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GENtle/限制酶助手

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GENtle: 工具和对话框

连接 - 选项 - 数据库 - 导入 - 输入序列 - 序列编辑器 - 限制酶助手 - PCR 故障排除对话框 - 蛋白水解助手 - 项目 - 编辑引物对话框 - 查找对话框 - 打印 - 酶管理 - 测序引物 - 沉默突变 - 自动注释

限制酶助手。

限制酶助手可以通过菜单“工具/酶助手”调用,也可以通过在 DNA 图 中的限制位点上用鼠标中键单击来调用。对于后者,所选酶将自动在“可用酶”列表(左侧)中选中。此列表取决于“组”和“子选择”的选择。可以通过单击相应的列标题,按酶名称或切割次数排序。对于选定的酶,生成的片段将显示在左下角列表中。

右侧的列表显示“限制酶混合物”的内容,即已经选择用于切割的酶。这些酶一起产生的片段显示在右下角列表中。可以通过“添加到混合物”将左侧列表中选定的酶放入混合物中;可以通过“添加所有”一次添加左侧列表中的所有酶。可以通过在右侧列表中选择一个酶,然后通过“移除酶”将其从混合物中移除。

选中“不创建低于 ___ 个碱基对的片段”时,会将生成的片段限制为最小大小。“完成”退出限制酶助手,同时保留对混合物所做的更改,而“取消”将取消所有所做的更改。

“开始限制”(剪刀符号)将启动模拟限制。结果可以受到其他几个设置的影响。

  • “创建片段”将生成实际的 DNA 序列及其钝端/粘性末端,这些序列将是使用混合物进行消化产生的。此选项已预先选中。
  • “添加到凝胶”将片段添加到 虚拟凝胶 中,在一个泳道中一起添加。
  • “每个泳道一个”将改变上述情况,以便每种酶都有自己的泳道。
  • “部分限制”将向虚拟凝胶泳道添加所有可能的片段,模拟部分(不完全)限制。选中“部分限制”时,选项“每个泳道一个”不可用。

限制酶混合物将被保留,以便您可以使用相同的酶组合切割另一个 DNA,这对即将进行的 连接 很有用。

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