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结构生物化学/酶催化机制/菲利普斯机制

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一般信息

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菲利普斯机制

Glu35 和 Asp52 是催化残基

酶结合六糖单位,残基 D 扭曲成半椅形,以最小化 CH2OH 的相互作用。

Glu35 将 H+ 转移到 D 环的 O1 上(广义酸),C1-O1 键断裂,在 C1 处产生共振稳定的鎓离子。

Asp52 通过电荷-电荷相互作用(静电催化)稳定平面(过渡态结合催化)鎓离子,SN1 机制。

酶释放水解的 E 环及其附着的多糖,产生糖基-酶中间体,H2O 添加到鎓离子以形成产物并使 Glu35 重新质子化,构型保留是由于酶裂隙屏蔽了鎓离子的一面。

催化残基是通过化学(基团特异性试剂)和分子诱变确定的。

参考文献

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http://books.google.com/books?id=fSORbNITJ0QC&pg=PA6&lpg=PA6&dq=acid+base+enzyme+catalysis&source=bl&ots=SA3h6Afvdc&sig=0VpMXdejjvFQ7HdfgjSTt3602lQ&hl=en&ei=j48YS8qECouotgPajcyHBw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=8&ved=0CCsQ6AEwBw#v=onepage&q=acid%20base%20enzyme%20catalysis&f=false

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