X射线晶体学/简介
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X射线晶体学是一种强大的技术,可以用来可视化蛋白质的结构。X射线照射到晶体上,X射线根据布拉格定律在晶体内的平面上发生衍射。然后可以收集得到的衍射图样。衍射图样中斑点的 位置提供了有关晶体结构的信息。然而,并不是所有关于晶体的信息都由记录设备收集,可以测量斑点强度,但相位信息会丢失,导致相位模糊。有很多技术被用来从晶体中以其他方式提取相位信息,对于小分子来说,相位可以直接使用帕特森图来求解,对于更复杂的分子来说,可以采用类似结构的相位,或者可以从异常散射体中提取相位信息。在所有情况下,都会根据观察到的结构因子和计算的相位计算模型,然后对模型进行优化以使模型拟合数据。
那么为什么编写或使用维基教科书呢?与[CCP4]的成功有很多共同之处,在这个平台上,世界各地的许多晶体学家都免费贡献代码给社区,作为回报,每个人都可以享受整套程序,维基教科书也可以做到同样的事情。如果每个人维护一个部分,那么只需少量的工作,你就可以免费分享整本教科书。只需偶尔维护,这本教科书就会始终保持最新。如果有足够多的人参与进来,它将是最佳的同行评审。
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- Å:埃,距离单位 (1Å = 10nm = 1x10-10m)
- a.s.u.:不对称单元
- c:真空中光速 (299,792,458 米/秒,或约 3x108m/s)
- CC:相关系数
- CCD:电荷耦合器件
- CCP4: [协作计算机项目 4]
- Cryo:低温,在 77K 或以下(液氮温度)
- Da:道尔顿
- EDTA:乙二胺四乙酸
- eV:电子伏特,能量单位,它是一个不受束缚的电子获得的动能大小
- EXAFS:扩展 X 射线吸收精细结构
- FOM:优值
- GUI:图形用户界面
- Gy:戈瑞,剂量单位,(1 Gy = 1 J•kg-1)
- h:普朗克常数 (6.626 × 10-34 J•s)
- HEPES:4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸
- HEWL:鸡卵白溶菌酶
- K:开尔文
- kDa:千道尔顿
- keV:千电子伏特
- M:摩尔浓度
- MAD:多波长异常色散
- MIR:多重同构置换
- MIRAS:多重同构置换与异常散射
- MPD:2-甲基-2,4-戊二醇
- MX:大分子晶体学
- NaAc:乙酸钠
- nm:纳米,距离单位 (1nm = 1x10-9m)
- NMR:核磁共振
- pA:皮安培(电流)
- pdb: [RCSB 蛋白质数据库]
- PEG:聚乙二醇
- PX:蛋白质晶体学
- RCSB:结构生物信息学研究协作中心
- RIP:辐射损伤诱导相位
- RIPAS:辐射损伤诱导相位与异常散射
- RMSD:均方根偏差
- SAD:单波长异常色散
- Se-Met:硒代蛋氨酸
- SIR:单重同构置换
- SIRAS:单重同构置换与异常散射
- Tris:Tris(羟甲基)氨基甲烷缓冲液
- v/v:体积比
- w/v:重量比