蛋白质组学/蛋白质 - 蛋白质相互作用

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章节由 Poulami Barman 和 Sarah Allen 编辑和更新

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介绍

蛋白质相互作用对于每个生物体都是至关重要的。大多数蛋白质通过与其他分子的相互作用发挥作用，并且通常与其他蛋白质相互作用。酶与其底物相互作用，抑制剂与其酶相互作用，转运蛋白与其结构蛋白相互作用，激素与其受体相互作用 - 这些只是在细胞中发生的众多相互作用中的一部分。一些蛋白质由多个多肽链组成，不同肽之间的相互作用对于整个蛋白质的功能是必要的。由于它们非常重要，蛋白质-蛋白质相互作用是科学家需要了解的重要主题。

蛋白质-蛋白质相互作用的许多特征很重要。显然，了解哪些蛋白质正在相互作用很重要。在许多实验和计算研究中，重点是两种不同蛋白质之间的相互作用。但是，你可以有一个蛋白质与自身的其他拷贝相互作用（寡聚化），或者三个或更多不同的蛋白质相互作用。相互作用的化学计量也很重要 - 也就是说，在给定的反应中存在多少种每种蛋白质。一些蛋白质相互作用比其他蛋白质相互作用更强，因为它们结合在一起更紧密。结合强度称为亲和力。蛋白质只有在能量上有利的情况下才会自发地相互结合。能量在结合过程中发生变化是蛋白质相互作用的另一个重要方面。许多预测相互作用的计算工具都是基于相互作用的能量。

近年来，人们越来越关注在计算上预测蛋白质相互作用。预测相互作用可以帮助科学家预测细胞中的途径、潜在的药物和抗生素以及蛋白质的功能。然而，破译这些相互作用一直是一个持续的挑战。蛋白质是大型分子，它们之间的结合通常涉及许多原子和各种相互作用类型，包括氢键、疏水相互作用、盐桥等等。蛋白质也是动态的，它们的许多键能够伸展和旋转，从而导致不同的构象。因此，预测蛋白质-蛋白质相互作用需要对相互作用中涉及的化学和物理学有很好的了解。

本章讨论了蛋白质-蛋白质相互作用的特征，它们是如何通过实验确定的，以及它们是如何通过计算预测的。它还包含一个数据库列表，您可以在其中探索已知和预测的蛋白质相互作用。上面的链接将引导您到各个部分。