GENtle/蛋白水解助手

蛋白水解助手。

蛋白水解助手 可以从 蛋白质 模块调用。它可以帮助选择用于有限蛋白水解、蛋白质结构域分离等的蛋白酶。有几个列表框彼此依赖，因此一开始可能看起来很混乱。

1. 首先，蛋白质被虚拟地切割，方法是在蛋白酶列表中检查的蛋白酶。所有这些蛋白酶在蛋白质中的切割结果显示在切割列表中。这些切割产生的片段显示在生成的片段列表中，以及在凝胶模拟.
2. 如果您知道某些切割没有发生（例如，因为识别基序受到保护），您可以在切割列表中取消选择（取消选中）这些切割。
3. 如果您知道蛋白质的某些注释特征受到蛋白酶的保护，您可以在保护特征列表中取消选择（取消选中）这些切割。
4. 如果您想通过蛋白酶分离蛋白质的注释特征（例如，结构域），您可以在分离片段列表中选择两个或多个特征。根据您的选择和最大蛋白酶数量的状态，混合建议列表将填充可以完成任务的蛋白酶（或它们的组合）。选择其中一种“混合物”，将在列表下方显示更详细的描述，并且相应的蛋白酶将在蛋白酶列表中取消选择（取消选中）这些切割。

所有这些设置的最终结果是生成的片段列表。您可以按片段排序切割位置、片段长度或大小（重量）。您可以检查单个片段，全部或无它们。在确定之后，可以对所选片段执行多个操作。

• 创建选定片段将为每个选定片段创建一个新的蛋白质模块。
• 注释选定片段将在当前蛋白质模块中为每个选定片段添加一个特征。
• 保留蛋白酶将把在蛋白酶列表中选择的蛋白酶添加到当前蛋白质模块中。