结构生物化学/羧肽酶

羧肽酶是一种胰腺酶，催化蛋白质和肽羧基末端的肽键水解，对具有芳香族或支链脂肪族侧链的氨基酸具有强烈的偏好。锌离子通过两个组氨酸氮、来自谷氨酸羧基的两个氧和一个水分子，以 5 配位方式结合。蛋白质结构中的一个口袋容纳底物的侧链。证据表明底物的负羧基与酶上的精氨酸形成氢键，而锌与肽羰基的氧原子形成键。Zn-OH 或 Zn-OH₂ 组合似乎是与羰基碳反应的基团，在酶的谷氨酸羧基的协助下，将 H⁺ 从结合的水转移到氨基酸产物。已经制备了一种人工肽酶模型化合物，其中 Cu(II) 由链中的四个氮原子结合，链末端为胍离子，所有这些都连接到交联的聚苯乙烯。对带有羧基的酰胺的水解具有很高的催化活性，类似于羧肽酶活性。胍基上的 H⁺ 可以与羧基形成氢键，将底物固定在靠近 Cu 的位置，Cu 是活性位点。