结构生物化学

结构生物化学是生命科学的一个分支，特别是生物化学，它结合了生物学、物理学和化学来研究生物体，并总结所有生命形式共享的一些共同的物理化学基础原理。它也被更广泛地称为结构生物学。结构生物化学家旨在以原子精度级别，分子术语来描述所有生物体所有代谢共享的结构、机制和化学过程，提供所有生命形式以其多样化形式存在的组织原则。

结构生物化学与其他科学的关系

物理学

1. 热力学
   1. 热力学第零定律
   2. 热力学第一定律
   3. 热力学第二定律
      1. 热力学循环
   4. 热力学第三定律
   5. 内能
   6. 熵
   7. 焓
   8. 热容
   9. 自由能
   10. 物质平衡
   11. 相图
   12. 相平衡
   13. 吸能反应
   14. 放能反应
   15. 分子热力学
   16. 热力学平衡
   17. 理想气体
   18. 理想气体过程计算方程
   19. 不可逆过程
   20. 维里方程的应用
2. 生物能量学
3. 化学反应中的能量耦合
4. 代谢
   1. 合成代谢
   2. 分解代谢
5. 生物物理学 - 单分子技术

化学

1. 化学键
   1. 共价键
   2. 非共价键
   3. 氢键
   4. 疏水相互作用
   5. 范德华相互作用
   6. 偶极相互作用
   7. 离子相互作用
   8. 二硫键
      1. 形成二硫键的多种方法
   9. 电子结构理论
2. 生化自然选择
   1. 电子结构理论
3. 有机化学
   1. 有机官能团
      1. 羟基
      2. 羰基
      3. 羧基
      4. 氨基
      5. 酰胺
      6. 巯基
      7. 磷酸酯
   2. 有机合成
   3. 大分子类型
      1. 碳水化合物
      2. 核酸
      3. 脂类
      4. 蛋白质
   4. 试剂
   5. 有机分子机制
   6. 有机分子的立体化学
   7. 生物化学中重要有机分子的化学
      1. 维生素和辅因子
      2. 维生素D
      3. 维生素K
      4. 维生素C
      5. 维生素A
      6. 维生素E
      7. 维生素B
         1. 维生素B12
         2. 维生素B6
   8. 生物化学中重要的有机反应
      1. 肽键
   9. 有机化学技术
      1. 分离和分离方法
      2. 纯化方法
      3. 鉴定方法
      4. 燃烧分析方法
      5. 费歇尔酯化反应
      6. 酯交换反应
   10. 有机化学术语
   11. 合成
   12. 有机金属化学
       1. 生物有机金属化学
   13. 不饱和度
   14. 酸碱化学
4. 无机化学
   1. 金属
      1. 碱金属
      2. 碱土金属
      3. 过渡金属
      4. 贫金属
      5. 稀土金属
      6. 金属离子的生物学作用
      7. 氧化态
      8. 铜金属伴侣蛋白
      9. 金属的生物修复
   2. 准金属/类金属
      1. 多孔硅的介绍
      2. 碳纳米材料
   3. 非金属
      1. 卤素
      2. 惰性气体
   4. 原子轨道的线性组合
   5. 分子轨道
   6. 如何构建分子轨道图
   7. 化简公式和投影算符
5. 点群
6. 特征表
7. SALC
8. 化学反应
   1. 速率定律
   2. 动力学和热力学控制
   3. 反应类型
9. 分子几何
10. 周期性趋势
    1. 原子半径
    2. 电子亲和力
    3. 电负性
    4. 电离能
    5. 金属行为
    6. 熔点
11. 药物化学
12. 晶体固态
    1. 公式和结构
13. 普通化学
    1. 有效数字
    2. 物质

生物学

1. 生物体的特性
2. 类维生素A

进化

1. 地球的历史
2. RNA世界假说
3. 实验室进化
4. 人类的进化
5. 种群的进化
6. 奥巴林-霍尔丹假说
7. 分子进化
8. 生命的三域
   1. 古菌
      1. 古菌中的SAMPylation蛋白
   2. 细菌
   3. 真核生物
      1. 群落生态学
9. 内共生学说
10. 膜的进化
11. 铝和硅的自然选择
12. 物种形成
13. 基因流动
14. 生物学和进化生物学
15. 哈代-温伯格原理

细胞

1. 细胞器和结构生物化学
   1. 细胞核
   2. 核仁
   3. 核糖体
      1. 核糖体合成
      2. 成熟
      3. RNP
   4. 叶绿体
   5. 蛋白质
   6. 内质网
      1. 内质网应激与2型糖尿病
   7. 高尔基体
   8. 线粒体
      1. 心磷脂和线粒体
   9. 中心体
   10. 胞质溶胶
   11. 溶酶体
   12. 过氧化物酶体
   13. 细胞骨架
   14. 真核细胞器的功能类别
   15. 植物细胞
       1. 热应激反应
       2. 纤维体
   16. 动物细胞
       1. 膜接触位点
   17. 用X射线成像细胞结构
   18. 荧光
   19. 细胞衰老
   20. 细胞粘附
2. 原核生物和真核生物
   1. CRISPR防御系统（原核生物）
   2. 原核生物基因表达的控制
   3. 真核生物基因表达的控制
   4. 真核生物可变剪接
   5. 真核生物中的金属含量
3. 干细胞
   1. 胚胎干细胞
   2. 成体干细胞
4. 细胞转化能量
   1. 代谢耦合反应
   2. ATP
   3. 乙酰辅酶A
   4. 糖酵解和糖异生
      1. 无氧呼吸（发酵）
      2. 有氧呼吸
      3. 丙酮酸脱氢酶复合体
      4. 三羧酸循环（柠檬酸循环）
      5. 氧化磷酸化循环（电子传递链循环）
      6. 糖异生
      7. 磷酸果糖激酶-1
         1. 微量纯化
   5. 光反应
   6. 卡尔文循环
   7. 戊糖磷酸途径
5. 控制系统
   1. 神经系统
      1. 帕金森病
   2. 循环系统
   3. 排泄系统
   4. 呼吸系统
      1. 哮喘/哮喘症状
   5. 消化系统
      1. 乳糖不耐受
      2. 克罗恩病
      3. 肝硬化
   6. 肌肉系统
   7. 内分泌系统
      1. 卵巢癌
      2. 甲状腺机能亢进症
      3. 艾迪生病
   8. 感觉系统
      1. 视觉的生化途径
   9. 免疫系统
   10. 皮肤系统
   11. 生殖系统
6. 细胞信号通路
   1. 旁分泌信号
   2. 自分泌信号
   3. 内分泌信号
   4. G蛋白和G蛋白偶联受体
   5. 腺苷酸环化酶和cAMP信号传导
   6. 磷酸肌醇信号传导
   7. 钙信号传导
   8. 蛋白激酶信号级联
   9. 受体酪氨酸激酶
   10. 激酶抑制剂
       1. MPS1蛋白激酶抑制剂开发
   11. 胰岛素信号传导
   12. 表皮生长因子信号传导
   13. RAS
   14. ROS
   15. 导致癌症的信号传导问题
   16. 转化生长因子β
   17. 激素信号传导
   18. 细胞凋亡
   19. RAGE：模式识别受体
   20. 移动锌和一氧化氮
   21. 一氧化氮
   22. 硫酸肝素
   23. 骨骼肌重塑
   24. 吞噬凋亡
   25. 坏死
   26. 信号传导中的噪声
   27. Hippo信号传导
   28. JNK信号传导
   29. 免疫信号传导
       1. RIG-I样受体（RLR）
       2. NOD样受体（NLR）
       3. IL23R
   30. 细胞凋亡诱导因子
   31. 脂肪生成：从干细胞到脂肪细胞
   32. 一氧化氮和cGMP反应
7. 分泌蛋白
8. 显微镜
9. 内吞作用
   1. 内吞作用期间的肌动蛋白组装
10. 病毒通过内吞作用进入
11. 有丝分裂纺锤体
12. 菌毛
    1. IV型菌毛
13. 鞭毛
14. 衰老和代谢控制分析
15. 短线性基序和病毒感染
16. 吞噬作用
17. 胞饮作用
18. 细胞因子受体
19. Ras-ERK和PI3K-mTOR通路

遗传学

1. 细菌的遗传学
2. 突变等位基因的特性
3. 遗传学的基础
4. 遗传学术语
5. 遗传模式
6. 染色体
7. 表观基因组学
   1. 表观基因组阅读器
8. 有丝分裂
9. 减数分裂
10. 同源框基因
11. 如何知道细胞中的基因是“开启”还是“关闭”？
12. 遗传变异
13. 结构变异

癌症生物学

1. DNA修复缺陷
2. 癌症分类
   1. 癌
   2. 肉瘤
   3. 淋巴瘤
   4. 白血病
   5. 生殖细胞肿瘤
   6. 母细胞瘤
3. 诱变
   1. 埃姆斯试验
4. 肿瘤抑制基因
   1. PTEN
   2. p53
   3. p63
   4. p73
   5. sequestosome-1
   6. 视网膜母细胞瘤
   7. p62
   8. Brooke-Spiegler综合征
5. 癌症中的谷氨酰胺成瘾
6. 配体结合位点和谷氨酸受体运输
7. 原癌基因

药物设计与医药

1. 药物靶点
2. 量子点-适体偶联物
3. 药物剂型
   1. 固体剂型
   2. 液体剂型
   3. 外用剂型
   4. 眼用剂型
   5. 其他剂型
4. 药物平台
5. 药物分类
6. 药物开发挑战
7. 扎那米韦和奥司他韦的开发和发现用于各种疾病
8. 药物临床开发
9. 管制药物法案
10. 天然产物的贡献
11. 药物如何穿过细胞膜
12. MDR 泵
13. 对药物的反应
14. 流感病毒
15. 阿普唑仑
16. 氨甲喋呤
17. 阿司匹林
18. 缬沙坦
19. 强力壮
20. 泰诺
21. 百忧解
22. 炭疽
23. 苯乙肼
24. 法莫替丁
25. 硝苯地平
26. 伊马替尼
27. 鲁沃
28. 炔诺酮
29. 紫杉醇
30. 非索非那定
31. 阿德拉
32. 利他能
33. 帕罗西汀
34. 帕辛
35. 大麻
36. 苯海拉明
37. 泼尼松
38. 烟草和尼古丁
39. 酒精
40. 对乙酰氨基酚
41. 维柯丁
42. 叶酸
43. 亚胡斯卡
44. 伟哥（西地那非枸橼酸盐）
45. 利他能
46. 逆转录酶抑制剂/AZT
47. 药物拮抗剂
48. 酪氨酸激酶抑制剂
49. 耐药性
50. 抗病毒药物
51. 氯胺酮
52. 摇头丸
53. 可卡因
54. 华法林
55. 布洛芬
56. 氯雷他定
57. 耐信
58. 甲氨蝶呤
59. 万古霉素
60. 沙利度胺
61. 辛伐他汀
62. 大脑中的药物奖赏通路
63. 赫勒氏综合征及其治疗方法
64. 基于 RNA 的药物
65. 抗生素
66. 前药
67. 选择性 serotonin 再摄取抑制剂
68. 药物通过身体的阶段
69. 他汀类药物
70. 咖啡因
71. 麦角酸二乙酰胺
72. 甲基苯丙胺
73. 米诺环素
74. 睾酮和合成代谢-雄激素类固醇 (AASs)
75. 羟考酮
76. 避孕药
77. 吗啡
78. 异丙酚
79. 利妥昔单抗
80. 紧急避孕药
81. 药物给药途径
    1. 外用
       1. 经皮
       2. 滴眼液
       3. 吸入
       4. 鼻腔给药
    2. 肠内
       1. 口服
       2. 直肠
       3. 舌下
    3. 肠外
       1. 静脉注射
       2. 肌肉注射
       3. 皮下注射
       4. 动脉内注射
       5. 皮内注射
       6. 透皮
       7. 黏膜
       8. 吸入
82. 药代动力学
83. PTP1B
84. 安非他明
85. 保幼激素
86. 苯丙酮尿症 (PKU)
87. 抗生素
88. 呋塞米
89. 维生素C
90. 蓝肽
91. ADME
92. 药理学

实验室与临床的关系

1. 转化科学
   1. 糖尿病
   2. 阿尔茨海默病
2. 个体化医疗
3. 模式生物
4. 弥合基础研究和临床研究之间的差距

组织学

1. 染色类型
   1. 苏木精-伊红染色

神经科学

1. 神经元
   1. 动作电位
   2. 静息电位
   3. 神经元内的信号传导
2. 神经胶质细胞
3. 神经化学
   1. 神经递质
4. 轴突运输和疾病
   1. 多发性硬化症
5. 突触
6. 通道病
7. 大脑发育阶段
   1. 神经诱导
   2. 增殖
   3. 迁移
   4. 分化
   5. 突触发生
   6. 细胞死亡/稳定
   7. 突触重排
8. 神经退行性疾病
9. 神经珠蛋白
10. 运动系统
    1. 基底神经节
    2. 小脑

系统生物学

1. 程序性细胞死亡分析

生物信息学

1. 同源性
2. 序列比对
3. 结构比对
4. 蛋白质结构比对的进展和缺陷
   1. 用于结构比对的程序
      1. DALI
      2. 组合延伸
      3. SSAP
      4. GANGSTA+
      5. MAMMOTH
      6. RAPIDO
      7. SABERTOOTH
      8. TOPOFIT
   2. RNA 结构比对
5. 进化树
6. 生物成像
7. 组合化学
8. 比较基因组学
9. 转基因动物
   1. 监管
10. 蛋白质折叠识别
11. SIRCh 生物信息学链接（精选互联网资源）
12. Fold.it

分子建模

1. 分子对接
2. 经典分子动力学
3. PDF 中的交互式 3D 模型

思维惯性

1. 错误建立的结果
2. 对机制作用的错误理解

水

1. 独特特性
2. pH 值
3. 缓冲液
4. 渗透
5. 极性
6. 水气反应

蛋白质

1. 氨基酸
   1. D-酶的全部化学合成：HIV-1 蛋白酶的对映异构体显示了互补手性底物特异性的证明
   2. 固氮
   3. 氨基酸降解
   4. 氨基酸生物合成
   5. 蛋白质/了解阿尔茨海默病 β-淀粉样蛋白结构的最新进展
2. 蛋白质
   1. 结构
   2. 表面层蛋白
   3. 蛋白质折叠
   4. 拉马钱德兰图
   5. 蛋白质折叠问题
   6. 核糖体上的蛋白质折叠
   7. 细菌内膜蛋白的组装
   8. 蛋白质折叠成新的酶
   9. 纤维蛋白
   10. 未折叠蛋白反应
   11. 剪接蛋白的信号控制
   12. 分析和可视化蛋白质结构的残基网络
   13. 帮助蛋白质-蛋白质对接的结合位点预测
3. 开发蛋白质结构的新分类
4. 研究蛋白质的技术
   1. 使用荧光显微镜计数蛋白质
5. 蛋白质稳态
   1. 合成
      1. 非核糖体肽合成
      2. 细菌蛋白质合成
   2. 纯化
      1. 差速离心
      2. 盐析
      3. 毛细管电泳
      4. 高效液相色谱 (HPLC)
         1. 凝胶过滤色谱
         2. 离子交换色谱
         3. 亲和色谱
         4. 疏水相互作用色谱 (HIC)
         5. 柱色谱
         6. 平面色谱
            1. 纸色谱
            2. 薄层色谱
         7. 气相色谱
         8. 液相色谱
      5. 等电聚焦
      6. 透析
      7. 微型纯化
   3. 纯化结果分析
      1. 蛋白质鉴定
         1. 醋酸纤维素电泳
      2. 蛋白质定量
         1. 凝胶电泳
         2. SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳埃德曼降解
         3. SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳埃德曼降解
         4. 区域离心
         5. 布拉德福德法
      3. 量子点
      4. 膜蛋白分析
         1. VDAC-1 及其溶液 NMR 分析
   4. 分析超速离心
   5. 交联技术
   6. 蛋白质序列测定技术
      1. 蛋白质的蛋白水解分析
      2. 质谱
   7. 蛋白质结构测定方法
      1. 核磁共振波谱
      2. 氘代交换质谱
      3. X 射线晶体学
      4. 冷冻电子显微镜
      5. 红外光谱
      6. 中子衍射
      7. 蛋白质结构的连续理论
   8. 使用祖先基因重建分析蛋白质结构和功能
   9. 使用光谱法测量酶活性
   10. 蛋白质糖基化
   11. 脊椎动物和无脊椎动物蛋白水解级联的比较
   12. 腺苷酸环化酶的构象变化控制信号转导的调节
   13. 朊病毒蛋白错误折叠和疾病
   14. 免疫学：蛋白质分析的另一种方法
       1. 抗体和抗原的相互作用
          1. 凝集反应
       2. 抗体在蛋白质研究中的应用
          1. 酶联免疫吸附测定 (ELISA)
          2. 蛋白质印迹
          3. 荧光标记
          4. 酶联免疫斑点测定 (ELISpot)
       3. 单克隆抗体的制备
          1. 单克隆抗体生产来源
       4. 多克隆抗体的制备
       5. 动态光散射
   15. 位点预测
   16. 蛋白质错误折叠和人类疾病
6. 蛋白质翻译
   1. 肉豆蔻酰化
   2. 内部核糖体进入位点
7. 蛋白质修饰
   1. 棕榈酰化
   2. 异戊烯化
8. 蛋白质翻译后修饰
   1. 腺苷酸化
   2. ADP-核糖基化
   3. 乙酰化
   4. 组蛋白修饰
      1. 快速信号和缓慢标记：组蛋白修饰的动态
9. 蛋白激酶介导的蛋白质磷酸化
   1. NMP 激酶
   2. 磷酸酶 PHLPP
   3. 磷脂酰丝氨酸结合基序和 PKC
   4. 磷脂酰肌醇同源结构域富含亮氨酸重复序列蛋白磷酸酶
10. 磷酸化的检测
11. 蛋白质在信号转导中的作用
12. 整合素蛋白
13. 腺苷酸环化酶的构象变化控制信号转导的调节
14. 通过 O-连接的 β-N-乙酰氨基葡萄糖 (O-GlcNAc) 进行的蛋白质 O-GlcNAc 修饰
15. 脂质介导的蛋白质乙酰化
    1. 蛋白质被脂肪酸修饰
16. 蛋白质功能
    1. 结构
    2. 结合
       1. 肌红蛋白
       2. 血红蛋白
       3. 血蓝蛋白
       4. 蛋白质-蛋白质相互作用网络
    3. 催化
       1. 酶分类
       2. 蛋白酶
    4. 切换
17. 监管
    1. 干扰素
    2. HIF
    3. HIF 开关
    4. VHL
18. 溶菌酶
19. Oct 蛋白
20. 拉福拉病
21. 其他不常见的氨基酸
22. 固有无序蛋白
23. 稳定性、突变和可进化性
24. 蛋白质无序
25. 非核糖体肽合成酶 (NRPSs)
26. 克服蛋白质晶体学挑战
27. 蛋白质进化
28. 沉默信息调节蛋白
29. 胶原蛋白
30. 丝氨酸蛋白酶抑制剂
31. 糖蛋白
    1. 埃博拉病毒
32. 蛋白质设计
33. 蛋白质设计与药物递送
34. 药物递送
35. β-螺旋桨蛋白
36. WD40 结构域
37. Bub1 和 BubR1
38. APOBEC3G
39. 谷胱甘肽还原酶
40. TAX1BP1
41. TPD-43

蛋白质功能

1. 结合
   1. 构象选择
   2. 配体
      1. 金属结合位点
   3. 结合位点
   4. 锁和钥匙
   5. 诱导契合
   6. 过渡态模型
   7. 协同性
2. 跨膜蛋白
   1. α-螺旋膜蛋白
3. 肌红蛋白
   1. 血红素基团
      1. 胆红素
   2. 金属离子的生物学作用
   3. 肌红蛋白的氧结合曲线
   4. 其他珠蛋白
4. 血红蛋白
   1. 血红蛋白-血红素基团
   2. 镰状细胞性贫血
   3. 地中海贫血
   4. AHSP
   5. 波尔效应
   6. 亲和常数
   7. 解离常数
   8. 监管
   9. 2,3-二磷酸甘油酸 (2,3-BPG) 调节
   10. 氧结合曲线
   11. 其他珠蛋白
5. 抗体
   1. 表位
   2. 抗原
   3. 主要组织相容性复合体 (MHC)
      1. I 类 MHC
      2. II 类 MHC
   4. 抗体酶
6. 肌球蛋白
7. 肌动蛋白
8. 胰岛素
9. DNA 结合
10. 荧光蛋白
11. G 蛋白
12. LPA 受体
13. G 蛋白机制
14. 铁蛋白
15. 铁载体
16. “模糊”相互作用组
17. 蛋白质折叠和伴侣蛋白
    1. 蛋白质折叠速率
    2. 热休克蛋白
18. CCN 蛋白
19. 朊病毒蛋白
20. 细菌蛋白
21. 泛素
22. Cdc48
23. TGFβ 和整合素
24. AB5 毒素
25. PHD 指
26. TATA 结合蛋白
27. 伴侣蛋白
    1. HSP90
28. 功能归属
29. 未折叠蛋白反应
30. TDP-43

膜蛋白

1. 主动运输
2. 被动运输
3. 膜梯度和热力学
4. P 型 ATP 酶
5. ATP 结合盒蛋白
6. 同向转运蛋白
7. 反向转运蛋白
8. 单向转运蛋白
9. 离子通道
   1. 膜片钳
   2. 瞬时受体电位通道
10. 配体门控离子通道
11. 间隙连接
12. 水通道
13. 核孔复合体
14. 协同转运蛋白
15. 控制系统：神经系统
16. 膜蛋白的进化
17. 蛋白质功能的组织方案
18. 研究膜蛋白的方法
    1. 溶液核磁共振波谱
    2. 膜中蛋白质的电子晶体学
    3. 冷冻电镜断层扫描和 3D 图像平均
19. 膜蛋白组装成复合物
20. 拓扑
21. G 蛋白偶联受体
22. 多药耐药泵
23. 脂双层中蛋白质结构的研究：电子晶体学
24. 折叠
25. 膜曲率
26. 疏水性标度
27. 融合和裂变中的膜蛋白应力
28. 粘膜系统
29. 促胰液素
30. 药物金刚烷胺与流感病毒 M2 蛋白质质子通道的结合
31. TA 蛋白 (GET) 途径在年轻男性中的应用

碳水化合物

1. 单糖
   1. 单糖的立体化学
2. 通过高碘酸裂解阐明碳水化合物结构
3. 酮糖
4. 醛糖
5. 二糖
6. 寡糖
7. 使用糖苷酶对寡糖进行测序
8. 多糖
9. /Carbohydrates/Chitin
10. 聚糖
11. 肽聚糖生物合成
12. 糖蛋白
13. 碳水化合物衍生物
14. 碳水化合物和蛋白质
    1. 凝集素
    2. 糖胺聚糖
    3. 蛋白聚糖
    4. 血型
    5. 病毒
       1. HIV 感染背后的机制
15. 碳水化合物代谢
16. 糖原分解

脂类

1. 脂肪酸
   1. 三酰甘油
2. 胆固醇
   1. 胆固醇的生物合成
   2. 脂蛋白
3. 生物膜
4. 膜脂
5. 膜转运
6. 膜融合
7. 膜裂变
8. 胶束
9. 脂双层
10. 膜流动性
11. 流动镶嵌模型
12. 研究膜的技术
    1. 电子显微镜
    2. 双层和囊泡的制备
    3. 扫描量热法
    4. 荧光光漂白
13. 蜡、肥皂和洗涤剂
    1. 脂肪蜡
    2. 肥皂
    3. 洗涤剂
14. 异戊二烯
15. 脂筏
16. /Lipids/Sample Preparation for Mass Spectrometry-Based Lipidomics Studies
17. 基于质谱的新型脂质结构测定
18. 受体介导的内吞作用
19. 生物合成
    1. 三酰甘油
20. 脂质激活蛋白激酶
21. 奇数链和不饱和脂肪酸的降解
22. 脂质体
23. 脂滴和细胞脂质代谢

核酸

1. 结构
   1. 磷酸酯
   2. 糖
      1. 脱氧核糖
      2. 核糖
   3. 含氮碱基
      1. 嘌呤
         1. 腺嘌呤
         2. 鸟嘌呤
         3. 嘌呤
         4. 次黄嘌呤
         5. 黄嘌呤
         6. 可可碱
      2. 嘧啶
         1. 胞嘧啶
         2. 尿嘧啶
         3. 胸腺嘧啶
      3. 核糖核苷酸还原酶
   4. 核苷酸
2. 单体之间的连接
3. DNA
   1. DNA 结构
      1. 端粒
      2. 非典型结构
   2. 超螺旋和核小体
   3. 回文序列
   4. DNA 变性
   5. 艾弗里-麦克莱奥德-麦卡锡实验
   6. 赫希-蔡斯实验
   7. 查加夫的实验
   8. 沃森和克里克的文章
   9. 富兰克林的 DNA X 射线晶体学
   10. 复制过程
       1. DNA 聚合酶
       2. DNA 启动
   11. 梅塞尔森-斯塔尔实验
   12. 基因敲除小鼠
   13. 转基因动物
   14. 转基因植物
   15. 低色效应
   16. DNA 修复
       1. 错配修复
       2. DNA 链断裂修复中的多核苷酸激酶/磷酸酶
   17. DNA 包装
   18. DNA 作为纳米材料
   19. 结构 DNA 纳米技术
   20. 霍利迪连接
   21. 增殖基因和抗增殖基因
   22. 蛋白质-DNA 识别
   23. 介体介导的转录调控
   24. 染色质和衰老
   25. 哺乳动物 SIRT6 介导的染色质调控和基因组维持
4. RNA
   1. 信使 RNA (mRNA)
      1. 无义介导的 mRNA 降解
   2. 转运 RNA (tRNA)
   3. 核糖体 RNA (rRNA)
   4. 小 RNA
      1. 微小 RNA (miRNA)
   5. 其他 RNA
   6. RNA 聚合酶
      1. RNAP 的单分子研究
   7. RNA 依赖性 RNA 聚合酶
   8. RNA 解旋酶
   9. 核糖开关
   10. RNA 折叠
       1. RNA 的机械展开
   11. 短 RNA
       1. 盐对机械折叠的影响
   12. RNA 干扰 (RNAi)
       1. RISC (RNA 诱导的沉默复合体)
   13. DNA 和 RNA 之间的差异
   14. 转录
       1. 核酸
       2. 转录
       3. 逆转录
       4. RNA 聚合酶 II
   15. mRNA 加工和转运
   16. 翻译
   17. RNA 修饰
       1. 内含子
       2. 外显子
       3. RNA 剪接
       4. snRNP
   18. RNA 降解
       1. RNaseT2 功能
       2. 核糖核酸酶
   19. 端粒
   20. RNA 纯化
   21. RNA 提取
   22. 短 RNA (sRNA 测序)
   23. 线虫 RNA
   24. RNA 二级结构
   25. 制作 RISC
   26. 逆转录病毒 Gag 蛋白与 RNA 的多种相互作用

1. DNA 操作技术
   1. /Maintaining Genome Integrity
   2. 限制性内切酶
   3. Southern 印迹
   4. Northern 印迹
   5. DNA 测序
   6. DNA 编目
   7. DNA 合成
   8. DNA 扩增
   9. 酒精沉淀
   10. 基因调控
       1. 合成生物学
       2. 锌指
       3. 代谢物
       4. REM
   11. 细菌转化技术
2. 遗传密码
3. 基因表达
   1. 染色质的守门员：小型代谢物在基因表达中引起巨大变化
4. DNA 突变
   1. 转座子
   2. 拷贝数变异
   3. 遗传性疾病
      1. 泰-萨克斯病
   4. 线粒体疾病
      1. 杜氏肌营养不良症
5. 克隆酶
   1. 用于克隆的酶
      1. T4 DNA 连接酶
      2. T4 RNA 连接酶
      3. T4 多核苷酸激酶
      4. 小肠碱性磷酸酶
      5. RecA 蛋白
      6. AgarACE^® 酶
   2. 克隆提示
   3. DNA 克隆和载体插入过程
   4. 免疫系统
6. 基因组调控
7. 基因组分析
   1. DNA凝胶电泳
   2. DNA 微阵列
   3. 测序基因组
   4. 单核苷酸多态性 (SNP)
   5. 基因组分析对医学的影响
   6. 核型分析
8. DNA 重组技术
   1. 噬菌体 λ 的历史和研究
   2. 质粒
      1. 裂解途径
      2. 溶源途径
   3. 基因组文库
   4. 检测特定基因
   5. 诱变
   6. 设计基因
   7. 人类基因组计划
   8. 基因治疗
   9. 人工染色体
      1. 细菌人工染色体 (BAC)
      2. 细菌人工染色体 (BAC)
   10. 电穿孔
   11. 293T 细胞

1. 1. 1. 细菌革兰氏染色
   2. 遗传和相关实验
   3. DNA 的定向改变
   4. 真核重组
2. 单分子 DNA 测序
3. 环境中重组 DNA 测定方法
4. 聚合酶链式反应
   1. PCR 的执行方式
   2. PCR 的应用
5. 未来的 DNA (DNA 的多种形式)
6. 线粒体 DNA
7. ATP
8. 基因和基因产物的功能归属
9. 30nm 染色质纤维

催化

1. 酶
   1. 结合能
   2. 脱溶剂化
   3. 状态：基态、前稳态和稳态
   4. 辅酶
   5. 辅因子
   6. 辅基
   7. 脱辅基酶和全酶
   8. 活性位点和酶的特异性
   9. 催化三联体
   10. 酶的进化
   11. 过渡态结合原理
2. 酶原
3. 吉布斯自由能图
   1. 过渡态
   2. 活化能
   3. 反应中间体
4. 速率和常数
   1. 速率常数
   2. 速率方程
   3. 速率限制步骤
   4. 平衡常数
   5. 初始速率
5. 机制
   1. 酸碱催化
   2. 共价催化
   3. 金属离子催化
   4. 近似催化
6. 米氏方程
   1. 米氏常数
   2. K_cat/K_M
   3. 动力学完美
   4. 最大速度
   5. 顺序反应
   6. 双置换反应
   7. 乒乓机制
   8. 变构酶
7. 双倒数图
8. 可逆抑制剂
   1. 竞争性抑制剂
   2. 非竞争性抑制剂
   3. 非竞争性抑制剂
9. 不可逆抑制剂
   1. 基团特异性试剂
   2. 亲和标签
   3. 自杀性抑制剂
10. 时间依赖性抑制
11. 过渡态类似物
12. 青霉素
13. pH 对酶活性的影响
14. 定点诱变
15. 多底物反应
16. 催化抗体
17. 温度对酶活性的影响

特定酶和催化机制

1. 蛋白酶
   1. 水解
   2. 胰凝乳蛋白酶
   3. 半胱氨酸蛋白酶
   4. 天冬氨酸蛋白酶
   5. 丝氨酸蛋白酶
   6. 苏氨酸蛋白酶
   7. 金属蛋白酶
   8. 催化三联体和 S₁ 口袋
   9. AAA+ 蛋白酶
   10. HIV-1 蛋白酶
2. 脱氢酶
3. 苯丙氨酸羟化酶 (PAH)
4. 碳酸酐酶
5. 羧肽酶
6. 激酶
   1. 细胞周期蛋白依赖性激酶
   2. MPS1
7. 细菌核糖体组装的生物物理研究
8. 限制性内切酶
   1. BamHI
   2. EcoRI
   3. HindIII
   4. XbaI
9. 谷胱甘肽还原酶
10. 核苷酸单磷酸激酶
11. 菲利普斯机制
12. 异构酶
    1. 磷酸三糖异构酶
13. 乒乓机制
14. 乙酰转移酶
15. 脱乙酰基酶
16. 自由基-SAM 酶
    1. FeMo 辅因子和 FeFe-氢化酶
17. 总结
18. 膜转运
19. 冷适应酶
20. 胆固醇 24-羟化酶
21. 细胞色素 b6f 复合体
22. 细胞色素 P450 酶
23. 脱氨酶
24. 药物代谢酶
25. MAO B 酶
26. 环氧合酶
27. PLC 酶
28. 多核苷酸激酶/磷酸酶
29. NLR 传感器
30. GTPase
31. 棕榈酰转移酶

酶调节

1. 反馈抑制
2. 同工酶
   1. 酶调节/同工酶分析
   2. 酶调节/酶和代谢物相互作用以及基于 RNA 的基因调控
3. 可逆共价修饰
   1. 磷酸化
   2. 泛素化
      1. 通过多价相互作用实现泛素的多任务处理
   3. 甲基化
   4. 乙酰化
   5. 腺苷酸化
   6. 肉豆蔻酰化
   7. 蛋白质赖氨酸乙酰化在代谢中的作用
4. 蛋白水解激活
5. 酶级联
6. 转录激活
7. 变构控制
8. 不可逆抑制
9. 氨基酸感应和转运

激素

1. 睾酮
2. 雌激素
3. 外源激素
   1. 烷基酚
4. 人绒毛膜促性腺激素
5. 信息素
6. 胃泌素
7. 肾上腺素
8. 人胎盘生乳素

关键词

1. 一般术语
2. 蛋白质术语
3. 有争议的术语
4. 碳水化合物术语
5. 脂类和细胞膜术语
6. DNA 和 RNA 术语
7. 进化和生物信息学术语
8. 酶术语
9. 细胞凋亡

有影响力的结构生物化学家

1. 多萝西·克劳福特·霍奇金
2. 阿尔贝·克劳德
3. 克里斯蒂安·德·迪夫
4. 文卡特拉曼·拉马克里希南
5. 罗杰·D·科恩伯格
6. 伊丽莎白·F·诺菲尔德
7. 伊万·贝尔克斯
8. 詹姆斯·C·王
9. 加藤昌彦
10. 马蒂亚斯·W·亨特兹
11. 罗莎琳德·富兰克林
12. 月歧茂
13. 保罗·D·博耶
14. 玛丽亚·马纳西娜
15. 弗雷德里克·桑格
16. 埃德温·G·克雷布斯
17. 约翰·C·肯德鲁
18. 塞尔曼·A·瓦克斯曼
19. 威廉·H·斯坦
20. 瓦茨拉夫·L·克雷托维奇
21. 莱纳斯·鲍林

天然产物

1. 碳-磷键

趋性

1. 趋化性

生物化学在医学中的应用

1. 一氧化碳：一个隐形杀手
2. 由于膜脂异常积累导致的人类遗传性疾病
3. 多吃水果和蔬菜！维生素 C 如何对抗坏血病
4. X 射线晶体学
5. 靶向肿瘤细胞的抗体

生物化学在动物中的作用

1. 费氏弧菌：让光明来临

神经精神疾病中的生化作用

1. 精神分裂症
2. 自闭症
3. 双相情感障碍
4. 亨廷顿舞蹈症

结构生物化学论文主题

1. RNA 识别基序，一个可塑的 RNA 结合平台，用于调节转录后基因表达
2. 程序性坏死细胞损伤的分子调控
3. 核糖体介导的狂犬病病毒囊泡性口炎病毒的翻译起始
4. MPS1 蛋白激酶家族

参考文献

1. The Free Dictionary. Mosby's Medical Dictionary, 8th Edition. © 2009, Elsevier., 2009. Web. 28 Oct. 2012. http://medical-dictionary.thefreedictionary.com/compartment+model.
2. 张亮方. "Controlled Drug Delivery Systems." CENG 207 Lecture 9 “Pharmacokinetics of Drug Dispersion”. University of California, San Diego, La Jolla. 10 May 2012. Lecture.
3. Dhillon, Soraya and Gill, Kiren. "Basic Pharmacokinetics." 28 Oct. 2012. http://www.pharmpress.com/files/docs/clinical_pharmacokinetics_samplechapter.pdf