结构生物化学/催化机制/近似催化

近似催化

通过随机碰撞碰巧聚在一起的底物与底物反应部分接触的可能性更小。因此，酶可以采用一种称为**近似催化**的策略，通过这种策略，酶将两种底物结合在一起以提高反应速率。这种策略利用了结合能，并将底物定位在正确的方向以使反应进行。通常，在一个反应中，平移熵和旋转熵会损失。在反应中，过渡态比基态更有序，使得 ΔS 为负。这种反应发生在酶的活性位点，底物和催化基团会像一个分子一样起作用，防止平移和旋转能量的损失。反应首先从两个能够相互找到的分子开始，这使得反应速率取决于反应物的浓度。这是因为分子相互找到的可能性更高。

一些例子

近似催化的一个例子是当 NMP 激酶[[1]] 将两个核苷酸结合在一起以促进磷酰基从一个核苷酸转移到另一个核苷酸。通过添加三磷酸腺苷 (ATP)，磷酸基团被放置在 NMP 激酶的磷酸基团旁边。这有利于磷酸基团在两个分子之间转移。