评估患者的尿液，以确定尿液中是否含有糖尿病患者的高血糖。在那个时候，其他人会品尝尿液的甜味来检查同样的事情。这种最早使用体液来确定生物状况的方法可以被认为是代谢组学最早期的应用。尿液在古埃及也是判断糖尿病的一个因素，通过频繁排尿来确定。（这篇文章没有其他新的信息，这些信息在其他文章中没有出现。）
http://www.metabolomics.bbsrc.ac.uk/
- 该中心是英国领先的植物和微生物代谢组学研究机构，起源于 Rothamsted Research 和生物技术与生物科学研究理事会 (BBSRC) 的合资企业。该中心提供植物和微生物代谢物的全面化学和信息学分析服务，例如核磁共振 (NMR) 和质谱 (MS)。他们主要项目之一是 MeT-Ro（Rothamsted 的代谢组学），其目标是建立大量资源，可用于研究植物和微生物代谢组学，以开发高通量代谢物指纹识别服务。他们的另一个项目是 GARBet，即基因组拟南芥资源网络。该计划提供拟南芥代谢物谱分析服务，需付费。
- 核磁共振 (NMR)
- 核磁共振波谱利用某些原子核的磁性来提供有关异构体和分子构象的信息。生化实体的混合物会产生特定的模式，这些模式会被 NMR 检测到。这被解释为代谢组学的研究。NMR 可以通过将信号与参考化合物的库进行比较，或通过二维 NMR 来检测任何含有氢的代谢物。
- 化学计量学
- 多元统计、模式识别和信息学方法在化学数据中的应用。
- 质谱 (MS)
- 这是一种通过测量离子的质荷比来确定样品成分的工具。该工具将样品分解成离子，分离不同质量的离子，检测每种质量离子的数量，并将这些数据收集起来生成独特的质谱图。质谱可用于识别未知化合物，确定化合物中元素的同位素组成，根据片段确定化合物的结构，确定样品中化合物的含量，以及其他应用。
- 代谢组
- 特定生理或发育状态下细胞中所有低分子量分子的定量补充。
- 代谢组学
- 包括相互作用的细胞外环境的整合、多细胞生物系统。这与代谢组学形成对比，代谢组学处理简单的细胞系统，主要处理代谢物浓度。（这是该中心对两者之间区别的定义。）
- 代谢物谱分析
- 一组相关化合物或特定代谢途径成员的定量或定性测定。
- 代谢物指纹识别
- 通过快速、全局分析进行样品分类，无需进行广泛的化合物鉴定。
- 气相色谱 (GC)
- 该技术提供高分辨率的化合物分离，可与火焰离子化检测器 (GC/FID) 或质谱仪 (GC/MS) 结合使用。两种检测方法都非常灵敏，能够检测到几乎所有有机化合物，无论其类别或结构如何。然而，植物提取物中发现的许多代谢物挥发性太低，无法通过 GC 方法直接分析。这些化合物在应用于 GC 柱之前，必须转化为极性较低、挥发性更高的衍生物。
- 这个网站，更具体地说，该中心及其目标，赋予了我们对代谢途径和相互作用的研究以重要意义。正如 Craig 博士所强调的那样，这些途径中的每一个都不是独立存在的；它们相互交织，通常在细胞内同时起作用。就像我们已经开始研究基因组学、蛋白质组学和转录组学一样；代谢组学是推动一致性研究的关键方面。它认识到生物体的表型是所有这些方面的集合。通过代谢组学研究获得的信息将有助于基因注释，并加深我们对基因组数据的理解和应用。
http://www.metabolomics-nrp.org.uk/metabolomics.html
- 该网站旨在促进代谢组学、蛋白质组学和基因组学领域的学者进行合作，交流想法和发现，以创造跨学科的环境。该网站鼓励使用气相色谱、高效液相色谱、核磁共振、直接进样质谱和傅里叶变换红外光谱等技术，在目标化合物分析、代谢物谱分析、代谢组学和代谢物指纹识别方面进行代谢分析。
- 挥发性
- 在正常温度和压力下容易蒸发。
- 生色团
- 能够选择性地吸收光，从而使某些有机化合物呈现颜色的化学基团。
- 电喷雾电离
- 质谱中用于产生离子的技术。
- 化学计量学
- 统计学和数学在化学数据实验设计和分析中的应用。
- 电生理学
- 生理学的一个分支，研究电现象与身体过程之间的关系。
- 本文定义代谢组学为“在特定环境条件下，在特定时间内对生物体细胞中所有低分子量代谢物的定量测量”。网站上列出的每个实验室的研究都涉及到这一点。这与我们在课程中学到的内容相关，因为我们讨论过参与代谢反应的化合物的分析，以及这些化合物数量的变化如何影响各种代谢反应的方向和速率。它还谈到了代谢途径的整合。我们在课堂上提到了生物体进行的途径交织的复杂性。
代谢组学——“组学”科学领域中的一个新兴领域
[edit | edit source]http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?artid=1241997&blobtype=pdf
总结
[edit | edit source]- 这篇社论讨论了代谢组学是一个具有挑战性的研究领域，因为它经常质疑哪些化合物应该被认为是代谢物，以及代谢物的数量根据计数方法的不同而不同。目标是开发一个能够同时定量分析所有代谢物的单一平台。这很难做到，因为化合物的物理性质和浓度都不同，而代谢组是动态的，这意味着时间或饮食的影响会产生重大影响。“以所有代谢物为目标，技术障碍似乎是限制步骤”，但是，有了适当的技术，代谢组学是一种可以帮助诊断疾病或研究毒物对表型影响的工具。为了成功实现代谢组学，技术需要提供高通量、高分辨率、高重现性和高灵敏度。如今，这个研究领域依赖于核磁共振 (NMR) 或与色谱联用的质谱法。
新名词
[edit | edit source]- 代谢组学
- “对特定细胞过程留下的独特化学指纹的系统研究”，对人体中产生的所有小分子进行的全球性研究
- 基因组学
- 对完整基因组的分析，以了解单个基因的功能
- 转录组学
- 对基因表达的分析
- 蛋白质组学
- 全面的蛋白质分析，包括它们的结构和功能以及它们在细胞内部如何工作和相互作用
- 转录组
- 在一个或一群细胞中产生的所有信使 RNA (mRNA) 分子或“转录本”的集合
- 蛋白质组
- 由基因组、细胞、组织或生物体表达的全部蛋白质的补充
- 代谢组
- 在生物样本中发现的小分子代谢物的完整集合
- 代谢物
- 任何参与代谢的物质，无论是作为产物还是必需品，代谢的中间体和产物（激素和信号分子）
- 代谢谱分析
- 为代谢途径中的代谢物或一类化合物开发的定量分析方法
- 代谢指纹图谱
- 对响应疾病或毒物暴露而改变的代谢物模式或指纹进行比较
课程相关性
[edit | edit source]- 这篇社论中的信息与我们在本课程中学习的内容相关，因为它将代谢组定义为一个动态系统。我们已经讨论过稳态的动态状态，包括体内平衡和能量方面的动态状态。这些动态系统或状态很容易受到外部或环境因素的影响，因此它们不断发生变化。社论还提到，对整合途径的了解有助于解释数据，并有助于确定如何测量途径中的通量（运动速率）。整合在课堂上一直被强调，因为我们正在学习所有这些不同的途径，令人惊讶的是，它们以某种方式都相互联系。它们通常会相互补充，一个途径的最终产物将成为另一个途径的起点（例如糖酵解和糖异生）。这种整合在代谢组学领域非常重要。
Med Bio World：代谢组学
[edit | edit source]http://www.medbioworld.com/postgenomics_blog/?p=9
总结
[edit | edit source]为了提供关于代谢组学如何影响许多科学领域（如生物化学、分析化学和生物学）的一般概念
新名词
[edit | edit source]- 蛋白质组学
- 对蛋白质的大规模研究，特别是它们的结构和功能。
- 蛋白质组
- 在特定环境条件下（如暴露于激素刺激）下，在特定细胞类型中发现的蛋白质集合。
- 生物标志物
- 一种用作生物学状态指标的物质。它是可以客观测量和评估的特征，用作正常生物学过程、病理过程或对治疗干预的药理学反应的指标。
- 神经递质
- 用于中继、放大和调节神经元与另一个细胞之间信号的化学物质。
- 阈下
- 不足以被感知或产生反应。
课程相关性
[edit | edit source]- 本资源涉及许多化学领域。这包括生物化学和分析化学。本资源将一些分析技术（如 HPLC（高效液相色谱——使用高压泵送液体以迫使小型分析物通过色谱柱））和库仑电极阵列检测相关联，以分析氧化还原活性化合物。在之前的几周里，我们研究了氧化还原反应在代谢过程的生物能学方面的意义。这包括 NAD+ 到 NADH 的脱氢酶的概念；在肌肉的乳酸发酵和酵母的乙醇发酵中很重要。此外，氧化还原反应在将 NADP+ 转换为 NADPH 以为戊糖磷酸途径提供燃料（从葡萄糖 6-磷酸到核糖 5-磷酸）以制造 DNA、RNA 和其他核苷酸中很重要。
酵母基因组的系统功能分析
[edit | edit source]总结
[edit | edit source]这篇科学论文讨论了酿酒酵母基因组在细胞活组织中产生的基因产物的用途。它涉及细胞中其他完整的互补系统，包括转录组、蛋白质组和代谢组。它回顾了用于获取完成这些不同但相关系统所需的必要信息的许多协议。
关键词
[edit | edit source]转录组- 给定生物体中所有 mRNA 分子的集合。