MINC工具文档

MINC有很多附加工具，这里试图将所有这些工具的文档整合到一个连贯的地方。有很多文档！这些工具被组织成粗略的章节，你可以随意在这里添加你自己的工具，并在需要时添加章节。注意，所有这些工具的源代码都可以在这里获得： http://packages.bic.mni.mcgill.ca/tgz 这些软件包中至少大部分也会在 http://packages.bic.mni.mcgill.ca/ 上提供二进制版本。

配准（对齐）

配准是一个将两张（或更多张）图像彼此对齐的过程。有很多方法可以做到这一点，但大多数方法都涉及某种形式的梯度下降和匹配算法。

mni autoreg - 由 Louis Collins 编写的配准框架

强度校正

MRI中的强度校正通常是指对B1场效应的校正，但也有在同一受试者的不同扫描之间，甚至不同受试者之间进行强度校正的情况。单个采集的切片之间也可能存在强度差异。

iNormalize 由 Alex Zijdenbos 开发的全局强度校正软件包

N3 - 由 John G. Sled 编写的强度非均匀性校正软件包

几何畸变校正

MRI扫描仪会由于多种因素引入几何畸变。

DistortionCorrection - 用于校正由成像梯度非线性引起的解剖图像畸变的工具。

C库

这些库是为了扩展MINC的功能而编写的，通常它们会为MINC添加某些功能，比如与图像显示库的链接。

bicpl - BIC“程序员”库

EBTKS - 除非厨房里的水槽，无所不包

bicInventor - 一个胶合库，允许在MINC程序中使用Inventor/Coin

虚拟机

可以在 https://github.com/cobralab/MINC-VM 上找到一个包含预安装并可直接使用的MINC工具的虚拟机。

其他语言接口

emma - 一个古老、老旧且没有维护的MATLAB接口（由奥斯卡奖得主编写！）