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GENtle/DNA

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GENtle 手册

关于 - 常见问题解答 - 设置 - DNA - 蛋白质 - PCR 和引物设计 - 测序 - 比对 - 计算器 - 虚拟凝胶 - 图像查看器 - 工具和对话框 - Web 界面 - 图表和绘图 - DNA 地图 - 序列地图 - 点图 - 限制酶识别

DNA 模块。

在 DNA 模块中,可以查看、编辑和注释 DNA 序列。它是 GENtle 的核心模块。DNA 模块的两个主要组件是 DNA 地图序列地图;请参阅有关详细信息。

打开和显示 DNA

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可以通过以下方式之一打开 DNA 序列

  • 从数据库中打开(见 数据库
  • 从文件中导入(见 导入
  • 手动输入(见 输入序列
  • 从另一个 DNA 模块创建

工具栏

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工具栏中可以调用一些功能和显示选项

  • 输入序列
  • 打开序列
  • 保存序列
  • 撤销
  • 剪切
  • 复制
  • 粘贴
  • 切换线性/环状
  • 显示/隐藏开放阅读框
  • 显示/隐藏特征
  • 显示/隐藏限制酶位点
  • 展开(=仅显示)地图
  • 切换编辑模式
  • 缩放

详细信息树

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详细信息树位于 DNA 地图的左侧,以结构化的方式显示当前序列的所有部分,包括特征和限制酶。可以通过双击来切换特征和限制酶的可见性,也可以通过上下文菜单进一步操作它们。

特殊菜单

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查看/显示 3'->5' 在序列地图中显示互补的 DNA 链
编辑/编辑 ORFs 更改开放阅读框显示的设置
编辑/显示可能的测序引物 打开 测序引物 对话框,该对话框可以将可能的测序引物添加为特征
编辑/删除测序引物 从序列中删除由上述功能生成的 所有 测序引物
编辑/自动注释序列 在当前序列中查找来自常见载体和其他数据库的特征
文件/打印地图 打印 DNA 地图
文件/打印序列 打印 序列地图
文件/打印报告 打印简要概述。见 打印
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