GENtle/编辑引物对话框

编辑引物对话框。

此对话框有助于优化引物。为此，将生成许多引物变体，并可以进行检查。

对话框的中心线显示引物的当前变体；该变体的详细信息显示在右上角的框中。确定将结束对话框，将该变体提交到 PCR 模块。取消将结束对话框，并且不更改 PCR 模块。重置将使对话框中的引物恢复到最初启动对话框时的变体。

对话框下半部分的列表包含一个自动生成的当前引物变体列表，按任意分数排序。变体的“区域”可以受对话框左上角区域中多个设置的影响。可用设置包括

• 引物 5' 端向左和向右的变异。
• 引物 3' 端向左和向右的变异。
• 引物的最小和最大长度。
• 引物的最小和最大熔解温度。

更改这些设置中的任何一个都会触发重新计算可能的变异。然后评估这些变异并在对话框下半部分的列表中显示。双击其中一个变异将更改中心线上的当前变异，并在对话框右上角显示属性。

属性显示

这将显示

1. 引物序列，方向为 5'→3'
2. ΔH 和 ΔS 值
3. 引物的长度和 GC 含量
4. 熔解温度，根据最近邻方法计算（通常最佳结果，但仅适用于较长的引物）
5. 熔解温度，根据盐调整方法计算（结果中等）
6. 熔解温度，根据 GC 方法计算（简单化）
7. 最高自退火评分（任意）以及该退火的显示

注意：计算引物熔解温度很棘手。如果三种方法中的一种给出的结果与其他两种结果完全不同，请忽略它。此外，熔解温度仅针对与序列退火的引物 3' 端计算！