生物学未解之谜/蛋白质折叠
外观
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蛋白质结构可以从四个层级观察:I)一级结构:蛋白质的氨基酸序列。II)二级结构:序列中某些部分自身组织成的基序。它们主要是α螺旋和β折叠。III)三级结构:单个多肽的整体结构。IV)四级结构:两个或多个多肽以某种方式结合形成单个单位。(并非所有蛋白质都有四级结构,因为许多多肽单独发挥作用。)
蛋白质折叠问题提出的主要问题是:“能否从蛋白质的氨基酸序列预测其最终折叠结构?”换句话说,给定一级结构,能否预测更高阶的结构?到目前为止,根据氨基酸序列预测二级结构的部分内容取得了一定成功。例如,某些氨基酸序列被认为很可能折叠成各种基序。预测三级结构的成功率更低。使这个问题更加复杂的是,许多蛋白质需要其他蛋白质(分子伴侣)的帮助才能折叠成正确的构象。
某些氨基酸与其他氨基酸形成连接。某些氨基酸排斥某些其他氨基酸。正确的氨基酸是如何最终与相应的氨基酸连接的?如果错误的氨基酸最终与其他有吸引力但并不合适的氨基酸连接,就会形成非功能性构象。为了使蛋白质正常发挥功能,它必须获得正确的构象,否则它只会成为一团乱麻,毫无用处!