结构生物化学/RNA的机械展开
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RNA的机械展开已成为研究RNA折叠问题的首选方法,因为它不需要高温或变性剂。激光镊子的发明使得这项技术更加有价值,因为它可以对单个RNA分子施加力,并清晰地观察其展开和重新折叠。为了发现RNA的结构转变,会施加测量的力并测量链的端到端距离;这也允许计算所做的机械功。此外还开发了FRET技术,即荧光共振能量转移,用于阐明RNA折叠构象变化动力学(Li,Vieregg,Tinoco Jr.,78)。
在研究金属离子键合时,机械展开是首选研究方法,原因有几个。光镊的使用允许在生理条件下研究RNA,并且镊子施加的力只影响非共价相互作用。因此,热力学计算和解释保持简单;施加的力只影响RNA的结构,而不影响水分子和离子的活性(85)。因此,科学家在实验中不需要考虑依数性质。此外,可以操纵RNA构象,使科学家可以测量RNA中相互作用的形成或断裂。总的来说,这种方法的开发使研究RNA结构变得更加容易、更准确。
Li,Pan T.X.,Jeffrey Vieregg 和 Ignacio Tinoco。 “RNA 如何展开和重新折叠。”《生物化学年度评论》 77.1 (2008):77-100。印刷版。