GENtle/序列编辑器

序列编辑器，属性选项卡。

序列编辑器是序列属性的关键所在。它包含多个选项卡，具体取决于序列的类型，可以是 DNA 或氨基酸。

属性

在这里，可以更改序列的标题和描述。对于特征描述，序列描述将使 http 引用可点击。

对于 DNA 序列，可以输入粘性末端。

特征

序列编辑器，特征选项卡。

编辑特征对话框。

此选项卡显示序列的所有特征列表。可以添加、编辑和删除特征。大多数设置应不言自明。

• 设置“阅读框”仅在类型设置为“CDS”（“编码序列”）时可用。
• “引导”序列以 5'→3' 方向读取；引导未选中，则为 3'→5'。
• “编辑特征”将调用一个额外的“编辑特征”对话框。

编辑特征

• “填充颜色”是特征的颜色；它将调用颜色选择对话框。
• “在序列显示中使用的类型”确定该特征在序列图中的绘制方式。
• “使用偏移量”设置特征第一个氨基酸的编号；如果特征标记蛋白质的一部分，则此功能很有用。

下面的列表框包含来自 GenBank 格式导入的原始数据。

限制性内切酶

序列编辑器，酶设置选项卡。

序列编辑器，酶设置 (2)。

编辑 DNA 序列时，将提供两个带有限制性内切酶设置的选项卡。第一个选项卡与酶管理对话框相同。第二个选项卡与全局酶设置选项卡相同，但包含此序列的设置。默认情况下，其选项处于禁用状态，并且使用全局选项。通过激活此处的选项，将覆盖全局设置。

蛋白酶

序列编辑器，蛋白酶选项卡。

此选项卡包含可用的蛋白酶列表。已选中（已选中）蛋白酶的潜在切割位点将在序列中显示（不会在DNA 图中显示）。

可以添加新的蛋白酶，方法类似于以下示例

• 示例： “嗜热菌蛋白酶”
  • 此蛋白酶的序列： “!DE|AFILMV”
  • 说明：“不是 D 或 E”，“切割”，“然后是 A、F、I、L、M 或 V”
• 示例：脯氨酰内肽酶
  • 此蛋白酶的序列： “HKR,P|!P”
  • 说明： “H、K 或 R”，“然后是 P”，“切割”，“然后不是 P”