下一代测序 (NGS)/背景

对下一代测序知识的最新综述的需求

对低成本测序的高需求推动了高通量测序的发展，这也称为下一代测序 (NGS)。下一代测序过程中同时生成数千或数百万个序列。下一代测序已成为一种商品。随着各种经济实惠的台式测序仪的商业化，NGS 将在更多传统的湿实验室生物学家手中触手可及。近年来，基因组范围的计算分析越来越多地被用作促进生物医学研究中新发现的支柱。然而，随着序列数据量的指数级增长，分析瓶颈尚未解决。

NGS 信息学的现有来源非常分散。新手可以在各种期刊上阅读评论文章，关注论坛（如Biostar或SEQanswers ）上的讨论主题，或注册由各种机构组织的课程。找到一个集中的综述要困难得多。书籍是可以买到的，但该领域的开发速度如此之快，以至于书籍章节在印刷出来时就有可能过时。此外，少数作者持续更新其文本的成本可能会占用他们大量的时间。

借鉴讨论论坛上明显的善意和社区精神，并利用维基媒体基金会提供的协作工具，我们建议启动编辑关于 NGS 的协作维基教科书。我们的计划是收集足够的文本，让人们有动力为其做出贡献，本质上提供与论坛相同的信息，但以更整洁的形式。最终，我们的目标是创建一本集体实验室手册，解释关键概念并描述 NGS 的最佳实践。

目标受众

这套动态材料是为台式生物学家（没有或只有基本生物信息学经验的资深博士生和早期职业博士后研究人员，并表现出对 NGS 数据分析的兴趣）而设计的。随着社区的贡献以及该领域的需求和趋势的发展，可能会添加更高级的材料。在线材料的灵活性应允许读者在第一次阅读时忽略细节，但可以立即访问他们需要的细节。但是，总体结构和风格应优先为非生物信息学读者设计。

一些章节附带实际练习，以便读者可以熟悉这些步骤。

数据分析卡住了？

从在线社区（包括Biostar和SEQanswers）中寻求帮助，请确保您遵循Dall’Olio 等人制定的指南。