塞尔达传说：时之笛/版本
在提到时之笛的不同版本时，需要明确具体。按照已有的塞尔达传统，在任天堂64上预订的时之笛游戏卡带为“金色”卡带。此外，游戏的盒子是用坚固的塑料而不是纸板制成的，并印有“收藏版”字样。金色卡带是时之笛在美国的首批发行版本，并且数量有限，因此成为收藏品。
这款游戏也以不同的软件版本发行。所有于 1998 年 11 月发行的金色卡带游戏都是 1.0 版，而之后不久发布的一些灰色卡带也是 1.0 版。1.1 版的灰色卡带于 1999 年初开始发布，其中任天堂修复了第一个版本中的许多错误和漏洞。之后又推出了 1.2 版。
1.0 版与后续版本之间最显著的差异在于，在 1.0 版中，如果玩家在最终与加农的对战中存档并重置游戏，他们就能在没有林克的剑的情况下玩游戏，这样他们就能使用任何物品攻击伊波娜。1.1 版与 1.0 版类似，但上述漏洞已修复（然而，有一种不同的已知方法适用于所有版本，包括 GameCube 版本）。在 1.0 版和 1.1 版中，加农在游戏结束时的血液颜色为红色，但在 1.2 版中改为绿色。此外，在 1.2 版中，火神庙的原始主题（类似于伊斯兰祈祷的吟唱）在 1.2 版中被新的主题所取代。GameCube 版本与 1.2 版类似，但有一些不同之处，包括按钮图标更改为 GameCube 颜色。
在 2002 年，时之笛作为任天堂 GameCube 上预购塞尔达传说：风之杖的奖励光盘重新发行。奖励光盘还包括时之笛大师版，这是一个之前未发行的时之笛版本，拥有重新设计的地下城，据说难度更大。同年晚些时候，它再次重新发行（没有大师版附加内容），作为塞尔达传说：收藏版的一部分，作为限时促销活动。这张光盘还包括塞尔达传说：穆修拉的假面、塞尔达传说和塞尔达传说2：林克的冒险。在所有 GameCube 重新发行的版本中，任天堂将格鲁多的新月形和星形符号更改为原创设计。
在 2011 年，这款游戏以塞尔达传说：时之笛3D的形式在任天堂 3DS 上重新发行。它拥有更新的图形、重新设计的库存、BOSS 挑战模式和提示电影。它还包括大师版，在通关游戏后解锁。内置在 3DS 中的陀螺仪传感器可以用来瞄准一些物品。痛苦之石被痛苦碎片取代，当靠近秘密时，碎片会发出叮当声并在屏幕左上角显示一个图标。此外，在 3DS 版本中，还有一些希卡之石可以帮助玩家通关游戏。
在 2015 年，时之笛在任天堂 eShop 上为 Wii U 重新发行。这是时之笛 1.2 版的直接移植，任何变化都只是由于模拟的精度问题。
- N64 版本（带有塞尔达传说：穆修拉的假面）的外观使用了常规的按钮设置，并配备了震动包。
- 带有大师版的 GC 版本（以及穆修拉的假面）拥有不同的颜色设置和震动功能。特别是大师版（在 GameCube 和 3DS 版本的游戏中可用）拥有重新设计的地下城，适合那些觉得原版游戏过于简单或熟悉的老玩家。
- Wii 版本（带有穆修拉的假面）拥有 N64 的按钮设置，玩家可以使用经典和 GameCube 控制器，无需使用或配置震动包。
- 3DS 版本，塞尔达传说：时之笛3D，拥有重新制作的图形，对 HUD 精灵的一些更改，使用动作感应控制的方法，触屏菜单，一个通往 3DS 游戏笔记应用程序的快捷方式，一个包含“希卡之石”的提示系统（使用视频来提供提示并展示玩家应该怎么做，类似于天空之剑），塞尔达传说：时之笛3D 大师版（在通关普通游戏后解锁；它使用相同的新功能，但这次游戏地图和场景都进行了镜像——类似于 Wii 和 GameCube 版本的黄昏公主，或者更近期的黄昏公主 HD 与英雄模式），以及一个“BOSS 挑战”模式，让玩家可以选择再次挑战已经击败的 BOSS，或者连续挑战所有 BOSS。
- Wii U eShop 版本拥有与 Wii 虚拟控制器的布局相同的控制器布局；然而，控制器可以根据玩家的偏好进行自定义。