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结构生物化学/基因组分析/测序基因组

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由于现代 DNA 分析技术的发展，许多基因组已被测序和分析。一个著名的例子是通过人类基因组计划测序的人类基因组。

人类基因组计划

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人类基因组计划是一项国际科学研究工作，旨在全面绘制人类基因组图谱。该项目由美国国立卫生研究院的詹姆斯·D·沃森发起，但世界各地的研究中心都在参与该项目；比如法国、德国、日本、中国、英国和印度。到目前为止，大约 92.3% 的基因组已被测序，但由于 DNA 的非编码序列或“垃圾”DNA 的存在，很难确定其确切比例。

基因组计划揭示了一些关键发现，例如人类基因组的 99.9% 是相同的。

同源性

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测序基因组使科学家能够识别同源蛋白并建立进化关系。此外，如果一个新发现的蛋白质与已知蛋白质同源，那么科学家可以通过同源性推测新蛋白质的功能。

测序对医学的影响

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未来快速测序人类基因组的能力可能会对医学产生重大影响。关于基因和个人 DNA 的知识已经使科学家能够预测个人患某些疾病的可能性。这也有助于分析染色体结构、进化对基因组的影响以及蛋白质结构和功能。未来，基因治疗、基因组医学和预防性治疗可能会降低患病风险，并使制药商能够针对特定个人定制药物。

测序的真核生物基因组

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真核生物是包含细胞的生物，这些细胞在明确的细胞膜内包含复杂的细胞器。区分真核生物和原核生物的决定性特征是真核生物的细胞核或核膜，其中包含生物体的遗传信息。

第一个被测序的真核生物基因组是 酿酒酵母 (酿酒酵母) 在 1996 年，它通常被称为酿酒酵母。酿酒酵母 由于其在烘焙和酿造中的用途，是最有用的酵母类型，因此它是在分子和细胞生物学中最常研究的真核生物模型生物，类似于大肠杆菌 在原核生物研究中的作用。许多对人类重要的蛋白质都是通过检查其在酵母中的同源物来研究的。例如，信号蛋白和蛋白质加工酶都是通过酵母基因组的帮助来发现的。

其他完全测序的生物包括：线虫、果蝇、河豚（人类之后第一个被测序的脊椎动物）和拟南芥。

下面的表格来自维基百科的测序的真核生物基因组列表.

原生生物

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色素藻类

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色素藻类是一组包含藻类门杂色藻、甲藻和隐藻的原生生物。该组成员主要用于进化研究。

生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
古尔迪亚 θ 隐藻 模式生物 0.551 Mb
(仅核形体基因组)		 464[1] 加拿大高级研究所、马尔堡菲利普斯大学和不列颠哥伦比亚大学 2001[1]
伪舟形藻
菌株：CCMP 1335 		硅藻 2.5 Mb 11,242[2] 联合基因组研究所和华盛顿大学 2004[2]
三角褐指藻
菌株：CCAP1055/1 		硅藻 27.4 Mb 10,402 联合基因组研究所 2008 [3]

囊泡藻类

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囊泡藻类 是一组原生生物，包括纤毛虫、顶复门和甲藻。该组成员对科学特别感兴趣，因为它们会导致严重的牲畜和人类疾病。

生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
牛巴贝虫 寄生 原生动物 牛病原体 8.2 Mb 3,671 2007[4]
人隐孢子虫
菌株：TU502 		寄生 原生动物 人病原体 10.4 Mb 3,994[5] 弗吉尼亚联邦大学 2004[5]
小隐孢子虫
C 型或基因型 2 分离株 		寄生原生动物 人病原体 16.5 Mb 3,807[6] 加州大学旧金山分校和明尼苏达大学 2004[6]
四膜虫 纤毛虫 模式生物 72 Mb 39,642[7] 基因组研究所 2006[7]
恶性疟原虫
克隆：3D7 		寄生原生动物 人病原体（疟疾） 22.9 Mb 5,268[8] 疟疾基因组计划联盟 2002[8]
诺氏疟原虫 寄生原生动物 灵长类动物病原体（疟疾） 23.5 Mb 5,188[9] 2008[9]
间日疟原虫 寄生原生动物 人病原体（疟疾） 26.8 Mb 5,433[10] 2008[10]
鼠疟原虫
菌株：17XNL 		寄生原生动物 啮齿动物病原体（疟疾） 23.1 Mb 5,878[11] TIGR 和 NMRC 2002[11]
热带拟卤虫 纤毛虫 模式生物 104 Mb 27,000[12] 2006[12]
东非锥虫
菌株：Muguga 		寄生原生动物 牛病原体（东非锥虫病） 8.3 Mb 4,035[13] TIGR 和国际家畜研究所 2005[13]
安卡拉锥虫
安卡拉克隆 C9 		寄生原生动物 牛病原体 8.3 Mb 3,792 桑格研究所 2005[14]

凹口鞭毛虫

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凹口鞭毛虫 是一组相关的自由生活和共生原生生物；它包括后鞭毛生物、卢科藻、眼虫和穿孔虫。它们因其在人类疾病中的作用而被研究。

生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
利什曼原虫
菌株：Friedlin 		寄生原生动物 人病原体 32.8 Mb 8,272[15] 桑格研究所 2005[15]
贾第鞭毛虫 寄生原生动物 人病原体 11.7 Mb 6,470[16] 2007[16]
阴道毛滴虫 寄生原生动物 人类病原体（滴虫病） 160 Mb 59,681[17] TIGR 2007[17]
布鲁氏锥虫
菌株：TREU927/4 GUTat10.1 		寄生原生动物 人类病原体（非洲昏睡病） 26 Mb 9,068 [18] 桑格研究院和 TIGR 2005[18]
克氏锥虫
菌株：CL Brener TC3 		寄生原生动物 人类病原体（恰加斯病） 34 Mb 22,570[19] TIGR，西雅图生物医学研究所和乌普萨拉大学 2005[19]

变形虫

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变形虫是一类具有运动能力的变形虫原生生物，该类群的成员通过称为伪足的暂时性突起运动或摄食。该类群中最著名的成员是粘菌，它已经研究了几个世纪；其他成员包括古变形虫、管形虫和扇形虫。一些变形虫会引起疾病。

生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
盘状粘菌
菌株：AX4 		粘菌 模式生物 34 Mb 12,500[20] 科隆大学、贝勒医学院和桑格中心联盟 2005[20]
溶组织内阿米巴
HM1：IMSS 		寄生原生动物 人类病原体（阿米巴痢疾） 23.8 Mb 9,938[21] TIGR，桑格研究院和伦敦卫生与热带医学院 2005[21]

植物

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高等植物

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生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
拟南芥
生态型：哥伦比亚 		野生芥菜 模式植物 120 Mb 25,498[22] 拟南芥基因组计划[23] 2000[22]
油菜 油菜籽 油料植物 1,100 Mb 拜耳作物科学 2009[24]
水稻
印度型亚种 		水稻 作物和模式生物 420 Mb 32-50,000[25] 北京基因组研究所，浙江大学和中国科学院 2002[25]
水稻
日本型亚种 		水稻 作物和模式生物 466 Mb 46,022-55,615[26] 先正达和Myriad 基因 2002[26]
小球藻 绿藻 简单的真核生物 12.6 Mb 阿拉戈实验室 2006[27]
小立碗藓 苔藓植物 模式生物

早期分化的陆地植物

 500 Mb 39,458[28] 美国能源部科学办公室联合基因组研究所 2008[28]
毛果杨 香脂杨或黑杨 碳封存，模式树，商业用途（木材）以及与A. thaliana的比较 550 Mb 45,555[29] 国际杨树基因组联盟 2006[29]
葡萄 葡萄品种 PN40024 水果作物 490 Mb[30] 30,434[30] 法国-意大利公共葡萄基因组表征联盟 2007[30]
玉米
mays亚种 		玉米 水果作物 2,800 Mb 50,000-60,000 美国国家科学基金会 2008[31]

藻类

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生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
红藻
菌株：10D 		红藻 简单的真核生物 16.5 Mb 5,331[32] 东京大学，立教大学，埼玉大学和熊本大学 2004[32]
Thalassiosira pseudonoana[33] 异鞭毛藻
衣藻[34] 模式生物 2007[34]
小球藻[33] 绿藻

真菌

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生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
棉毛孢子菌
菌株：ATCC 10895 		真菌 植物病原体 9.2 Mb 4,718[35] 先正达和巴塞尔大学 2004[35]
烟曲霉
菌株：Af293 		真菌 人病原体 29.4 Mb 9,926[36] 桑格研究院，曼彻斯特大学，TIGR，巴斯德研究所，长崎大学，萨拉曼卡大学和OpGen 2005[36]
构巢曲霉
菌株：FGSC A4 		真菌 模式生物 30 Mb 9,500[37] 2005[37]
黑曲霉
菌株：CBS 513.88 		真菌 生物技术 - 发酵 33.9 Mb 14,165[38] 2007[38]
米曲霉
菌株：RIB40 		真菌 用于发酵大豆 37 Mb 12,074[39] 国立科技评估院 2005[39]
光滑念珠菌
菌株：CBS138 		真菌 人病原体 12.3 Mb 5,283[40] Génolevures 联盟[41] 2004[40]
新形隐球菌（丝孢酵母属）
JEC21 		真菌 人病原体 20 Mb 6,500[42] TIGR 和斯坦福大学 2005[42]
汉逊德巴利酵母
菌株：CBS767 		酵母 奶酪成熟 12.2 Mb 6,906[40] Génolevures 联盟 2004[40]
兔脑炎微孢子虫 微孢子虫 人病原体 2.9 Mb 1,997[43] Genoscope 和布莱兹·帕斯卡大学 2001[43]
乳酸克鲁维酵母
菌株：CLIB210 		酵母 10-12 Mb 5,329[40] Génolevures 联盟 2004[40]
稻瘟病菌 真菌 植物病原体 37.8 Mb 11,109[44] 2005[44]
粗糙脉孢霉 真菌 模式真核生物 40 Mb 10,082[37] 博德研究所，俄勒冈健康与科学大学，肯塔基大学和堪萨斯大学 2003[37]
酿酒酵母
菌株：S288C 		面包酵母 模式真核生物 12.1 Mb 6,294[45] 酵母基因组测序国际合作[46] 1996[45]
裂殖酵母
菌株：972h 		酵母 模式真核生物 14 Mb 4,824[47] 桑格研究院和冷泉港实验室 2002[47]
解脂耶氏酵母
菌株：CLIB99 		酵母 工业用途 20 Mb 6,703[40] Génolevures 联盟 2004[40]

动物

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哺乳动物

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生物体 类型 鸟枪法覆盖率 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
牛 奶牛 6* 3.0 Gb[48][49] 22000[50] 牛基因组测序国际联盟 2009
家犬 狗 7.6* 2.4 Gb[51] 19,300[51] 博德研究所 和Agencourt 生物科学 2005[51]
豚鼠 豚鼠 2* 3.4 Gb 基因组测序平台，基因组组装团队[49]
九带犰狳 九带犰狳 2* [52] 3.0 Gb 博德研究所[49]
马达加斯加猬 马达加斯加猬 2* [52] 博德研究所
马 马 6.8* 2.1 Gb [49] 博德研究所等[49] 2007 [53]
欧洲刺猬 西欧刺猬 2* [52] 博德研究所
猫属猫 猫 2* 3 Gb 20,285 基因组测序平台，基因组组装团队[49] 2007[54]
智人 人类 3.2 Gb [55] 25,000[55] 人类基因组计划联盟 和塞雷拉基因组公司 2001 草案[56][57]
2006 完成[58]
非洲象 非洲象 2* [52] 3 Gb 博德研究所
食蟹猴 恒河猴 6* 恒河猴基因组测序联盟[49]
鼠狐猴 灰鼠狐猴 2* [52] 基因组测序平台，基因组组装团队[49]
灰短尾袋鼠 灰短尾袋鼠 3.5 Gb 18 - 20,000 博德研究所等 2007[49][59]
小鼠
品系：C57BL/6J 		老鼠 2.5 Gb 24,174[60] 小鼠基因组测序国际合作项目[61] 2002[60]
小褐蝙蝠 小褐蝙蝠 2* [49] 博德研究所
长尾黄鼠 美国鼠兔 2* [52] 博德研究所
鸭嘴兽 [62] 鸭嘴兽 6* [49] 华盛顿大学
欧洲野兔 兔子 2* [52] 2.5 Gb 博德研究所等 [49]
小耳蜂猴 小耳蜂猴，或 丛林婴猴 2* [52] 博德研究所
黑猩猩 黑猩猩 6* [49] 3.1 Gb 黑猩猩测序与分析联盟 2005[63]
猩猩 猩猩 3.0 Gb 分子生物技术研究所 [49]
褐家鼠 老鼠 1.8* 或更好 2.8 Gb [49] 21,166[64] 大鼠基因组测序项目联盟 2004[64]
田鼠 欧洲田鼠 2* [52] 3.0 Gb [49] 基因组测序平台，基因组组装团队[49]
十三条纹地松鼠 十三条纹地松鼠 2* 基因组测序平台，基因组组装团队[49]
树鼩 北树鼩 2* 博德研究所[49]

昆虫

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生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
冈比亚按蚊
品系：PEST 		蚊子 媒介 疟疾 278 Mb 13,683[65] 塞雷拉基因组公司 和 基因组研究所 2002[65]
蜜蜂 蜜蜂 真社会性行为 的模型 1800 Mb 10,157[66] 蜜蜂基因组测序联盟 2006[66]
家蚕
品系：p50T 		蛾子 (家养蚕) 丝绸 生产 530 Mb 东京大学 和国立农业生物科学研究所 2004[67]
果蝇 果蝇 模式动物 165 Mb 13,600[68] 塞雷拉公司，加州大学伯克利分校，贝勒医学院，欧洲 DGP 2000[68]

线虫

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生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
秀丽隐杆线虫 线虫 蠕虫 与秀丽隐杆线虫进行比较 104 Mb 19,500[69] 华盛顿大学，桑格研究所和冷泉港实验室 2003[69]
秀丽隐杆线虫
品系：布里斯托尔 N2 		线虫蠕虫 模式动物 100 Mb 19,000[70] 华盛顿大学和桑格研究所 1998[70]
北方根结线虫 北方根结线虫 蔬菜病原体 54 Mb 14,420[71] 2008[71]
南方根结线虫 南方根结线虫 植物病原体 86 Mb 19,212[72] 法国国家农业研究院，基因组研究所和国际南方根结线虫基因组联盟[73] 2008[72]
太平洋轮虫 线虫蠕虫 模式无脊椎动物 169 Mb 23,500[74] 马克斯·普朗克发育生物学研究所 &

基因组测序中心，华盛顿大学医学院

 2008[74]

其他动物

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生物体 类型 相关性 基因组大小 预测的基因数量 组织 完成年份
海鞘 海鞘 简单的 脊索动物 116.7 Mb 16,000[75] 联合基因组研究所 2003[75]
萨维尼海鞘 海鞘 174 Mb 博德研究所 2007[76]
家鸡 鸡 1000 Mb 20-23,000[77] 国际鸡基因组测序联盟 2004[77]
紫海胆 海胆 模式真核生物 814 Mb 23,300[78] 海胆基因组测序联盟 2006[78]
红鳍东方鲀 河豚 具有小型基因组的脊椎动物 390 Mb 22-29,000[79] 国际河豚基因组联盟[80] 2002[81]
绿鳍鱼 河豚 具有紧凑基因组的脊椎动物 340 Mb[82] 22,400[82] 基因组研究所 和 博德研究所 2004[82]

已测序的细菌基因组

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有一些技术正在不断改进，使其能够进行快速、高通量的DNA测序，例如荧光二脱氧核苷酸链终止法，“鸟枪法”等。1995年，利用“鸟枪法”确定了流感嗜血杆菌的细菌基因组。基因组DNA被随机切割成片段，然后计算机程序通过匹配这些片段之间的重叠区域来确定完整的序列。流感嗜血杆菌基因组包含1,830,137个碱基对，编码约1740个蛋白质。使用类似的方法，已经测序了100多种细菌和古细菌物种，包括关键的模式生物，如大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌和古菌，以及致病性生物，如鼠疫耶尔森氏菌（导致鼠疫）和炭疽杆菌（炭疽）。1

参考文献

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1. Berg, Jeremy M. 2007. 生物化学。第六版。纽约：W.H. Freeman. 68-69, 78. 2. Voet, Voet, Pratt (2004)。 - 生物化学基础

  1. ↑ a b Douglas S，Zauner S，Fraunholz M 等人（2001）。“被奴役藻类细胞核的高度简化基因组”。《自然》。410（6832）：1091–6。 doi:10.1038/35074092。 PMID 11323671. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人： (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  2. ↑ a b Armbrust EV，Berges JA，Bowler C 等人（2004）。“硅藻 Thalassiosira pseudonana 的基因组：生态学、进化和代谢”。《科学（期刊）》。306（5693）：79–86。 doi:10.1126/science.1101156。 PMID 15459382. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人： (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  3. ↑ Bowler C，Allen AE，Badger JH 等人（2008）。“拟菱形藻基因组揭示了硅藻基因组的进化史”。《自然》。456：239–244。 doi:10.1038/nature07410。 PMID 18923393. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人： (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  4. ↑ Brayton KA，Lau AOT，Herndon DR 等人（2007）。“牛巴贝虫基因组序列及其与顶复门血原虫的比较分析”。《PLoS 病原体》。3（10）：e148。 doi:10.1371/journal.ppat.0030148. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人： (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  5. ↑ a b Xu P，Widmer G，Wang Y 等人（2004）。“隐孢子虫 hominis 的基因组”。《自然》。431（7012）：1107–12。 doi:10.1038/nature02977。 PMID 15510150. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人： (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  6. ↑ a b Abrahamsen MS，Templeton TJ，Enomoto S 等人（2004）。“顶复门隐孢子虫 parvum 的完整基因组序列”。《科学（期刊）》。304（5669）：441–5。 doi:10.1126/science.1094786。 PMID 15044751. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人： (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  7. ↑ a b Aury JM，Jaillon O，Duret L 等人。（2006）。“纤毛虫四膜虫揭示的全基因组复制的全球趋势”。《自然》。444（7116）：171–8。 doi:10.1038/nature05230。 PMID 17086204. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人 (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个姓名：作者列表 (链接)
  8. ↑ a b Gardner MJ，Hall N，Fung E 等人。（2002）。“人类疟疾寄生虫恶性疟原虫的基因组序列”。《自然》。419（6906）：498–511。 doi:10.1038/nature01097。 PMID 12368864. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人 (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个姓名：作者列表 (链接)
  9. ↑ a b A. Pain，U. Böhme，A. E. Berry，K. Mungall，R. D. Finn，A. P. Jackson，T. Mourier，J. Mistry，E. M. Pasini，M. A. Aslet，S. Balasubrammaniam，K. Borgwardt，K. Brooks，C. Carret，T. J. Carver，I. Cherevach，T. Chillingworth，T. G. Clark，M. R. Galinski，N. Hall，D. Harper，D. Harris，H. Hauser，A. Ivens，C. S. Janssen，T. Keane，N. Larke，S. Lapp，M. Marti，S. Moule，I. M. Meyer，D. Ormond，N. Peters，M. Sanders，S. Sanders，T. J. Sargeant，M. Simmonds，F. Smith，R. Squares，S. Thurston，A. R. Tivey，D. Walker，B. White，E. Zuiderwijk，C. Churcher，M. A. Quail，A. F. Cowman，C. M. R. Turner，M. A. Rajandream，C. H. M. Kocken，A. W. Thomas，C. I. Newbold，B. G. Barrell 和 M. Berriman（2008 年 10 月 9 日）。“猴疟原虫和人类疟疾寄生虫诺氏疟原虫的基因组”。《自然》。455: 799–803。 doi:10.1038/nature07306.{{cite journal}}: CS1 maint: 多个姓名：作者列表 (链接)
  10. ↑ a b JM Carlton，JH Adams，JC Silva 等人。（2008 年 10 月 9 日）。“被忽视的人类疟疾寄生虫间日疟原虫的比较基因组学”。《自然》。455: 757–763。 doi:10.1038/nature07327. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人 (帮助)CS1 maint: 多个姓名：作者列表 (链接)
  11. ↑ a b Carlton JM，Angiuoli SV，Suh BB 等人。（2002）。“模式啮齿动物疟疾寄生虫小鼠疟原虫的基因组序列和比较分析”。《自然》。419（6906）：512–9。 doi:10.1038/nature01099。 PMID 12368865. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人 (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个姓名：作者列表 (链接)
  12. ↑ a b Eisen JA，Coyne RS，Wu M 等人。（2006）。“模式真核生物纤毛虫四膜虫的大核基因组序列”。《公共科学图书馆·生物学》。4（9）：e286。 doi:10.1371/journal.pbio.0040286。 PMC 1557398。 PMID 16933976. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人 (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个姓名：作者列表 (链接)
  13. ↑ a b Gardner MJ，Bishop R，Shah T 等人。（2005）。“泰勒虫的基因组序列，一种使淋巴细胞转化的牛病原体”。《科学》。309（5731）：134–7。 doi:10.1126/science.1110439。 PMID 15994558. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人 (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个姓名：作者列表 (链接)
  14. ↑ Pain A, Renauld H, Berriman M; 等. (2005). “Theileria annulata，一种宿主细胞转化寄生虫的基因组，与T. parva比较”。Science (journal). 309 (5731): 131–3. doi:10.1126/science.1110418. PMID 15994557. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  15. ↑ a b Ivens AC, Peacock CS, Worthey EA; 等. (2005). “动质体寄生虫利什曼原虫的基因组”. Science (journal). 309 (5733): 436–42. doi:10.1126/science.1112680. PMC 1470643. PMID 16020728. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  16. ↑ a b HG Morrison, AG McArthur, FD Gillin; 等. (2007). “早期分化的肠道寄生虫贾第鞭毛虫的基因组最小化”。Science (journal). 317 (5846): 1921–26. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  17. ↑ a b Carlton JM, Hirt RP, Silva JC; 等. (2007). “性传播病原体阴道滴虫的基因组草图”. Science (journal). 315 (5809): 207–12. doi:10.1126/science.1132894. PMC 2080659. PMID 17218520. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  18. ↑ a b Berriman M, Ghedin E, Hertz-Fowler C; 等. (2005). “非洲锥虫的基因组”。Science (journal). 309 (5733): 416–22. doi:10.1126/science.1112642. PMID 16020726. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  19. ↑ a b El-Sayed NM, Myler PJ, Bartholomeu DC; 等. (2005). “克氏锥虫的基因组序列，是造成南美锥虫病的病原体”。Science (journal). 309 (5733): 409–15. doi:10.1126/science.1112631. PMID 16020725. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  20. ↑ a b Eichinger L, Pachebat JA, Glöckner G; 等. (2005). “社会性变形虫盘状粘菌的基因组”. Nature. 435 (7038): 43–57. doi:10.1038/nature03481. PMC 1352341. PMID 15875012. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  21. ↑ a b Loftus B，Anderson I，Davies R 等人（2005）。“The genome of the protist parasite Entamoeba histolytica”。《自然》。433（7028）：865–8。 doi:10.1038/nature03291。 PMID 15729342. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  22. ↑ a b 拟南芥基因组计划（2000）。“Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana”。《自然》。408（6814）：796–815。 doi:10.1038/35048692。 PMID 11130711. {{cite journal}}: 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 额外的标点 (链接)
  23. ↑ 拟南芥基因组计划
  24. ↑ http://www.research-in-germany.de/coremedia/generator/dachportal/en/07__News_20and_20Events/VDITZ_20-_20News_26Events/Archiv/2009-10-25_2C_20Full_20oilseed_20rape_20genome_20deciphered,sourcePageId=34814.html
  25. ↑ a b Goff SA，Ricke D，Lan TH 等人（2002）。“A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. japonica)”。《科学》。296（5565）：92–100。 doi:10.1126/science.1068275。 PMID 11935018. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  26. ↑ a b Yu J，Hu S，Wang J 等人（2002）。“A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. indica)”。《科学》。296（5565）：79–92。 doi:10.1126/science.1068037。 PMID 11935017. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  27. ↑ Derelle E，Ferraz C，Rombauts S 等人（2006）。“Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features”。美国国家科学院院刊。103（31）：11647–52。 doi:10.1073/pnas.0604795103。 PMC 1544224。 PMID 16868079. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  28. ↑ a b Rensing SA，Lang D，Zimmer AD 等人（2008）。“The Physcomitrella genome reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants”。《科学》。319（5859）：64–9。 doi:10.1126/science.1150646。 PMID 18079367. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  29. ↑ a b Tuskan GA，Difazio S，Jansson S 等人（2006）。“The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)”。《科学》。313（5793）：1596–604。 doi:10.1126/science.1128691。 PMID 16973872. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  30. ↑ a b c Jaillon O, Aury JM, Noel B 等人 (2007). “葡萄基因组测序揭示了主要被子植物门系的祖先六倍体化”。《自然》。449 (7161): 463–7。 doi:10.1038/nature06148。 PMID 17721507. {{cite journal}}: 在作者列表中明确使用等人：|author= (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中有多个名称 (链接)
  31. ↑ 玉米基因组草案完成
  32. ↑ a b Matsuzaki M, Misumi O, Shin-I T 等人 (2004). “超小型单细胞红藻Cyanidioschyzon merolae 10D 的基因组序列”。《自然》。428 (6983): 653–7。 doi:10.1038/nature02398。 PMID 15071595. {{cite journal}}: 在作者列表中明确使用等人：|author= (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中有多个名称 (链接)
  33. ↑ a b Walker，Tara (2005 年 11 月 16 日). “基因组时代的藻类转基因”。《藻类学杂志》。41 (6): 1077–1093。 {{cite journal}}: 忽略未知参数 |coauthors= (|author= 建议) (帮助)
  34. ↑ a b Merchant 等人 (2007). “衣藻基因组揭示了关键动物和植物功能的演变”。《科学》。318: 245–250。 doi:10.1126/science.1143609。 PMID 17932292. {{cite journal}}: 在作者列表中明确使用等人：|author= (帮助)
  35. ↑ a b Dietrich FS, Voegeli S, Brachat S 等人 (2004). “Ashbya gossypii 基因组作为绘制古老的酿酒酵母基因组的工具”。《科学 (期刊)》。304 (5668): 304–7。 doi:10.1126/science.1095781。 PMID 15001715. {{cite journal}}: 在作者列表中明确使用等人：|author= (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中有多个名称 (链接)
  36. ↑ a b Nierman WC, Pain A, Anderson MJ 等人 (2005). “致病性和过敏性丝状真菌烟曲霉的基因组序列”。《自然》。438 (7071): 1151–6。 doi:10.1038/nature04332。 PMID 16372009. {{cite journal}}: 在作者列表中明确使用等人：|author= (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中有多个名称 (链接)
  37. ↑ a b c d Galagan JE, Calvo SE, Cuomo C 等人 (2005). “构巢曲霉的测序及其与烟曲霉和米曲霉的比较分析”。《自然》。438 (7071): 1105–15。 doi:10.1038/nature04341。 PMID 16372000. {{cite journal}}: 在作者列表中明确使用等人：|author= (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中有多个名称 (链接) 无效的<ref> 标记；名称“Galagan”在不同内容中定义多次
  38. ↑ a b Pel HJ, de Winde JH, Archer DB 等人 (2007). “通用细胞工厂黑曲霉 CBS 513.88 的基因组测序和分析”。《自然生物技术》。25 (2): 221–31。 doi:10.1038/nbt1282。 PMID 17259976. {{cite journal}}: 在作者列表中明确使用等人：|author= (帮助)； 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中有多个名称 (链接)
  39. ↑ a b Machida M, Asai K, Sano M 等. (2005). “米曲霉基因组测序与分析”. 自然. 438 (7071): 1157–61. doi:10.1038/nature04300. PMID 16372010. {{cite journal}}: 在“|作者=”中显式使用“等”： (帮助); 忽略了未知参数“|月份=” (帮助)CS1 maint: 多个名称: 作者列表 (链接)
  40. ↑ a b c d e f g h Dujon B, Sherman D, Fischer G 等. (2004). “酵母中的基因组进化”. 自然. 430 (6995): 35–44. doi:10.1038/nature02579. PMID 15229592. {{cite journal}}: 在“|作者=”中显式使用“等”： (帮助); 忽略了未知参数“|月份=” (帮助)CS1 maint: 多个名称: 作者列表 (链接)
  41. ↑ 关于 Génolevures
  42. ↑ a b Loftus BJ, Fung E, Roncaglia P 等. (2005). “担子菌酵母和人类病原菌隐球菌的基因组”. 科学（杂志）. 307 (5713): 1321–4. doi:10.1126/science.1103773. PMID 15653466. {{cite journal}}: 在“|作者=”中显式使用“等”： (帮助); 忽略了未知参数“|月份=” (帮助)CS1 maint: 多个名称: 作者列表 (链接)
  43. ↑ a b Katinka MD, Duprat S, Cornillot E 等. (2001). “真核寄生虫脑炎锥虫的基因组序列和基因压缩”. 自然. 414 (6862): 450–3. doi:10.1038/35106579. PMID 11719806. {{cite journal}}: 在“|作者=”中显式使用“等”： (帮助); 忽略了未知参数“|月份=” (帮助)CS1 maint: 多个名称: 作者列表 (链接)
  44. ↑ a b Dean RA, Talbot NJ, Ebbole DJ 等. (2005). “稻瘟病菌的基因组序列”. 自然. 434 (7036): 980–6. doi:10.1038/nature03449. PMID 15846337. {{cite journal}}: 在“|作者=”中显式使用“等”： (帮助); 忽略了未知参数“|月份=” (帮助)CS1 maint: 多个名称: 作者列表 (链接)
  45. ↑ a b Goffeau A, Barrell BG, Bussey H 等. (1996). “拥有 6000 个基因的生命”. 科学（杂志）. 274 (5287): 546, 563–7. PMID 8849441. {{cite journal}}: 在“|作者=”中显式使用“等”： (帮助); 忽略了未知参数“|月份=” (帮助)CS1 maint: 多个名称: 作者列表 (链接)
  46. ↑ 酵母基因组测序国际合作项目
  47. ↑ a b Wood V, Gwilliam R, Rajandream MA 等. (2002). “裂殖酵母的基因组序列”. 自然. 415 (6874): 871–80. doi:10.1038/nature724. PMID 11859360. {{cite journal}}: 在“|作者=”中显式使用“等”： (帮助); 忽略了未知参数“|月份=” (帮助)CS1 maint: 多个名称: 作者列表 (链接)
  48. ↑ 牛基因组测序与分析联盟 (2009-04-24). "瘤牛基因组序列：洞察反刍动物生物学和进化". 科学. 324 (5926): 522–528. doi:10.1126/science.1169588. 检索于 2009-04-24.
  49. ↑ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s PubMed 主页
  50. ↑ http://news.bbc.co.uk/1/hi/sci/tech/8014598.stm 牛基因组“将改变农业”
  51. ↑ a b c Lindblad-Toh K, Wade CM, Mikkelsen TS; 等 (2005). "家犬基因组序列、比较分析和单倍型结构". 自然. 438 (7069): 803–19. doi:10.1038/nature04338. PMID 16341006. {{cite journal}}: 在“|author=”中显式使用et al. (帮助); 未知参数“|month=”被忽略 (帮助)CS1 maint: multiple names: authors list (链接)
  52. ↑ a b c d e f g h i 哺乳动物基因组项目 - 博德研究所
  53. ↑ 马基因组组装完成，2007 年 2 月 7 日新闻发布 - 美国国立卫生研究院 (NIH)
  54. ↑ Pontius JU, Mullikin JC, Smith DR; 等 (2007). "猫基因组的初始序列和比较分析". 基因组研究. 17 (11): 1675–89. doi:10.1101/gr.6380007. PMC 2045150. PMID 17975172. {{cite journal}}: 在“|author=”中显式使用et al. (帮助); 未知参数“|month=”被忽略 (帮助)CS1 maint: multiple names: authors list (链接)
  55. ↑ a b 人类基因组测序联盟，国际 (2004). "完成人类基因组常染色质序列". 自然. 431 (7011): 931–45. doi:10.1038/nature03001. PMID 15496913. {{cite journal}}: 未知参数“|month=”被忽略 (帮助)
  56. ↑ McPherson JD, Marra M, Hillier L; 等 (2001). "人类基因组的物理图谱". 自然. 409 (6822): 934–41. doi:10.1038/35057157. PMID 11237014. {{cite journal}}: 在“|author=”中显式使用et al. (帮助); 未知参数“|month=”被忽略 (帮助)CS1 maint: multiple names: authors list (链接)
  57. ↑ Venter JC, Adams MD, Myers EW; 等 (2001). "人类基因组序列". 科学 (期刊). 291 (5507): 1304–51. doi:10.1126/science.1058040. PMID 11181995. {{cite journal}}: 在“|author=”中显式使用et al. (帮助); 未知参数“|month=”被忽略 (帮助)CS1 maint: multiple names: authors list (链接)
  58. ↑ Gregory SG, Barlow KF, McLay KE; 等 (2006). "人类染色体 1 的 DNA 序列和生物学注释". 自然. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038/nature04727. PMID 16710414. {{cite journal}}: 在“|author=”中显式使用et al. (帮助); 未知参数“|month=”被忽略 (帮助)CS1 maint: multiple names: authors list (链接)
  59. ↑ Mikkelsen TS, Wakefield MJ, Aken B 等人 (2007)。"有袋类动物负鼠（Monodelphis domestica）基因组揭示非编码序列的创新"。自然。447 (7141): 167–77。 doi:10.1038/nature05805。 PMID 17495919. {{cite journal}}: 作者中显式使用“等人”：|author= (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中的多个名称 (链接)
  60. ↑ a b Waterston RH, Lindblad-Toh K, Birney E 等人 (2002)。"小鼠基因组的初步测序和比较分析"。自然。420 (6915): 520–62。 doi:10.1038/nature01262。 PMID 12466850. {{cite journal}}: 作者中显式使用“等人”：|author= (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中的多个名称 (链接)
  61. ↑ 国际小鼠基因组测序合作项目
  62. ↑ 全基因组鸟枪法测序项目列表
  63. ↑ 黑猩猩测序和分析联盟。 (2005)。"黑猩猩基因组的初始测序及其与人类基因组的比较"。自然。437 (7055): 69–87。 doi:10.1038/nature04072。 PMID 16136131. {{cite journal}}: 忽略了未知参数 |month= (帮助)
  64. ↑ a b Gibbs RA, Weinstock GM, Metzker ML 等人 (2004)。"褐家鼠基因组序列揭示哺乳动物进化的见解"。自然。428 (6982): 493–521。 doi:10.1038/nature02426。 PMID 15057822. {{cite journal}}: 作者中显式使用“等人”：|author= (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中的多个名称 (链接)
  65. ↑ a b Holt RA, Subramanian GM, Halpern A 等人 (2002)。"疟疾蚊子按蚊（Anopheles gambiae）的基因组序列"。科学（期刊）。298 (5591): 129–49。 doi:10.1126/science.1076181。 PMID 12364791. {{cite journal}}: 作者中显式使用“等人”：|author= (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中的多个名称 (链接)H
  66. ↑ a b 蜜蜂基因组测序联盟。 (2006)。"从蜜蜂（Apis mellifera）基因组获得对群居昆虫的见解"。自然。443 (7114): 931–49。 doi:10.1038/nature05260。 PMC 2048586。 PMID 17073008. {{cite journal}}: 忽略了未知参数 |month= (帮助)
  67. ↑ Mita K, Kasahara M, Sasaki S 等人 (2004)。"家蚕（Bombyx mori）的基因组序列"。DNA Res。11 (1): 27–35。 doi:10.1093/dnares/11.1.27。 PMID 15141943. {{cite journal}}: 作者中显式使用“等人”：|author= (帮助); 忽略了未知参数 |month= (帮助)CS1 维护：作者列表中的多个名称 (链接)
  68. ↑ a b Adams MD, Celniker SE, Holt RA; 等人 (2000). "黑腹果蝇基因组序列". 科学（期刊）. 287 (5461): 2185–95. PMID 10731132. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人: |author= (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  69. ↑ a b Stein LD, Bao Z, Blasiar D; 等人 (2003). "秀丽隐杆线虫的基因组序列：一个用于比较基因组学的平台". PLoS Biol. 1 (2): E45. doi:10.1371/journal.pbio.0000045. PMC 261899. PMID 14624247. {{cite journal}}: 在 |author= 中显式使用等人: |author= (帮助); 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  70. ↑ a b 秀丽隐杆线虫测序联盟. (1998). "秀丽隐杆线虫的基因组序列：一个用于研究生物学的平台". 科学（期刊）. 282 (5396): 2012–8. PMID 9851916. {{cite journal}}: 忽略未知参数 |month= (帮助)
  71. ↑ a b Charles Opperman, David McK. Bird, Mark Burke, Jonathan Cohn, John Cromer, Steve Diener, Jim Gajan, Steve Graham, T. D. Houfek, Jennifer Schaff, Reenah Schaffer, Elizabeth Scholl, Eric Windham, Bryon R. Sosinski, Valerie M. Williamson, Qingli Liu, Varghese P. Thomas, Dan S. Rokhsar, Therese Mitros (2008). "Meloidogyne hapla 的序列和遗传图：用于植物寄生的一种紧凑的线虫基因组". 美国国家科学院院刊. 105: 14802. doi:10.1073/pnas.0805946105. PMID 18809916.{{cite journal}}: CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  72. ↑ a b Pierre Abad, Jerome Gouzy, Jean-Marc Aury, Philippe Castagnone-Sereno, Etienne G.J. Danchin, Emeline Deleury, Laetitia Perfus-Barbeoch 等人 第 26 卷，第 909-915 页. (2008). " : Meloidogyne incognita 的基因组序列". 自然生物技术. 26: 909–915. doi:10.1038/nbt.1482. PMID 18660804. {{cite journal}}: 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  73. ↑ 国际 M.incognita 基因组联盟
  74. ↑ a b Christoph Dieterich, Sandra W Clifton, Lisa N Schuster, Asif Chinwalla, Kimberly Delehaunty, Iris Dinkelacker, Lucinda Fulton, Robert Fulton, Jennifer Godfrey, Pat Minx, Makedonka Mitreva, Waltraud Roeseler, Huiyu Tian, Hanh Witte, Shiaw-Pyng Yang, Richard K Wilson & Ralf J Sommer (2008). "太平洋食线虫 的基因组提供了一个独特的视角来了解线虫的生活方式和寄生". 自然遗传学. 40: 1193. doi:10.1038/ng.227. PMID 17095691. {{cite journal}}: 忽略未知参数 |month= (帮助)CS1 maint: 多个名称：作者列表 (链接)
  75. ↑ a b Dehal P, Satou Y, Campbell RK 等人 (2002). “Ciona intestinalis 的基因组草图：对脊索动物和脊椎动物起源的洞察”. Science (journal). 298 (5601): 2157–67. doi:10.1126/science.1080049. PMID 12481130. {{cite journal}}: 在“|author=” 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数“|month=” (帮助)CS1 maint: 多个名字：作者列表 (链接)
  76. ↑ Small KS, Brudno M, Hill MM, Sidow A (2007). “高度多态性 Ciona savignyi 基因组的单倍体比对和参考序列”. Genome Biol. 8 (3): R41. doi:10.1186/gb-2007-8-3-r41. PMC 1868934. PMID 17374142.{{cite journal}}: CS1 maint: 多个名字：作者列表 (链接)
  77. ↑ a b 国际鸡基因组测序联盟. (2004). “鸡基因组的序列和比较分析为脊椎动物进化提供了独特的视角”. Nature. 432 (7018): 695–716. doi:10.1038/nature03154. PMID 15592404. {{cite journal}}: 忽略了未知参数“|month=” (帮助)
  78. ↑ a b Sodergren E, Weinstock GM, Davidson EH 等人 (2006). “海胆 Strongylocentrotus purpuratus 的基因组”. Science (journal). 314 (5801): 941–52. doi:10.1126/science.1133609. PMID 17095691. {{cite journal}}: 在“|author=” 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数“|month=” (帮助)CS1 maint: 多个名字：作者列表 (链接)
  79. ↑ 国际河豚基因组联盟. 第四代基因组组装
  80. ↑ 国际河豚基因组联盟
  81. ↑ Aparicio S, Chapman J, Stupka E 等人 (2002). “Fugu rubripes 基因组的全基因组鸟枪法组装和分析”. Science (journal). 297 (5585): 1301–10. doi:10.1126/science.1072104. PMID 12142439. {{cite journal}}: 在“|author=” 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数“|month=” (帮助)CS1 maint: 多个名字：作者列表 (链接)
  82. ↑ a b c Jaillon O, Aury JM, Brunet F 等人 (2004). “硬骨鱼 Tetraodon nigroviridis 的基因组复制揭示了早期脊椎动物原型核型”. Nature. 431 (7011): 946–57. doi:10.1038/nature03025. PMID 15496914. {{cite journal}}: 在“|author=” 中显式使用 et al. (帮助); 忽略了未知参数“|month=” (帮助)CS1 maint: 多个名字：作者列表 (链接)
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