玩家在这个游戏中的主要目标有两个
玩家从大木博士那里收到一只口袋妖怪,必须训练它使其变得更强大,才能在战斗中击败其他训练师的口袋妖怪,或者削弱野生口袋妖怪,并可以用一种名为精灵球的特殊物品捕捉它们。
每只赢得战斗的口袋妖怪都会获得经验值,这将使其成长,获得新的等级,学习新的、更强大的招式,甚至进化成更强大、更大的口袋妖怪。
为了帮助训练师完成他的任务,有一些物品可以用来恢复口袋妖怪的健康,或者治愈它们因混乱或麻痹等特殊状况。