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R 语言生物统计学

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来自维基教科书,开放世界中的开放书籍

Wayne W. Daniel 的《生物统计学》(ISBN:9780471456544)是全球许多 生物统计学 课程的标准教科书。与其他类似主题的书籍类似,Daniel 书中给出的统计计算示例没有涵盖 R。(即使它在 MINITABSASSPSS 中给出了示例)由于生物统计学是行业,统计软件包只是工具,人们应该相信 Daniel 书中的所有示例都可以用 R 重写。R 作为 S 语言 的免费开源解释器,理应在 Daniel 的书中和整个生物统计学领域中占有一席之地。

这本维基教科书是 Daniel 书籍第十版的配套教材。数据集可从 Wiley 网站 下载。将这些数据集导入 R 的说明将在第 2 章中介绍。

从第 3 章到第 17 章,这本配套教材的内容完全遵循 Wayne W. Daniel 的书籍。每章都以 Wayne W. Daniel 的《生物统计学》(ISBN:9780471456544)中公式的摘要及其在 R 编程中的表达开始。各章的节也遵循 Daniel 书籍的内容,包括 Daniel 书籍中的示例和练习以及 R 编程中的方向。没有示例和练习的部分将不再讨论。

志愿编辑

  • 这是一个维基项目——一个开源的免费访问参考书。任何人都欢迎并鼓励随时贡献任何内容(只要它与 R 语言生物统计学相关)。
  • Hanjin Deviasse 加拿大安大略省多伦多

作者

  1. R 语言简介
    1. R 语言的第一步
    2. R 语言中的数据类型和基本函数
    3. R 编程用于编写函数
    4. R 语言中的基本图形
  2. R 语言中的数据导入
  3. 生物统计学导论
  4. 描述性统计:R 语言公式摘要
    1. 有序数组
    2. 分组数据:频率分布
    3. 描述性统计:集中趋势度量
    4. 描述性统计:离散程度度量
    5. 复习问题和练习
  5. 一些基本概率概念:R 语言公式摘要
    1. 计算事件的概率
    2. 贝叶斯定理、筛查测试敏感性、特异性以及预测值阳性和阴性
    3. 复习问题和练习
  6. 概率分布:R 语言公式摘要
    1. 离散变量的概率分布
    2. 二项分布
    3. 泊松分布
    4. 连续概率分布
    5. 正态分布
    6. 正态分布应用
    7. 复习问题和练习
  7. 一些重要的抽样分布:R 语言公式摘要
    1. 样本均值的分布
    2. 两个样本均值之差的分布
    3. 样本比例的分布
    4. 两个样本比例之差的分布
    5. 复习问题和练习
  8. 估计:R 语言公式摘要
    1. 总体均值的置信区间
    2. t 分布
    3. 两个总体均值之差的置信区间
    4. 总体比例的置信区间
    5. 两个总体比例之差的置信区间
    6. 估计均值所需的样本量确定
    7. 估计比例所需的样本量确定
    8. 正态分布总体的方差置信区间
    9. 两个正态分布总体方差比率的置信区间
    10. 复习问题和练习
  9. 假设检验:R 语言公式摘要
    1. 假设检验:单个总体均值
    2. 假设检验:两个总体均值之差
    3. 配对比较
    4. 假设检验:单个总体比例
    5. 假设检验:两个总体比例之差
    6. 假设检验:单个总体方差
    7. 假设检验:两个总体方差的比率
    8. 第二类错误和检验功效
    9. 确定控制第二类错误的样本量
    10. 复习问题和练习
  10. 方差分析:R 语言公式摘要
    1. 完全随机化设计
    2. 随机化完全区组设计
    3. 重复测量设计
    4. 析因实验
    5. 复习问题和练习
  11. 简单线性回归和相关性:R 语言公式摘要
    1. 回归模型
    2. 样本回归方程
    3. 评估回归方程
    4. 使用回归方程
    5. 相关性模型
    6. 相关系数
    7. 一些注意事项
    8. 复习问题和练习
  12. 多元回归和相关性:R 语言公式摘要
    1. 多元线性回归模型
    2. 获得多元回归方程
    3. 评估多元回归方程
    4. 使用多元回归方程
    5. 多元相关性模型
    6. 复习问题和练习
  13. 回归分析:一些额外的技术:R 语言公式摘要
    1. 定性自变量
    2. 变量选择程序
    3. 逻辑回归
    4. 复习问题和练习
  14. 卡方分布和频率分析:R 语言公式摘要
    1. 卡方分布的数学性质
    2. 拟合优度检验
    3. 独立性检验
    4. 同质性检验
    5. 费舍尔精确检验
    6. 相对风险、优势比和 Mantel–Haenszel 统计量
    7. 复习问题和练习
  15. 非参数和无分布统计:R 语言公式摘要
    1. 测量量表
    2. 符号检验
    3. 用于位置的 Wilcoxon 符号秩检验
    4. 中位数检验
    5. Mann–Whitney 检验
    6. Kolmogorov–Smirnov 拟合优度检验
    7. Kruskal–Wallis 秩和单因素方差分析
    8. Friedman 秩和双因素方差分析
    9. 斯皮尔曼秩相关系数
    10. 非参数回归分析
    11. 复习问题和练习
  16. 生存分析:R 语言公式摘要
    1. 事件时间数据和删失
    2. Kaplan–Meier 程序
    3. 比较生存曲线
    4. Cox 回归:比例风险模型
    5. 复习问题和练习
  17. 人口统计:R 语言公式摘要
    1. 死亡率和死亡比
    2. 生育率度量
    3. 发病率度量
    4. 复习问题和练习
  18. 进一步阅读
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