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神经影像数据处理/处理/步骤/丢弃首卷

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神经影像数据处理/处理/步骤
丢弃首卷 去尖峰

丢弃首卷

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EPI序列中第一个 体积 的信号可能由于纵向磁化尚未达到稳态而超出范围。因此,它们通常被丢弃,不用于分析。对 体素 时间序列的视觉检查可以很好地了解哪些体积受到影响。

请记住,丢弃首卷将影响扫描中的体积数量以及刺激开始文件和生理参数文件中的时间信息。

3dTcat 是 AFNI 的函数,用于丢弃首卷。它基本上复制原始数据,省略指定体积。一个简单的命令看起来类似于以下内容

3dTcat [options] INPUTFILE[2..$] 

在本例中,它将原始数据 (inputfile) 中除前两个体积 (0 和 1) 之外的所有体积写入输出文件。此步骤通常用于将原始数据的 (感兴趣部分) 复制到结果目录以进行进一步预处理,以便原始数据保持不变。请注意,体积编号和时间信息可能需要相应调整。

3dTcat 也可用于使用 -rlt 选项进行线性去趋势。有关更多详细信息和选项,请查看手册页 [1]

afni_proc.py 中,这是一个默认步骤,但要移除的 TR 数量设置为 0。移除前 n 个 TR 的相应选项为

-tcat_remove_first_trs n

参考文献

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  1. AFNI 程序:3dTcat:-help 的输出
华夏公益教科书