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结构生物化学/WD40 结构域

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WD40 结构域

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它们是真核生物基因组中最丰富的结构域蛋白。作为支架,WD40 结构域蛋白参与各种细胞过程,如信号转导、细胞分裂、细胞骨架组装、趋化性和RNA加工。WD 结构域最显著的特征是它们介导了蛋白质与另一种蛋白质之间的多种相互作用。

WD40 结构域的结构;7 叶片β螺旋桨

WD40 结构域具有高度对称的结构,这支持更快速和便捷的折叠。此外,这些结构域的特点是螺旋桨结构,具有七个叶片。WD40 螺旋桨具有三个独特的表面,分别是顶部、底部和圆周,它们参与各种相互作用。顶端区域是结构的一部分,其中包含循环,这些循环连接WD 重复的D 和 A 链。

WD40-肽相互作用

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大多数蛋白质-蛋白质和蛋白质-肽相互作用发生在β-螺旋桨中心通道的特定位点。该位点称为超位点,并且在该位点,大多数相互作用伙伴结合。大多数相互作用发生在螺旋桨的顶面,因为中心通道的核心不可用于相互作用,并且β-螺旋桨的N-或C-末端堆积在中心通道的入口处,因此,大多数相互作用发生在WD40 结构域中。例如,WD40 结构域参与的相互作用之一是球状蛋白质与包含短肽/线性基序的蛋白质之间的相互作用。

肽-蛋白质相互作用

WD40 和肽之间的相互作用对于动态多蛋白复合物的组装很重要。当相互作用发生时,许多不同的肽基序结合到螺旋桨的不同位点,但大多数肽结合在β螺旋桨顶部靠近中心通道。结合位点的可变性使WD40 结构域具有理想的平台,用于组装不同类型的蛋白质并帮助形成瞬态复合物。

转导蛋白;α 亚基为红色,β 亚基为蓝色,γ 亚基为黄色

转导蛋白

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转导蛋白负责将视紫红质信号传递到环状鸟苷一磷酸磷酸二酯酶,它由三个亚基组成:α-、β-和γ-亚基
α-亚基
它包含一个GTP酶结构域。GTP酶结构域与α-螺旋结构域相互作用,α-螺旋结构域不与WD40 结构域相互作用,以及一个N-末端螺旋,它与螺旋桨的侧面接触

β-亚基
它与γ-亚基形成稳定的异二聚体

γ-亚基
它包含两个螺旋。第一个螺旋与β-亚基螺旋桨之前的N-末端螺旋相连,第二个螺旋与螺旋桨底部的环接触。γ-亚基控制整个转导蛋白异三聚体的表达水平,这对于正常的转导蛋白定位起着重要作用。

参考文献

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  • Stirnimann CU, Petsalaki E, Russell RB, Müller CW. "WD40 蛋白推动细胞网络" Trends Biochem Sci. 2010 Oct;35(10):565-74. Epub 2010 年 5 月 5 日。综述
  • Xu C, Min J. "WD40 结构域蛋白的结构和功能。" 结构基因组学联盟,多伦多大学,101 College St.,多伦多,安大略,加拿大

来源
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Rhodopsin-transducin.png

http://commons.wikimedia.org/wiki/File:1erj_7bladed_beta_propeller.png

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