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结构生物化学/有机化学/有机官能团/氨基

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肽键形成的机制。

氨基由一个与两个氢原子键合的氮原子组成。氨基可以作为碱,因为它们可以从溶液中吸收一个 H+。氨基可以在碱性条件下以 1+ 的电荷被电离。含有氨基的有机化合物被称为“胺”;含有氨基和羧基的有机化合物被称为氨基酸,它们是蛋白质的组成部分。

胺可以很容易地形成氢键DNA碱基中的胺与附近的氮或氧原子形成氢键,并将两条链连接在一起。

例如,赖氨酸[[|]] 的氨基已被证明在基因调控中非常有用。特别是在组蛋白中赖氨酸的氨基被乙酰化时,它就无法像平时一样发挥作用。这是参与基因表达和复制的一个调节步骤。

氨基在生物化学中的另一个作用是。在蛋白酶的情况下,一种切割氨基酸的酶,当丝氨醇的羟基攻击氨基酸的羰基碳时,就会形成四面体过渡态。由于四面体过渡态带负电荷,正的 NH3+ 电荷有助于稳定过渡态,形成所谓的氧阴离子环。

胺由于其孤对电子也可以作为亲核试剂。这是肽键形成的基础,其中羰基碳在脱水反应中充当亲电试剂。

结构和物理性质

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胺的翻转

胺氮为 sp3 杂化,呈四面体形状。氮的非键合对电子就像一个取代基——氮周围的几何形状是四面体,键角都大约为 109°。与碳不同,sp3 杂化的氮不稳定,在室温下会发生快速翻转。它类似于雨伞从里到外翻转,类似于 SN2 反应中发生的构型翻转。

命名法

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遵循所有常用的 IUPAC 规则。在名称末尾添加后缀 –胺,并指定氨基的位置。对于 2° 和 3° 胺,选择最大的烷基取代基作为母体,氮上的其他烷基以 N- 作为前缀命名,表示它们连接到氮上。由于胺官能团在命名中优先级最低,因此它通常被命名为更具功能性分子的取代基。

胺的酸性

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胺的酸性远低于醇,pKa 约为 35,Keq = 10-35。必须使用非常强的碱,例如烷基锂,才能完全去质子化胺。

胺的碱性

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胺是常见的有机官能团中最碱性的,但仍然是相当弱的碱。质子化仅发生在非键合电子对上。胺的碱性直接取决于氮原子上的“电子密度”。感应效应和共振效应都可以改变氮原子的碱性。

N 上的杂化也会影响碱性。原子上的 s 特征增加会增加该原子的电负性,这有利于酸性,因此不利于碱性。因此,sp3 杂化的氮比 sp2 或 sp 杂化的氮更碱性。

胺的合成

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Gabriel 合成 1° 胺

1. 氰化物取代烷基卤化物,然后还原

2. LiAlH4 还原酰胺

LiAlH4 reduction of amides

3. 用叠氮化物取代,然后还原

4. Gabriel 合成 1° 胺

5. 还原胺化

Reductive amination

胺的红外光谱

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伯胺将在 3200 cm-1 – 3500 cm-1 处给出两个短而尖的相同峰

仲胺将在 3320 cm-1 处给出单个短而尖的峰

叔胺在任何区域都不会给出峰。

参考文献

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1. http://orgchem.colorado.edu/Spectroscopy/irtutor/aminesir.html

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