GENtle/PCR 和引物设计
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此模块允许设计引物和运行虚拟 PCR。 它可以从 DNA 模块通过 DNA 或 [../Sequence map#Context menu|sequence]] 图的上下文菜单启动，或者通过 工具/PCR 启动。 如果在 DNA 模块中选择了序列，则在 PCR 模块启动时会自动生成一个或多个引物。 这些仅仅是粗略的建议，默认情况下不会进行任何优化。
- 输入新的引物
- 打开引物/序列
- 打印 PCR
- 添加引物（您需要先打开或输入引物）
- 导出引物（生成其序列）
- 编辑模式
- 显示/隐藏特征
- 聚合酶运行长度
- 水平模式
聚合酶运行长度是指聚合酶在 PCR 延伸步骤中允许运行的核苷酸数量。 这通常以分钟为单位测量，但每种聚合酶的运行速度都不同，这就是这里提供核苷酸信息的原因。 该值最初是自动计算的，但可以手动更改。
引物列表（左上角）显示了此 PCR 中使用的所有引物，以及这些引物的某些关键属性。 选择其中一个引物将在右侧的框中显示更详细的信息（有关详细信息，请参见 此处）。 双击其中一个引物将在序列中标记并显示该引物。 可以通过 删除 按钮或 编辑 通过 编辑 按钮删除选定的引物。 也可以通过工具栏中的导出按钮导出选定的引物； 将为该引物生成新的序列。
- 注意：生成的序列不会自动存储在任何地方，需要手动保存！
- 注意：要添加引物，请使用工具栏中的添加按钮，或使用 选择作为新引物 上下文菜单。 仅仅编辑序列（见下文）仅用于编辑现有引物，不会创建新的引物！
该序列由以下几行组成
- 模板 DNA 的特征（可以在工具栏中关闭）
- 5' 引物
- 模板 DNA（5'→3'）
- 模板的氨基酸序列
- 模板 DNA（3'→5'）
- 3' 引物
- 所得 DNA 的限制性位点
- 所得 DNA（以绿色显示）
- 所得 DNA 的氨基酸序列
PCR 序列显示的一些特殊功能和属性
- 可以按照 此处 所述设置氨基酸读码框。 这将影响显示的两个氨基酸序列（模板和结果）。
- 只有两个引物序列可以编辑； 必须使用覆盖模式，并且禁用删除。
- 要删除核苷酸，请使用以下方式覆盖它空格.
- “.” 键会将匹配的模板核苷酸复制到引物序列中的该位置。
- 匹配的引物核苷酸（即与模板匹配的）以蓝色显示，错配以红色显示。
- 如果（不在编辑模式下）选择了引物序列的空跨度，则可以通过上下文菜单（选择作为新引物）将其变成新的引物。
- 可以通过上下文菜单在选择（在编辑模式下，光标的右侧或左侧）的左侧或右侧插入限制性位点的序列。 将出现用于所需酶的选择对话框。
- 可以通过上下文菜单引入 沉默突变。
最后，可以通过上下文菜单将所得 DNA 或氨基酸序列（绿色序列，将是 PCR 生成的序列）复制到剪贴板或生成新的序列（包含所有特征、限制性酶等）。