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结构生物化学/酶催化机制/脱氢酶

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脱氢酶

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脱氢酶催化醇类氧化为羰基化合物,使用 NAD+ 或 NADP+。一些脱氢酶对一种辅酶具有特异性。此反应可被 NADH 或 NADPH 还原。在醇的氧化中,脱氢酶中的一种转移到 NAD+ 的烟酰胺环的 4 位,通过去除两个氢原子。因此,羰基是由该反应产生的。此反应具有立体专一性。该酶可以攻击环的任一侧,导致不同的构象和特性。具有 syn 构象的酶将更快地催化羰基的还原反应。具有 anti 构象的酶比前一种酶反应性更低。存在不同类型的脱氢酶,其中一些简要介绍如下。

1. 醇脱氢酶

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醇脱氢酶催化醇类与醛类和酮类反应,使用 NAD+ 作为辅酶。它还在酶底部具有锌离子位点。在催化过程中,锌离子与 NAD+ 结合。在机制上,辅酶通过氧化酶中的醇与酶结合。酶-NADH 复合物的解离是速率决定步骤。

2. L-乳酸脱氢酶

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L-乳酸脱氢酶通过使用 NAD+ 作为辅酶,氧化 L-乳酸与丙酮酸的可逆反应。醇基变为酶的羰基。L-乳酸或丙酮酸通过辅酶与酶结合。因此,辅酶总是先与酶结合。其他底物也可能与酶结合。乳酸脱氢酶在糖酵解中起着至关重要的作用。为了使糖酵解发生,必须有 NAD+ 可用。在厌氧条件下,没有足够的 NAD+ 可用于糖酵解,因为所有 NAD+ 都被困在 NADH 形式(氧气不足意味着没有氧气存在于电子传递链的末端接收电子)。乳酸脱氢酶通过帮助将 NADH 转换为 NAD+ 来促进糖酵解的发生。乳酸脱氢酶通过将丙酮酸转换为乳酸来做到这一点。下图解释了此反应。

   O  O                OH  O                               
   ‖  ‖                |   ‖                                

H3C – C – CO- + NADH ↔ H3C – CH – CO- + NAD+

Pyruvate             Lactate
                         

如所示,两个电子从 NADH 中去除,并且添加一个质子以形成乳酸,并将 NADH 氧化为 NAD+

3. 苹果酸脱氢酶

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苹果酸脱氢酶通过可逆反应将苹果酸氧化为草酰乙酸。NADH 和 NAD+ 以相同的亲和力结合。换句话说,它通过 NAD+ 或 NADP 催化苹果酸脱氢为草酰乙酸,或催化苹果酸脱羧为丙酮酸。

4. 谷氨酸脱氢酶

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谷氨酸脱氢酶通过氧化脱氨作用催化谷氨酸中氮原子转化为铵离子(见下图反应方案)。在氧化脱氨作用中,反应首先通过碳-氮键的脱氢开始,然后导致称为席夫碱中间体的亚胺中间体。第一步利用谷氨酸脱氢酶 (GDH) 并利用辅酶 NAD+,辅酶 NAD+ 被还原为 NADH [1]。接下来,席夫碱的水解导致 α-酮戊二酸和游离铵离子。由于铵离子的快速去除,反应在正方向进行。谷氨酸脱氢酶位于细胞的线粒体中。谷氨酸脱氢酶是独一无二的,因为它在某些生物体中能够在其催化反应中使用 NAD+ 或 NADP+。这种能力是独一无二的,因为 NADPH 用作生物合成反应中的还原剂,而 NAD+ 通常用作大多数分解代谢反应中的氧化剂,而谷氨酰胺脱氢酶不特定于两者。

FINAL GLUTAMATE

参考文献

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Alan Fersht,酶结构与机制。

Jeremy M. Berg,John L. Tymoczko,Lubert Stryer。生物化学(第 6 版)。纽约。W.H. Freeman and Company,2007,2002。

Aaron Coleman,Meredith Gould,Jose Luis Stephano。生化技术。Hayden-McNeil Publishing,2013。

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