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结构生物化学/有机化学/生物化学重要有机反应

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生物化学中的有机反应

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生物化学与有机化学有着密切的关系,因为体内相当一部分反应是通过有机反应发生的。因此,从有机化学的角度来看一些重要的生物化学分子及其周围的反应非常重要。通过形成肽键,形成了长的多肽链,这些链可以折叠成蛋白质。

磷酸二酯键

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磷酸二酯键是通过酯化反应在两个戊糖和一个磷酸基团之间形成的键。它是通过强共价键形成的,其中连接在一起的磷酸基团带负电荷,因此它们排斥亲核物种,例如氢氧根离子。这使得磷酸二酯键能够抵抗水解攻击,与大多数其他酯不同。这些键是所有生命的重要组成部分,构成核酸(包括DNARNA)的主链。磷酸二酯键通过将 DNA 链的 3’ 端与另一条链的 5’ 端连接在一起,将糖的 3’ 端的羟基与另一条糖的 5’ 端的羟基连接起来。由于糖基中的游离 2’ 羟基,两个核糖核苷酸之间的磷酸二酯键可以通过碱性水解过程断裂。

磷酸二酯酶

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磷酸二酯酶是催化磷酸二酯键水解并修复 DNA 序列的酶。

DNA 聚合酶

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DNA 聚合酶 是帮助催化磷酸二酯键形成的酶,通过以下反应

(DNA)n + dNTP <=> (DNA)n+1 + PPi

在这个公式中,dNTP 是脱氧核苷酸,PPi 是焦磷酸根离子。

参考文献

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1. Berg, Jeremy M. (2007). Biochemistry, 6th Ed., Sara Tenney. ISBN0-7167-8724-5.

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