生物信息学

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目录

• 前言
• 介绍

• 第一部分：分子生物学
  1. 分子生物学的中心法则
  2. DNA 结构
  3. RNA 结构
  4. 蛋白质 & 核酸
  5. 人类基因组

• 第二部分：序列搜索和比对
  1. 序列数据库
  2. 核酸搜索算法
  3. 核酸比对算法
  4. 蛋白质比对算法

• 第三部分：系统发育
  1. 理解系统发育树
  2. 距离算法
  3. 简约算法
  4. 似然算法
  5. 贝叶斯算法

• 第四部分：基因组学
  1. 全基因组组装
• 第五部分：基因表达
• 第六部分：蛋白质结构
  • • 蛋白质折叠
    • 蛋白质结构预测
      • 二级结构预测
      • 同源建模
      • 从头结构预测
      • 接触预测
    • CASP
• 第七部分：蛋白质组学
• 第八部分：代谢组学
• 第九部分：宏基因组学

• 第十部分：生物序列和生物多样性
  1. 序列多样性导致的化学多样性，允许生物多样性
  2. 基因组差异如何表达生物复杂性
  3. 生物序列数据表明所有生物都有共同的祖先
  4. 从极端环境生物中获得的生物序列的独特特征
  5. 氧气适应性生命、线粒体和叶绿体的遗传起源
  6. 多细胞生物的遗传起源
  7. 一个物种的定义不仅取决于任何特定个体的基因组，还取决于遗传多样性
  8. 物种内遗传变异如何导致物种形成

• 第十一部分：其他类型的生物数据
  1. 医学信息学
  2. 环境或人口数据
  3. 形态学数据
  4. 关系数据库和生物数据

• 词汇表