口袋妖怪红绿/口袋妖怪塔
现在火箭队已经消失，你可以把注意力转向你收到的幽灵眼镜。这个道具可以让你看到并战斗口袋妖怪塔里的幽灵系口袋妖怪。这将是我们的下一个目的地；但是，不要立即返回7号道路。相反，从枯叶市的西边离开。
这里也有一只巨大的卡比兽挡住了道路，但不要理会它。在你看到卡比兽之前不久，你会看到一棵需要使用“切割”技能才能砍倒的树。砍倒它，然后穿过建筑物，到达后面的一个小房子。里面一个女人会给你秘传机02（飞翔），这是游戏里最有用的技能之一。如果你把它教给你的其中一只口袋妖怪，你就可以在战斗以外的地方使用它，传送到你已经步行到达过的任何城市。如果你没有可以学习这个技能的口袋妖怪，你可以在附近的草丛里捕捉一只嘟嘟鸟。飞回紫堇镇。
到达后，去一趟口袋妖怪中心，如果你愿意，可以买一些超级驱虫喷雾。然后直接前往口袋妖怪塔。
这个圆形区域有七层；第一层只是一个大厅。你需要爬到最顶层。一楼的楼梯在东边，3点钟方向。
当你进入这一层时，你会遇到你的对手。和往常一样，他会向你发起挑战。他的队伍在这个阶段更加多样化。
Boss — 对手
如果你在游戏开始时选择了杰尼龟
- 25级 比雕
- 23级 暴鲤龙
- 23级 火恐龙
- 20级 超能力
- 25级 妙蛙草
如果你在游戏开始时选择了妙蛙种子
- 25级 比雕
- 23级 蛋蛋
- 22级 暴鲤龙
- 20级 超能力
- 25级 火恐龙
如果你在游戏开始时选择了小火龙
- 25级 比雕
- 23级 火恐龙
- 22级 蛋蛋
- 20级 超能力
- 20级 水箭龟
打败你的对手后，向西然后向南走，就可以到达通往下一层的楼梯。
从这里开始，你会遇到野生的幽灵系口袋妖怪。如果你在没有幽灵眼镜的情况下试图爬上这座塔，你将无法伤害（甚至识别）这里的口袋妖怪。首先，向东然后向北走，经过一个训练师，就可以到达逃生绳索。从楼梯向东和向南走，然后你会有三条路可以走。其中两条路上有一个训练师。三条路都在通往下一层的楼梯处汇合。
迷宫变得更加复杂。在这个“房间”的西南角，你会找到一个万能药。走西边两条路中的下面那条，你会经过一个觉醒。如果你从那里向南走，经过一个训练师，你会找到一个体力果。然后向西北走，你会找到另一个训练师和通往下一层的楼梯。（如果你走两条路中的上面那条，你会发现一条直接通往楼梯的路，不会遇到任何训练师或道具。）
沿着东边的路走。你会看到一个在北边的房间；里面有一个训练师，除此之外什么都没有。很快你会看到一个包含16个小方格的方形区域。如果你踏上这个垫子，你的口袋妖怪将会完全恢复体力，就像你访问过口袋妖怪中心一样。垫子的东边有一个训练师挡住了通往楼梯的直接路径。如果你从垫子向西走，然后沿着路走，你会经过一个训练师，在南边还有一个侧室。与上一个不同的是，这个房间除了训练师外，还有一个宝贵的金块。
你快到顶层了。向南走，经过一个训练师，你会发现一个藏在角落里的X精确度。沿着路径向北走，经过两个训练师，你会发现一个阻挡你前进的道具球；它是一颗稀有糖果。
如果你继续沿着这条路走，你会发现最后一组楼梯；然而，会有东西挡住你的去路。这里有一个固定的遭遇战，与一个30级的嘎啦嘎啦战斗。如果你早早地来到这里（在得到幽灵眼镜之前），你就无法打败这只口袋妖怪，也无法前往顶层。有趣的是，这只口袋妖怪不被认为是野生的，因为它无法被捕捉。你可以用你所有的精灵球来捕捉它；它会躲避每一个（即使是大师球，如果你有的话）。只要打败它，然后继续前进。
在这里，你会发现一条直线走廊，里面有三个火箭队成员。打败他们，然后和走廊尽头的人说话，他原来是失踪的藤木先生。他会解释楼下的奇怪嘎啦嘎啦，说它是一只母口袋妖怪的鬼魂，据说是被火箭队杀害的。然后他会给你口袋笛子。这个道具可以用来立即唤醒任何正在睡觉的口袋妖怪；你现在可以摆脱那些觉醒。更重要的是，这是唯一能够唤醒那些挡住你道路的睡觉的卡比兽的东西。