醋酸纤维素电泳利用天然蛋白质的电荷,根据蛋白质的等电点进行分离。
在醋酸纤维素条带的标记中心点上滴加蛋白质样品,将条带置于所需pH的巴比妥缓冲液中,并在条带两端施加电压。向阳极迁移的蛋白质的pI大于缓冲液的pH,而向阴极迁移的蛋白质的pI小于缓冲液的pH。带正电荷的蛋白质迁移到阴极,而带负电荷的蛋白质迁移到阳极。
醋酸纤维素电泳可用于识别由不同亚型形成的多聚体蛋白,因为每种亚型比例由于氨基酸结构的不同而具有不同的电荷。